Позднее цены на ракеты установятся и у заказчиков - Минобороны, Космического агентства, НПО "Энергия" - не хватит денег на реализацию многих программ.
На то время завод "Прогресс" своих договоров не отзывал, как это утверждало руководство НПО "Энергия", не требовал повышения цены. 50 млн. руб. за одну ракету типа "Союз" в тот период завод выставлял как для Минобороны, космического агентства, так и для НПО "Энергия". Желание руководства НПО "Энергия" получить ракеты по меньшей цене, зная механику ценообразования, мягко говоря, не корректно.
В 1992 г. Ю.Н.Коптев решением Российского космического агентства прекратил работы с орбитальным кораблем. К этому времени был полностью собран второй экземпляр орбитального корабля и завершалась сборка третьего корабля с улучшенными техническими характеристиками. Предписывалось законсервировать созданный задел.
Говорят, что кто-то выступал против сокращения работ по "Энергии"-"Бурану" на совещании у Ельцина, когда было принято решение об образовании Российского космического агентства. Какой можно было ожидать результат, нетрудно представить. Для решения в том числе и этого вопроса и создавалось "агентство".
Следуя логике событий и планов прекращения работ по ракетам сверхтяжелого класса, руководством НПО "Энергия" 25 мая 1993 г., как оповестила печать, было "представлено" решение о прекращении работ по "Бурану" и "Энергии" Совету главных конструкторов.
Совет главных конструкторов принял это решение с витиеватым объяснением: "Считать невозможным продолжение работ с орбитальным кораблем "Буран" и ракетой-носителем "Энергия" в связи с недостаточным финансированием, сосредоточиться на разработке "Энергии-М".
Значит, не всесилен Совет "главных", значит, есть силы выше его возможностей, а может быть, это - действительно желание "главных"? Такого решения при Сергее Павловиче Королеве не принималось бы.
Когда закрывалась драматическая тема освоения Луны и ликвидировалась разработка ракеты Н-1, создавалась государственная комиссия, на основе работы которой вышло Постановление правительства. И это по ракете так и не пролетевшей полное время ни разу. Ракету-носитель "Энергия", добросовестно отработавшую свою предначертанную судьбой программу, задушили ее же родители - конструкторское бюро "Энергия". Речь не идет о коллективе. Коллектив все сделал для ее рождения. Руководство же "писало", "говорило" - но это все ведь из разряда произведенного навоза. Вспаханной земли нет - остался молчаливый археологический памятник на Байконуре. "Энергия" даже полететь не сможет - надо начинать все сначала.
В апреле 1993 г. президент России направил Назарбаеву письмо, в котором выразил озабоченность судьбой космодрома Байконур. Президент Казахстана ответил официальным письмом, в котором констатировал, что космодром действительно находится в тяжелом положении, серьезно страдает его производственная инфраструктура и социальная сфера. В то время как космодром был и остается особорежимным военным объектом, где безраздельно господствуют явно избыточные военные формирования.
Выход из создавшейся ситуации президент Казахстана видел в создании международной космической компании Байконур, учредителями и участниками которой на первом этапе стали бы правительства России, Казахстана и Украины, а также их предприятия оборонного комплекса. Предполагалось, что на втором этапе присоединятся правительственные и негосударственные структуры других стран.
В заключение своего послания Б.Н.Ельцину Н.А.Назарбаев предложил провести встречу президентов России, Казахстана и Украины на Байконуре и подписать соглашение о создании международной космической компании.
Встреча президентов по проблемам Байконура по разным причинам не состоялась, сроки дважды переносились. Однако в августе этого же года во время поездки Назарбаева в Москву оба президента все же смогли обсудить эту проблему. Идея создания международной компании была поддержана. В августе Б.Н.Ельцин подписал поручение министру обороны РФ Грачеву, руководителю Российского космического агентства Коптеву и председателю российского комитета по оборонной промышленности Глухих в месячный срок дать свои предложения по созданию международных структур на базе космодрома. В этот же день Н.А.Назарбаев поручил вице-президенту Абильсиитову, заместителю председателя казахстанского Совета безопасности Жукееву, министру обороны Нурмагамбетову и Национальному аэрокосмическому агентству осуществить практическую подготовку соглашения трех государств о Байконуре.