Начатые в 1951 г. систематические археологические раскопки в Хирбет Кумране оказались весьма успешными. Археологи внимательно изучили план здания и расположение комнат. Они установили, что центральную часть строения составлял прямоугольник размером 30x37 м. К нему примыкали различные подсобные помещения.
Самое большое помещение здания предназначалось для собраний и ритуальных трапез. В других помещениях находились кухня, посудная, ремесленные мастерские. Некоторые комнаты служили кладовыми, зернохранилищами. Найдены остатки мельницы, пекарни, кузницы. В здании были цистерны и бассейны, действовал водопровод. Археологи раскопали также скрипторий — писцовую мастерскую. Надо полагать, что именно в этом скриптории были написаны кумранские рукописи.
В результате раскопок были обнаружены фрагменты керамики, светильники, ножи, серпы, ключи, кольца, обломки копий и дротиков, наконечники стрел, глиняные таблички, остатки костей животных. В большом количестве найдены монеты разных исторических периодов.
Помимо большого некрополя, ставшего известным ученому миру еще в начале нашего столетия, археологи обнаружили два новых небольших кладбища. В этих трех кладбищах находится около 1200 погребений. Могилы расположены ровными рядами. Покойники лежат на спине и ориентированы головой к югу.
Тело покойника клали в нишу, вырытую в одной из стенок могилы. В могилах, как правило, обнаружены скелеты мужчин, но встречается и несколько женских погребений (одно во всяком случае). В мужских захоронениях не обнаружено ни драгоценностей, ни остатков вещей, ни следов погребальных жертв. В них найдены лишь отдельные фрагменты керамики и незначительные остатки деревянных гробов.
Интересный археологический материал дали раскопки в районе оазиса Айн-Фешхи. В 1956 г. археологи обнаружили остатки строения на территории, лежащей между Хирбет Кумраном и Айн-Фешхой. Строение было обнаружено и в самой Айн-Фешхе. В этих строениях найдены монеты и обломки керамики. С 25 января по 21 марта 1958 г. производились новые раскопки Айн-Фешхи. Были получены новые археологические данные по истории хозяйственной жизни кумранской общины. Заслуживает внимания тот факт, что керамика, обнаруженная в строениях Хирбет Кумрана и Айн-Фешхи, полностью тождественна с керамикой, найденной в близлежащих пещерах. Это говорит о том, что обитатели строений были одновременно и владельцами манускриптов, спрятанных в пещерах.
С 21 января по 3 марта 1952 г. археологи производили систематические раскопки в районе Вади Мурабба’ат, приблизительно в 18 километрах к югу от Хирбет Кумрана. В археологическом обследовании нового района принимали участие сотрудники Департамента древностей Иордании, Французской археологической школы в Иерусалиме и Палестинского археологического музея. Работами руководили упомянутые выше археологи Р. де Во и Л. Хардинг.
В четырех пещерах Вади Мурабба’ат были обнаружены памятники материальной культуры (изделия керамики, сосуды, орудия, куски ткани, предметы украшения и пр.), начиная от IV тысячелетия до н. э. и до времен арабского средневековья. Найденные здесь монеты относятся к периоду от 59 до 135 г. н. э. В пещерах найдено также большое количество рукописей самого различного содержания. Наряду с библейскими текстами встречаются деловые документы: контракты на сдачу и аренду земельных участков, долговые расписки, брачные контракты.
Особенно важное значение имеют документы, относящиеся к периоду восстания 132—135 гг. Анализ контрактов на сдачу в аренду земельных участков дает основание для предположения, что Бар-Кохба произвел аграрную реформу. Она сводилась к следующему: были объявлены государственной собственностью земли, конфискованные Римом после подавления восстания 66—73 гг. Государственные земли от имени Бар-Кохбы сдавались в аренду отдельными участками. Большой интерес представляют три письма, адресованные одному из военачальников Бар-Кохбы — Иешуа, сыну Галголы. Автором двух из них является сам Бар-Кохба, а третье письмо исходит от руководителей общины Бет-Машко. Данные этих писем говорят о том, что пещеры Вади Мурабба’ат служили убежищем для повстанцев. После поражения восстания эти пещеры были захвачены римскими войсками.