За второй президентский срок сменилось пять глав администрации президента.
Сразу после выборов 1996 года ее возглавил А. Б. Чубайс. Перед ним предвыборный штаб вначале возглавлял О. Н. Сосковец. Затем, после первого тура, возникли острые разногласия, и дело довел до конца уже Чубайс. Тогда же в предвыборном штабе впервые появилась Т. Б. Дьяченко. И именно в тот период начался новый набор в команду президента. Изменился и состав администрации, в нее вошли те, кто участвовал в президентской кампании и активно работал в предвыборном штабе. То есть можно сказать, что была применена западная схема прихода к власти президентской команды.
Структура администрации была преобразована. Раньше основная ставка делалась на группу помощников, которые непосредственно работали на президента. Чубайс предложил вообще отказаться от института помощников. Приостановил свою работу и Президентский совет. Весь центр фокусировался вокруг главы администрации и его заместителей, которые отвечали за конкретные направления. Чубайс — хороший организатор, ему удалось быстро выстроить четкую вертикаль в административной системе. Но он недолго возглавлял администрацию президента. Его заменил Валентин Юмашев, назначение которого стало неожиданностью: прежде он работал над книгами Бориса Николаевича. Правда, Юмашев на протяжении длительного времени был постоянно с нами, хорошо знал нашу кухню и оказался неплохим администратором. Вследствие проведенной им реорганизации я стал заместителем руководителя аппарата президента и в этом качестве пребывал до 1 января 2000 года. Помимо протокола я вел оргуправление и отвечал за связи с административно-хозяйственным управлением и управлением делами. Несколько позже я стал вести еще и график президента. В структуре аппарата в этот период насчитывалось девять заместителей главы администрации.
Вошло в практику, что Б. Н. Ельцин осуществлял кадровые перестановки сразу после Послания Федеральному собранию, это было своеобразным подведением итогов работы власти за прошедший год и представлением программы действий на следующий. В этом заключалась определенная логика: под новые задачи — новая команда.
В. Б. Юмашева сменил Н. Н. Бордюжа, который позднее возглавил Совет безопасности. А на его место был назначен А. С. Волошин, который до этого работал в администрации правительства.
Сегодня многие эксперты, признавая эффективность подобных шагов первого президента, отмечают, что они совершенно не свойственны Владимиру Владимировичу Путину. Борис Николаевич более резко решал кадровые вопросы. Однако время, когда десятками меняли министров и вице-премьеров, ушло в прошлое. Сегодня ротация есть, но она естественна.
Трудно сказать, была ли истинная дружба между теми, кто нес крест государственной кремлевской службы в эпоху Ельцина. Время показало, что многие были неискренни в ее проявлениях. Люди часто дружат не с тобой, а с твоим креслом, положением в Кремле. И стоит положению измениться, как улыбки, объятия и телефонные звонки исчезают и наступает тишина.
В прессе часто обсуждают вопросы, связанные якобы с наличием в аппарате президента Путина двух команд: старой ельцинской и новой питерской. Мне эта проблема представляется надуманной. В. В. Путин пришел на работу в Кремль не 31 декабря 1999 года, до этого он был премьер-министром, то есть членом команды президента. Ни прежде, ни потом он никогда не хлопал дверью и не делал резких заявлений. Сегодня, став капитаном, зная положительный опыт и просчеты своей команды, он сам решает, кого выпускать на поле, а также кто и как справляется со своей работой. Сегодня в администрации служат те, с кем В. В. Путин начинал свою работу в качестве заместителя главы администрации, и те, кто пришел в его команду во время предвыборной президентской кампании, и новые люди, появление которых продиктовано необходимостью.