В июле 1952 г. бедуины нашли большое количество фрагментов различных рукописей в долине Вади эн-Нар, близ развалин монастыря св. Саввы (ныне руины Хирбет Мирд). Эти рукописи написаны преимущественно на греческом, арамейском и арабском языках и относятся к V—X вв. н. э. Весной 1953 г. район Вади эн-Нар обследовала бельгийская археологическая экспедиция. Однако собранные ею материалы мало добавили к первичной находке бедуинов.
В июле 1952 г. бедуины обнаружили в трех пещерах значительное количество манускриптов, которые по содержанию и времени происхождения находятся в родстве с рукописным материалом, найденным незадолго перед тем в пещерах Вади Мурабба’ат. Точное местоположение этих пещер ученым не удалось установить. Среди найденных памятников находятся фрагменты ряда библейских книг, деловые контракты, монеты, филактерии,, письмо, адресованное Симону Бар-Кохбе. Тексты обнаруженных манускриптов написаны на еврейском, греческом, арамейском и набатейском языках. Анализ найденного материала приводит к выводу, что упомянутые пещеры служили опорными пунктами для участников восстания Бар-Кохбы. Раскопки в Иудейской пустыне в начале 60-х годов пролили свет на некоторые важные вопросы, связанные с данными рукописей из неустановленных мест нахождения.
Новые важные находки на берегу Мертвого моря были сделаны в 1960—1961 гг., когда объединенная археологическая экспедиция израильских ученых обследовала около 40 пещер в районе между Энгади на севере и Масадой на юге. В работе экспедиции приняло также участие большое количество добровольцев-любителей из Израиля и других стран. Археологи работали в очень трудных условиях, так как исследуемые пещеры и гроты находились в неприступных склонах ущелий Иудейской пустыни. Продовольствие, вода и археологическое снаряжение доставлялись к месту раскопок на вертолетах. Не удивительно, что в помощь археологам было выделено специальное армейское подразделение. Экспедиция была разделена на четыре отряда, которые возглавлялись археологами Н. Авигадом, П. Бар-Адоном, И. Ахарони и И. Ядином. Каждый из них производил обследование отведенного ему участка.
Наиболее значительными и интересными оказались находки, сделанные в четырех пещерах. В научной литературе они получили условные обозначения: Пещера бассейна, Пещера сокровищ (или Пещера клада), Пещера ужасов и Пещера писем. Первая пещера названа так потому, что в ней обнаружен искусственный водоем. Наиболее ранние памятники материальной культуры, найденные в этой пещере, относятся к последней трети IV тысячелетия до н. э., а наиболее поздние — к временам римского владычества в Иудее.
Пещера сокровищ получила свое название благодаря найденному в ней «кладу». На глубине двух метров археологи обнаружили естественную нишу, вход в которую прикрывал большой камень. В ней было спрятано около 450 различных предметов: булавы, топоры, долота, молотки, сверла, наконечники стрел, сосуды, горшки, женские статуэтки. Многие предметы до сих пор нигде не встречались, что значительно затрудняет определение их назначения и функций. Памятники материальной культуры и фрагменты рукописных документов были обнаружены не только в нише, но и в других местах пещеры. Часть памятников относится к IV—III тысячелетиям до н. э., а остальная часть — к более поздним периодам, в частности к I—II вв. н. э.
Пещера ужасов представляет собой узкий коридор длиной в 65 метров. Под входом в нее разверзается пропасть глубиной в 300 метров, и поэтому доступ в пещеру возможен только при помощи веревок. В пещере найдены остатки тканей и керамики от энеолитического периода. Еще больше сохранилось здесь памятников римского времени: горшки, кувшины, лампы, корзины, веревки, гребни, сандалии, обрывки тканей, оружие, иглы, гвозди, фрагменты рукописей. Датировка найденных предметов в значительной степени облегчается тем, что вместе с ними обнаружены четыре монеты времен восстания Бар-Кохбы. В пещере лежало около сорока скелетов мужчин, женщин и детей. Это свидетельствует о том, что она служила убежищем для многих повстанцев и их семей на последнем этапе восстания. Обитатели пещеры предпочли погибнуть от голода, чем сдаться римлянам.
В Пещере писем обнаружены изделия из стекла, камня, дерева и кости, металлические предметы, керамика, кожаные, текстильные и плетеные изделия, предметы украшения. Особенную научную ценность имеет найденное в ней большое число рукописных документов. Этим рукописям пещера и обязана своим названием. Подавляющее большинство документов относится к периоду между 88 и 135 гг. н. э. Большой интерес представляют письма Бар-Кохбы, адресованные Ионатану и Масабале, военачальникам крепости Энгади. Среди письменных памятников делового характера выделяется так называемый «архив Бабаты», насчитывающий 35 документов на греческом, набатейском и арамейском языках. В этом архиве освещаются наследственные и имущественные взаимоотношения четырех семейств от 93/94 г. до августа 132 г. В документах архива Бабаты можно почерпнуть много важных данных для анализа хозяйственной и социальной жизни в Набатейском царстве накануне и после превращения его в римскую провинцию.