В носовой части Sorcerer II капитан Чарли Ховард работал дроссельной заслонкой двигателей, чтобы удержать судно на месте, пока Раш и Халперн с некоторым трудом продолжали разворачивать насос и приборы внутри судна. "Мы находились в неспокойной воде со всеми этими дизельными парами", - вспоминал Раш. "Мы как бы висели вверх ногами, пытаясь маневрировать оборудованием. Мы собирали воду с левого борта лодки, а с правого нас тошнило. В конце концов мы закончили фильтрацию где-то около 4:00 утра".
"Я подумал, что эти ребята должны сами увидеть и понять, откуда взялись образцы, с которыми они работали на своих компьютерах", - с усмешкой говорил Крейг позже.
Когда 13 марта была выпущена "Коллекция метагеномики океана", Раш и Халперн благополучно вернулись домой в Мэриленд. Их статья "Глобальная экспедиция по отбору проб океана Sorcerer II: Северо-западная Атлантика - восточная часть тропической зоны Тихого океана".2 На обложке номера, где крупным планом была изображена палуба "Колдуна II" среди набегающих сине-серых волн, были опубликованы еще девять статей, исследований, комментариев и эссе (одно добавилось в 2008 году), в которых оценивался первый сорок один образец, взятый от Саргассова моря и Галифакса до Галапагосских островов. В общей сложности из этих образцов было получено 7,7 миллиона генетических последовательностей, содержащих 6,3 миллиарда пар оснований, а также 6,12 миллиона белков и около семнадцати сотен совершенно уникальных семейств крупных белков. В ходе уникального метапоиска ви-русов ученые JCVI также выявили 154 662 вирусные пептидные последовательности и вирусные подмостки.
Специальный выпуск начался с нескольких вводных статей, в которых рассказывается о том, как и почему была организована экспедиция, и немного о проблемах - научных, логистических и политических. Среди них - статья научного писателя Генри Николса под названием "Сор-серер II: Поиск микробного разнообразия будоражит воды", в котором описывается видение Крейгом этого путешествия, а также противоречия и политика, окружающие экспедицию, такие как биоразнообразие и разрешения. Николс упомянул, например, о проблемах в таких странах, как Бермудские острова и Эквадор на Галапагосах, где критики с подозрением отнеслись к мотивам Крейга, взявшего образцы микробов в пределах их границ. "Подобные исследования заходят на неизвестную биологическую, юридическую и этическую территорию", - пишет он. И в этой обстановке обвинения в биопиратстве практически неизбежны". Однако это вряд ли остановит такого человека, как Вентер. Если это биопиратство в дарвиновской школе, то прекрасно", - говорит он".
Еще одна вступительная статья, "Экологическое дробовое се-квенирование.
Бывший научный сотрудник JCVI, а ныне профессор эволюции и экологии Калифорнийского университета в Дэвисе, Айзен написал статью, в которой описал и одобрил се-квенирование дробовика как технологию, которая сделала возможным глобальное исследование океана. Айзен сравнил ее с изобретением Интернета - "глобальным порталом, позволяющим наблюдать за тем, что происходит в ранее скрытом мире". Как и в случае с Интернетом, пишет он, "с ESS [Environmental Shotgun Sequencing], безусловно, связана некоторая шумиха, которая придает относительно тривиальным результатам больше внимания, чем они того заслуживают". Однако для Айзена это перевешивается "революционным потенциалом" технологии.
После этих коротких материалов вышла статья Дага Раша, Аарона Халперна и тридцати шести соавторов, включая Крейга в качестве второго автора, - большой обзор того, что экспедиция обнаружила в первых сорока одном образце. Это было непросто, в том числе потому, что объем собранных данных был беспрецедентным. "Мы начали с тонны информации", - говорит Халперн. "Но что все это значило? Никто толком не знал. Когда мы начинали, мы даже не были уверены, какие вопросы хотим задать".
"Это было чудовище, которое нужно было собрать воедино", - говорит Раш, отчасти потому, что длинные строки генетического кода, созданные в процессе селекции и сборки дробовика, не были собраны для проверки определенной гипотезы или ответа на конкретные вопросы. "Все, что у нас было, - это весь этот код, который был в природе, и который нам нужно было попытаться осмыслить, чтобы попытаться задать вопросы об экологии и эволюции из разных мест".