Характеризуя португальскую флору, нельзя не отметить множество видов растительности, завезённых сюда с различных континентов. Благодаря мягкости климата в наиболее защищённых местах здесь прижились различные экзотические растения: пальмы с северного побережья Африки, из Калифорнии и Китая, кактусы и агавы из Австралии, перцовые деревья и бугенвиппеи из Южной Америки. Герани, алоэ, мезембриантемумы и другие представители растительного мира Южной Африки соседствуют с местными апельсинными и лимонными деревьями, розами, красными гвоздиками и другими известными садовыми растениями. Особенно это характерно для окрестностей Лиссабона, где смешение северного и южного климатов обусловило двоякий вид растительности. В садах Южной Эстремадуры наряду с такими повсеместно распространёнными культурами, как виноград и цитрусовые, можно встретить финиковые пальмы, мексиканскую агаву, камелии, индийскую смоковницу и другие экзотические растения.
В отличие от обильной, пышной флоры, покрывающей разнообразный гористый ландшафт северной части страны и её островов, растительность обширных равнин и нагорий Южной Португалии, состоящая главным образом из низких, кряжистых пробковых дубов, оливковых деревьев и кустарников, не оживляет скучного и однообразного пейзажа. Равнины Алентежу в жаркий и сухой период лета своей монотонностью и пожухлой растительностью напоминают африканские пейзажи. На более высоких холмах, почти сплошь состоящих из слюдяных сланцев, природа кажется даже мрачной.
Алгарви с её масличными рощами, финиковыми пальмами, кактусами напоминает тропические страны. Морской бриз умеряет здесь летнюю жару, а зимой она защищена от северных и северо-восточных студёных ветров горной цепью Моншике.
Растительность островов, расположенных в Атлантическом океане, носит субтропический характер. На Азорском архипелаге распространены вечнозелёные леса и кустарники, много одичавших завезённых извне растений. Возделываются бананы, цитрусовые, абрикосы, виноград и дреки Для архипелага Мадейра характерна субтропическая саванна, в горах — лавровые леса. Выращиваются бананы, кукуруза, сахарный тростник, а также виноград, из которого производится вино, известное под названием «мадера». Большое распространение на Мадейре получило цветоводство. Цветы встречают приезжего повсюду: в холле гостиницы, на открытой веранде кафе, на площадях, а также на многочисленных цветочных базарах. Среди их богатого разнообразия орхидеи занимают особое место. Привезённая из Бразилии орхидея стала настоящей «королёвой острова» с его благодатным климатом. Её разведение даёт работу тысячам семей.
Животный мир Португалии — смесь центральноевропейских и североафриканских видов. Крупные млекопитающие здесь, как и на всем Пиренейском полуострове, представлены весьма скудно. Повсеместно распространены лиса, дикий кролик, иберийский заяц. Дикие козы, кабаны, олени обитают главным образом в горах. В труднодоступных районах Серра-да-Эштрелы сохранились волки. В кустарниковых зарослях Алентежу обитают рыси. В южной части страны встречаются представители североафриканской фауны — генетта, алжирский ёж.
Наиболее разнообразна в Португалии фауна птиц, мигрирующих из Центральной Европы и Северной Африки. Многие из них прилетают сюда на зимовку, а также останавливаются во время перелётов с севера на юг и обратно. Однако очень немногие виды птиц обитают в стране в течение всего года. К эндемичным, то есть встречающимся только на данной территории, видам относятся голубая сорока, своеобразная разновидность кукушки, сова, красная куропатка. Они распространены по всей территории. Грифы, пустельги, орлы гнездятся на труднодоступных высоких скалах. Аисты (охраняемые специальным законодательством), бекасы, перепела встречаются по всему побережью.