Поклонившись до земли, Алексей попросил настоятеля принять его в число братии. Отец Исаия, испытывая его, ответил, что живут они бедно, послушания у них тяжелые. Алексей обещал безропотно переносить все трудности. Тогда отец Исаия передал его паспорт отцу Иоанну и велел зачислить его в списки братии.
Жизнь глинских иноков проходила в послушаниях, посте и молитве. В это время в обители действовал устав, принятый еще преподобным Филаретом. Повседневное утреннее богослужение начиналось в полночь. После утренних молитв и полунощницы совершалась утреня, которая в простые дни продолжалась три часа. После кафизм и по 6-й песни канона читались святоотеческие поучения и Пролог. По окончании утрени бывала лития по усопшим. В шесть часов совершался повседневный акафист Богородице, в восемь — Божественная литургия. Вечерня начиналась в шестнадцать часов, по окончании которой — лития по усопшим, после чего расходились по кельям. В восемнадцать часов читались повечерие с тремя канонами, вечерние молитвы и вседневный помянник. Затем все с пением стихиры «Иже крестом ограждаеми» прикладывались ко кресту, вынесенному из алтаря, и расходились по кельям. В воскресные и праздничные дни ночью совершалось бдение, продолжавшееся четыре-пять часов. Кроме того, братия исполняли и келейное правило, назначенное старцем. По уставу у братии не было никакой собственности, братия сама выполняла все черные работы. Женщинам вход был воспрещен всюду, кроме храмов. С родственниками можно было видеться только в гостинице по благословению настоятеля, в кельях не разрешалось принимать никого. Послушания были разнообразны: клирос, чтение Псалтири, пономарство, бондарня, портняжная, гостиница, трапезная.
Первоначально Алексию определили послушание в гостиничном корпусе, как было принято в Глинской пустыни для вновь поступивших.
К началу XX века обитель ежегодно принимала до шестидесяти тысяч человек, размещавшихся в гостинице. Здесь трудилось около двадцати насельников, из них двое-трое — послушники, находившиеся на предварительном испытании. Обязанности гостинника были определены в 23-й главе устава «О гостеприимстве»: он должен был устроить прибывших богомольцев, определить им порядок питания, пребывания в обители; брать деньги с приезжающих гостиннику запрещалось.
По общим правилам послушание в гостинице продолжалось шесть месяцев, затем новоначальному давали подрясник с поясом, скуфью и четки. Алексий нес это послушание три месяца, после чего ему назначили послушание в прачечной и поручили его под руководство иеромонаха Аристоклия (Ветра). С этого времени Алексий включается в собственно монастырскую жизнь, начинает приобщаться к традиции старчества.
Старцем, по разъяснению святителя Игнатия (Брянчанинова), называется в монастырях инок, руководствующий и наставляющий других иноков.
Духовное руководство берет свое начало в первохристианские времена. С появлением в III веке монашества, которое организует и углубляет духовную жизнь, старчество также принимает более или менее организованный вид, формируется как особое аскетическое делание в комплексе всего духовного подвига монаха и как особый институт в монашестве. На Русь старчество приходит, видимо, в XI веке вместе с монашеством. Оно переживает все подъемы и спады русского монашества, ярко проявляется в традиции преподобного Нила Сорского, затухает после секуляризации XVII века. В XIX столетии, при его внедрении учениками преподобного Паисия (Величковского), старчество многими воспринимается как опасное нововведение и даже ересь, отчего немало страдают его представители (например, преподобный Лев Оптинский), которым приходится заниматься письменной апологией старчества.
В Глинской пустыни старчество внедряется глубоко и основательно и даже включается в устав. Согласно ему, в повиновение искусному старцу поручался всякий новый насельник монастыря. Он должен был ежедневно приходить к старцу и очищать совесть подробным исповеданием своих поступков, желаний и помыслов, советоваться обо всем, ничего не предпринимать без благословения старца и тем навыкать послушанию, получать разрешение всех своих недоумений, очищать сердце от страстей.