Архиепископа Петра стали вызывать на допросы в ОГПУ. Осенью 1926 года должен был состояться под руководством Тучкова съезд обновленцев, и в связи с этим ОГПУ проводило обыски у православных архиереев.
28 ноября в первый день Рождественского поста поздно ночью к нему явились сотрудники ОГПУ для произведения обыска и ареста. Вместе с архиепископом Петром был арестован архимандрит Иннокентий и другие близкие ему люди, большей частью рабочие. В конце марта следствие было закончено. 26 марта 1927 года Особое Совещание при Коллегии ОГПУ приговорило архиепископа Петра к десяти годам заключения в концлагерь.
В свое время блаженная Паша Саровская говорила владыке, что он будет заключен в тюрьму трижды. Три тюрьмы уже были позади, и он стал думать — четвертой не будет. Незадолго до ареста дивеевская блаженная Мария Ивановна прислала к нему сказать: «Пусть владыка сидит тихо...»
Весной 1927 года архиепископ Петр прибыл в Соловецкий концлагерь. Здесь он работал сторожем, затем счетоводом на продовольственном складе.
Из Соловков владыка старался писать как можно чаще, насколько позволяли условия заключения, почти в каждом письме поминая воронежскую блаженную Феоктисту Михайловну, которую он очень почитал, прося ее святых молитв.
В январе 1929 года архиепископ Петр заболел тифом и был увезен в больницу, в бывший Голгофо-Распятский скит.
В одной палате с архиепископом лежал ветеринарный врач, его духовный сын. В день смерти архиепископа Петра, 7 февраля, в четыре часа утра он услыхал шум, как бы от влетевшей стаи птиц. Он открыл глаза и увидел святую великомученицу Варвару со многими девами, из которых он узнал святых мучениц Анисию и Ирину. Великомученица Варвара подошла к постели владыки и причастила его Святых Христовых Таин.
У находившейся в заключении на Анзере монахини Арсении хранились в то время вещи высокопреосвященного Петра, 7 февраля ей сообщили, что кризис миновал и в болезни наступил перелом.
Монахиня Арсения послала владыке свитку, которую она хранила, чтобы в ней похоронить духовного отца. Когда ему подали свитку, он сказал: «Как к делу она послала ее. Теперь оботрите меня губкой». В тот же день в семь часов вечера владыка скончался.
Погребение было назначено на воскресенье 10 февраля. Один из священников пошел к начальнику 6-го отделения просить разрешения устроить торжественные похороны почившему и поставить на могиле крест. До этого из кремля прислали мантию и малый омофор. В мастерской хозяйственной части заказали сделать гроб и крест. Разрешение на участие в похоронах получили три священника и двое мирян...
Отпевание владыки было совершено в канцелярии хозяйственной части, а затем гроб и крест отвезли на Голгофу. Четыре человека копали в это время отдельную могилу напротив алтаря Воскресенского храма.
На отпевание собралось около двадцати человек. После отпевания останки священномученика опустили в могилу, поставили на ней крест и сделали надпись. Один из хоронивших архиепископа священников рассказывал впоследствии, что когда зарыли могилу, над ней стал виден столп света и в нем явился владыка и благословил их.
9 июня 1999 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II благословил провести работы по определению места захоронения и обретению мощей священномученика Петра. После продолжавшихся в течение трех дней работ 17 июня 1999 года мощи священномученика Петра были обретены и ныне находятся в Спасо-Преображенском Соловецком. Ставропигиальном мужском монастыре.
Освященный Архиерейский Собор 13-20 августа 2000 года канонизировал священномученика Петра (Зверева) в лике святых Русской Православной Церкви.
Память священномученика архиепископа Петра (Зверева) совершается в день его кончины 25 января/7 февраля, в день обретения мощей 4/17 июня, а также в день празднования Собора новомучеников и исповедников Российских. (по книге игумена Дамаскина (Орловского) «Житие священномученника Петра (Зверева), архиепископа Воронежского (1878-1929 гг.)»)
Молитва
О досточудне Петре, священномучениче славный, умоли Творца всяческих даровати нам силу и крепость, не устрашившеся страха лукаваго, исповедати твердо Христа, да Его милосердием части злых избавимся в день страшный воздаяния и в радость вечную вселимся, славя о всем Вседержителя Бога и твое благодатное предстательство во веки веков. Аминь.
56
В тринадцатом веке, после смерти святого благоверного князя Александра Невского его младшему сыну Даниилу досталось удельное княжество с городком Москвой. (В то время к Московскому княжеству относилось и село Вохна (ныне это город Павловский Посад) с окрестными землями. По преданию, как-то князь Даниил заблудился в дремучем лесу во время охоты. Потеряв надежду самому найти дорогу, князь обратился с молитвой к Господу, просил молитвенной помощи святителя Тихону Амафунтскому, в день памяти которого он заблудился, при этом пообещал построить храм в том месте, где посчастливится ему выйти из леса.