Обстановка в зоне проведения контртеррористической операции на Северном Кавказе продолжает оставаться напряженной, но в целом контролируется ФС и органами правопорядка. С 1 сентября в соответствии с указом Президента РФ контроль за управлением оперативного штаба контртеррористической операцией на Северном Кавказе от ФСБ перешел к МВД России. На посту руководителя оперативного штаба директора ФСБ Николая Патрушева сменил глава МВД РФ Борис Грызлов, а региональный штаб возглавил замминистра внутренних дел России Юрий Мальцев. Это стало возможным потому, что сейчас, по оценке Патрушева, ситуация изменилась: нет крупных бандформирований, а есть мелкие разрозненные группы, которые, тем не менее, еще способны проводить отдельные акции, прежде всего диверсионного характера. Кроме того, усилиями ФСБ удалось добиться значительных успехов в деле разобщения арабских наемников и коренных жителей Чечни, которые все меньше верят в бескорыстность «помощи» «братьев по вере» и все больше начинают понимать, что это авантюристы и проходимцы, желающие чужой кровью заработать себе состояние.
1 сентября истек последний срок, когда боевики, принявшие решение выйти из состава НВФ, могли рассчитывать на благосклонность закона и быть амнистированы. В этот день о своем выходе из НВФ заявили несколько боевиков. По их словам, большую помощь в принятии серьезного решения им оказали главы местных администраций и религиозные деятели, которые объяснили им смысл и процедуру амнистии. Правоохранительные органы Чечни продолжат рассмотрение заявлений боевиков о явке с повинной, хотя срок действия амнистии, как уже говорилось, истек 1 сентября. Как заявил прокурор Чечни Владимир Кравченко, такую возможность предоставляет статья 208 Уголовного кодекса РФ. «Если амнистию не продлят, то боевики в соответствии с этой статьей будут освобождаться от наказания. А в случае продления они будут амнистированы», — пояснил прокурор. Он напомнил, что с объявления 7 июня думского постановления об амнистии в Чечне амнистированы 145 участников незаконных вооруженных формирований. Среди амнистированных есть полевые командиры и так называемые бригадные генералы.
Как сообщили в пресс-службе главы администрации республики, «амнистией воспользовались бывшие полевые командиры Ризван Салбиханов, Муслим Ильясов, бывший начальник службы охраны и безопасности масхадовского „правительства“ Артур Ахмадов». Все амнистированные боевики внесены в банк данных прокуратуры и находятся в поле зрения правоохранительных органов. Исполняющий полномочия президента Чечни Анатолий Попов считает, что амнистия для боевиков сыграла положительную роль «как акт гуманизма государства по отношению к гражданам, волею судьбы поставленным вне закона». Амнистия дала многим чеченцам, не замешанным в тяжких преступлениях и готовым прекратить участие в противостоянии федеральным силам, реальный шанс включиться в восстановление республики, и многие им воспользовались. По мнению наблюдателей, это является наглядной демонстрацией понимания федеральным центром нынешнего состояния проблемы и дает надежду на выход из исторического тупика, в который завели чеченцев так называемые «ичкерийские» лидеры. Кандидат в президенты Чечни Ахмат Кадыров обратился в Госдуму с предложением продлить срок действия амнистии боевикам еще на три месяца. Его предложение связано с тем, что «не все боевики, которые готовы воспользоваться амнистией, успели это сделать, им надо дать еще время». Это предложение, кроме чеченских деятелей, поддержал министр РФ по национальной политике Владимир Зорин.
Как заявил журналистам председатель Госдумы Геннадий Селезнев, Дума рассмотрит вопрос о продлении срока действия амнистии в Чечне, если Федеральная служба безопасности посчитает это целесообразным и обратится в парламент с соответствующим предложением.
В Чеченской республике полным ходом идет подготовка к выборам президента. По результатам социологического опроса, проведенного журналистами газеты «Возрождение республики», в Чеченской республике прогнозируется высокая избирательная активность населения, сравнимая с активностью на прошедшем референдуме. Такое отношение к выборам является следствием заметных позитивных процессов, способствующих стабилизации социально-политической обстановки в республике. Большое количество кандидатов в президенты, открытость предвыборного процесса, объективность освещения предвыборной кампании в СМИ, соответствие политического избирательного процесса международным нормам — все это показатель становления основ демократии в республике.