Всеобщее благоговейное уважение верующих к апостолу Иакову особенно сильно выразилось на апостольском соборе, бывшем в Иерусалиме около 60 года после Р. Х. для решения вопроса: должно ли обращающихся к Церкви из язычников принуждать к обрезанию и соблюдению ветхозаветного обрядового закона. Апостол Иаков председательствовал на том соборе и после долгих споров и рассуждений вслед за выступлением апостола Петра и рассказа апостолов Павла и Варнавы об успехах их проповеди среди язычников заключил соборные рассуждения речью, в которой предложил свое суждение. Он полагал «не затруднять обращающихся к Богу язычников», а написать им, чтобы они воздерживались от оскверненного идолами, от блуда, удавленины и крови, и чтобы не делали другим того, чего не хотят себе» (Деян. 15, 13–20). Это суждение всеми уважаемого праведного Иакова принято было всем собором и утверждено явным для всех изволением Святого Духа (28 ст.).
Около того же времени апостол Павел, желая проверить чистоту своего учения, обратился к апостолам Петру, Иоанну и Иакову, которых почитал столпами Церкви Христовой. Первым из них он ставил Иакова (Гал. 2, 10), – и те признали в нем великое достоинство учителя языков. С таким глубоким уважением относился апостол Павел к святому Иакову и впоследствии. Когда перед первым заключением своим он прибыл в Иерусалим, то первым долгом счел отправиться к Иакову и рассказал ему как столпу Церкви Христовой и предстоятелю старейшей Церкви Иерусалимской о том, что сотворил Бог у язычников его служением (Деян. 21, 18–19).
Весь народ любил Иакова из-за его святости. Многие из иудейских старейшин уверовали в учение, которое он проповедовал, и все наслаждались, слушая его. Множество людей приходило к апостолу. Одни – желая услышать его поучение, другие – коснуться края его одежды. В это время архиереем Иудейским сделался Анания (был упорным врагом христиан и вообще человеком дерзким, жестоким и несправедливым и принадлежал к секте саддукеев). Видя, что весь народ внимательно слушает учение Иакова и многие обращаются ко Христу, Анания с книжниками и фарисеями, из зависти к святому, гневались на него и, затаив злобу, стали придумывать, как бы убить его. Их план был таков: просить апостола, чтобы он своим поучением отвратил людей от Христа; при этом они решили, если он не согласится сделать это, убить его.
Между тем приближался праздник Пасхи, и множество народа стекалось в Иерусалим, чтобы там встретить праздник. Фарисеи и книжники сказали святому Иакову встать на высокой крыше храма и убедить людей своим авторитетом, что они заблуждаются, считая Иисуса Сыном Божьим, и уговорить их отказаться от ложного своего мнения.
Святой, напротив, сказал громким голосом: «Что спрашиваете вы меня о Сыне Человеческом, Который добровольно потерпел страдание, был распят, погребен и на третий день воскрес из мертвых? Он ныне сидит на небесах одесную Вышняго и снова приидет на облаках небесных судить живых и мертвых». Слыша такое свидетельство Иакова о Иисусе Христе, народ весьма возрадовался, и все в один голос воскликнули: «Слава Богу! Осанна Сыну Давидову!»
Фарисеи же и книжники, увидев тщетность своих стараний, сбросили Иакова с крыши. Упав с такой высоты, Иаков сильно разбился. Еле живой, праведник стал на колени и, подняв руки к небу, молился: «Господи! отпусти им грех сей, ибо они не ведают, что творят». Его противники стали бросать в него камни. Один человек из рода Рихавова воскликнул: «Остановитесь, что вы делаете? праведник молится за вас, а вы побиваете его камнями».
В это время один человек с белильным вальком в руках бросился на святого и с такой силой ударил его по голове, что весь мозг вытек на землю. В таком мучении Иаков предал дух свой Господу.
Святое тело его погребено было там же около храма, причем верующие горько оплакивали праведника. В течение 30 лет святой был епископом Иерусалимской церкви и на 66 году жизни пострадал за Христа, Которому верно служил всю жизнь. Мученическая кончина апостола Иакова последовала около 63 года после Р. Х. Над его могилой подле храма и доселе стоит памятник. По свидетельству Оригена, церковного писателя III века, смерть Иакова праведного, случившаяся незадолго до Иудейской войны, произвела такое впечатление на иудеев, что следовавшие за ней бедствия войны и разрушение Иерусалима почитались ими наказанием Божьим за убийство святого. В XI веке святой Феофан песнопевец, архиепископ Никейский, блаженный Георгий Никомидийский и впоследствии Византий написали многие песнопения в честь апостола Иакова, которые и теперь поются в день его памяти.
Мощи праведного Иакова были в Константинополе при русском паломнике Антонии в 1200 году в приделе