С той поры Николаю Ивановичу Рыжкову и его правительству вместе со всей страной пришлось пройти длительный, нелегкий путь к реальной стадии развертывания рыночных преобразований. На это ушли годы. Дискуссии о планах таких преобразований достигли своего апогея летом 1989-го.
Такими конкретными конкурировавшими планами была «российская» программа «500 дней», которую поддерживал Б. Н. Ельцин, и «союзная» правительственная программа, разработку которой курировал Н. И. Рыжков. За этими программами скрывалось принципиально различное видение страны. Причем программу Рыжкова демократическая оппозиция называла «консервативной», «ведущей к рынку окольными путями».
Переговоры сторонников этих альтернативных проектов перехода к рынку особенно обострились в конце августа. Николай Иванович вспоминал: «Два дня заседали, точнее — бились. 30 и 31 августа. Когда я наконец понял, что все это только начало раскола не просто «верхов», но и общества в целом, то сразу же предложил: давайте, мол, не станем рассматривать на Верховном Совете две программы перехода к рынку, давайте отложим вопрос, еще и еще раз попробуем поработать над ним вместе, возглавляемые этаким третейским судьей — президентом».
По утверждению Рыжкова, Горбачев вроде бы против этого не возражал. Однако 3 сентября программа «500 дней» была роздана депутатам российского парламента. Через неделю она была обсуждена в Верховном Совете РСФСР и затем принята им. Готовилось и принятие ее Верховным Советом СССР (был подготовлен проект постановления). Тогда Рыжков пригрозил отставкой в случае такого оборота событий.
В конце концов Горбачев пришел к компромиссу, представив общую программу перехода к рынку как президентскую. Но, но мнению Рыжкова, «если там и осталось что-то от правительственной программы, так только общие слова».
Борьба вокруг этой программы, острейшие перипетии ее обсуждения сопровождались широкой кампанией критики в адрес Рыжкова и требований отправить его в отставку. Кстати, и сам Николай Иванович на одной из пресс-конференций заявил журналистам о своей возможной отставке. Тем не менее в отставку он не ушел, продолжая вести ожесточенную полемику о путях перехода к рынку.
Впоследствии он признавался: «Став премьером, я пи за что, ни за какие дела не получал медали — ни в прямом смысле, пи в переносном. Зато шишек навешали — места на голове не хватало».
К тому же, по характеристике «Литературной газеты», Николай Иванович — «из тех людей, которые первыми подставляют плечо под общую ношу и, как бы тяжко, больно ни было, несут до конца, ни на кого не переваливая свою долю нагрузки».
Перестроечные страсти имели для Николая Ивановича драматический финал. В дни работы очередного Съезда народных депутатов СССР с ним произошло несчастье: в ночь на 26 декабря 1990 года врачи констатировали инфаркт.
27 декабря в «Правде» появилось такое сообщение: «Вчера утреннее заседание Съезда началось на грустной ноте. М. С. Горбачев сообщил народным депутатам страны, что накануне ночью у Николая Ивановича случился сердечный приступ — инфаркт. Он находится в больнице. На данный момент угрозы жизни нет. Пожелаем ему выздоровления, сказал президент СССР».
Депутаты приняли это сообщение близко к сердцу. По предложению академика В. Гольданского было решено направить Н. И. Рыжкову следующую телеграмму: «Уважаемый Николай Иванович! С огорчением и тревогой узнали о вашем заболевании. От души желаем вам скорейшего и полного выздоровления. Участники четвертого Съезда народных депутатов СССР».
В субботу 31 декабря в «Правде» появилась информация следующего содержания: «Как сообщили корреспондентам ТАСС в министерстве здравоохранения СССР, за истекшие сутки в состоянии здоровья председателя Совета Министров СССР Н. И. Рыжкова каких-либо негативных изменений не произошло. Уже сообщалось, что в пятницу президент СССР посетил Центральную клиническую больницу, где находится на излечении советский премьер. М. С. Горбачев беседовал с врачами о состоянии здоровья Н. И. Рыжкова и просил передать ему пожелания скорейшего выздоровления».
Впоследствии, 12 января 1991 года, Горбачев посетил в больнице уже самого Рыжкова, между ними «состоялась беседа о текущих делах, которыми живет страна, общество». Через девять дней Николай Иванович выписался из больницы и был переведен в подмосковный санаторий для продолжения лечения. Однако выписался он, уже будучи бывшим Председателем Совета Министров СССР.
За время пребывания Рыжкова в больнице Горбачев упразднил не только его пост председателя Совмина, но и сам Совет Министров. 14 января 1991 года был создан Кабинет министров СССР во главе с В. С. Павловым. Так Николай Иванович, выражаясь его собственными словами, «через больницу» попал в отставку.