Стебель у помидора округлый, может быть полегающим или прямостоячим, от 30 см до 2 м. В начале роста он очень хрупкий, но затем, к периоду плодоношения, значительно твердеет. В пазухах листьев у стебля формируются боковые побеги — пасынки. Наиболее сильные из них образуются под соцветием.
В зависимости от особенностей роста и ветвления побегов все томаты подразделяют на две группы: индетерминантные, то есть с неограниченным ростом, и детерминантные, то есть с ограниченным ростом.
Ветвление побегов у обеих групп растений симподиальное, то есть после образования первого соцветия над 6-11-м листом рост продолжается за счет бокового побега, который появляется из пазухи самого верхнего листа. При росте этого побега наблюдается смещение соцветия в сторону, а лист, в пазухе которого он заложился, выносится выше соцветия. После образования у побега трех листьев формируется соцветие и его рост прекращается. Из пазухи листа, расположенного под этим соцветием, опять появляется побег продолжения с тремя листьями и т.д. Таким образом рост растения продолжается непрерывно (индетерминантный тип роста). На практике совокупность побегов, образующихся в процессе такого ветвления, принято называть основным, главным стеблем.
Листья у помидора очередные, неравномерно перисто-рассеченные, состоящие из долей, долек и долечек или только из простых крупных долей. Поверхность листьев может быть гладкой или различной степени гофрированности. В то время как размер и окраска листьев могут меняться под влиянием условий выращивания, тип листа — обыкновенный, промежуточный или картофельный — является стабильным сортовым признаком.
Цветки помидора обоеполые, самоопыляющиеся, собраны в соцветие-завиток, которое обычно называют цветочной или плодовой кистью. Различают соцветие простое, промежуточное, сложное и очень сложное.
Первое соцветие уже начинает расти и развиваться, когда у растения появляются 2-3-й лист — в зависимости от сорта и внешних условий, это происходит примерно на 15-20-й день после появления всходов. В этот период необходимо строго соблюдать режим выращивания рассады, потому что тип соцветия в значительной степени зависит от внешних условий. Резкое изменение температуры, освещенности, минерального питания приводит к отклонению от нормального развития соцветия. Период от всходов до начала цветения у помидора обычно составляет 50-60 дней. Цветение происходит постепенно, снизу вверх.
Плоды помидора — мясистые ягоды различной формы, массы и окраски. В зависимости от массы их разделяют на мелкие (менее 50 г), средние (50-120 г) и крупные (свыше 120 г) плоды. У некоторых сортов бывают плоды массой 600-800 г. По форме плоды помидора могут быть плоские, округлые, овальные, грушевидные, удлиненно-цилиндрические, конусовидные, сливовидные, вишневидные, смородиновидные. Поверхность — гладкая или ребристая. В зависимости от количества камер внутри плода они могут быть малокамерные (2-3), среднекамерные (4-5) и многокамерные (более 6), причем последние, как правило, более ребристые. Если камер в плоде меньше 4-5, то они расположены правильно, симметрично. Неправильное расположение камер присуще более крупным плодам, более мясистым, с меньшим количеством семян.
Незрелые плоды имеют окраску от темно-зеленых до зеленовато-белесых. Окраска зрелых плодов может быть разнообразной — от темно-красной до розовой и от фиолетово-коричневой до лимонной.
Семена помидора треугольно-почковидной или обратнояйцевидной формы со сбегом к основанию, сплюснутые, густоопушенные, серовато-желтой окраски. В 1 г содержится примерно 240-350 штук семян. В зависимости от условий хранения всхожесть семян сохраняется в течение 8-10 лет и более.
Говоря о биологических особенностях помидора, нельзя не затронуть вопрос со статусом растения. Выше, как вы могли заметить, уже не раз для определения плодов помидора звучало слово «ягода». Так что же собой представляет помидор — это фрукт или овощ?
У ботаников в этом вопросе никаких сомнений нет — плоды помидора не что иное, как завязь цветущего растения (с семенами). То есть ботанически это, безусловно, фрукт, а точнее, ягода. Но как определить плоды помидора с точки зрения кулинарной? Ведь если в качестве критерия взять сладость, обычно характерную для фруктов, то они совсем не похожи ни на какой фрукт или ягоду. И подают их вовсе не на десерт, как фрукты, а делают из них салаты, закуски или используют в приготовлении основных блюд, а потому получается, что с точки зрения кулинарной помидор логичнее отнести к овощам.