Действительно в евангелии Иоанна можно обнаружить многие идеи, взгляды и выражения, которые содержатся и в кумранских текстах. Так, например, в Уставе общины можно прочесть следующие слова: «Его знанием все совершается и все сущее он утверждает своей мыслью, и без него оно не сделается». Нечто подобное написано в евангелии Иоанна: «Все через него начало быть, и без него ничто не начало быть, что начало быть».
Это сходство взглядов и выражений не должно привести к отрицанию одновременного сильного влияния на евангелиста Иоанна эллинистических идей. Кстати сказать, некоторое влияние этих идей можно установить в самих кумранских текстах.
Наличие многочисленных точек соприкосновения между кумранскими текстами и евангелием Иоанна побудило некоторых ученых пересмотреть традиционную точку зрения относительно времени возникновения и характера упомянутого евангелия. До открытия рукописей в пещерах Кумрана в исторической науке господствовало мнение о том, что евангелие Иоанна более других подверглось влиянию эллинистических идей, что оно является наиболее поздним по времени своего составления. На основании новых находок некоторые исследователи пришли к прямо противоположным выводам. Они утверждают, что основные идеи, содержащиеся в евангелии Иоанна, сформировались в Палестине в среде иудейских сектантов. Соответственно этому они относят его к числу наиболее ранних новозаветных произведений. Такой вывод представляется нам весьма правдоподобным. Нельзя, однако, забывать, что по ряду вопросов евангелие Иоанна и кумранские тексты далеко расходятся между собою. Это является следствием того, что автор евангелия находился под влиянием не только иудаизма, но и других религиозных и философских систем.
Между ранними христианами и кумранитами были не только параллели и сходные черты, но и достойные внимания отличия. Если кумранская община носила замкнутый характер и все делала для того, чтобы скрыть от окружающего мира тайны своего учения, то раннехристианские общины, наоборот, стремились как можно шире распространить свое вероучение. Кумранская секта не смогла преодолеть свою национальную ограниченность. Она не проповедовала своих идей за пределами еврейского народа. Христианство же носило универсальный характер, ему чужда была национально-религиозная замкнутость. Оно обращалось ко всем народам и племенам без различия. Порвав с традиционными национальными религиями и общей им всем обрядностью, христианство, по словам Энгельса, «само становится первой возможной мировой религией».
Одним из бросающихся в глаза различий между кумранитами и ранними христианами является их неодинаковое отношение к женщинам. Как выше было отмечено, на данной стадии изучения текстов Мертвого моря остается еще нерешенным вопрос о пребывании женщин в составе кумранской секты. Если даже допустить, что она включала в свой состав семейных людей, то и в этом случае женщины играли в ее религиозной жизни незначительную роль. Наоборот, в раннехристианских общинах было много женщин, которые к тому же активно участвовали в распространении новой религии. В Послании к галатам написано: «Нет мужского пола, ни женского, ибо все вы одно во Христе Иисусе».
Устав общины требует проявлять ненависть к «сынам тьмы», т. е. ко всем лицам, не принадлежащим к кумранской секте. Напротив, в Новом завете содержатся призывы любить не только приверженцев христианской религии, но и всех людей, даже врагов. Так, в евангелии Матфея написано: «Любите врагов ваших, благословляйте проклинающих вас, благотворите ненавидящим вас и молитесь за обижающих вас и гонящих вас».
Имеются расхождения между ранними христианами и кумранскими сектантами и по вопросу о вере в мессию. Кумраниты жили в ожидании прихода мессии. Христиане же были убеждены в том, что мессия в лице Иисуса Христа однажды уже явился на землю для спасения людей. Члены кумранской общины верили в приход трех божественных существ: пророка и двух мессий, одного из рода Аарона, а другого из рода Израиля, причем наиболее важным из них они считали мессию из рода Аарона. В представлении же христиан Иисус является мессией из рода Давида, причем он выступает одновременно в качестве пророка и царя. Поскольку авторы евангелий вели происхождение Иисуса из рода Давида, то тем самым они исключали его принадлежность к священническому сословию. В этом заключается одно из отличий Иисуса от «праведного учителя», который, согласно найденным свиткам, был священником из рода Левия.