В память о погибших во время стрелецкого бунта 15 мая 1682 года дядьях Петра – Ивана и Афанасия – в 1690-х годах по велению царя строятся Святые врата с надвратным храмом Покрова Богородицы и двухъярусной колокольней. На территории южного двора обители Петр приказал соорудить братские кельи с церковью для монахов, чтобы молились за погибших родственников.
В 1682 и 1689 годах царь укрывался от стрелецких волнений в Троице-Сергиевой лавре. Вернувшись в Москву, в 1690–1694 годах он возводит в монастыре храм во имя своего духовного покровителя – преподобного Сергия Радонежского, в память о спасении во время стрелецкого бунта.
Во времена борьбы за власть с сестрой – царевной Софьей – Петр активно укреплял Высоко-Петровский монастырь, чтобы создать себе укрытие. Он укреплял стены Петровского монастыря, а центральный крест храма во имя Сергия Радонежского увенчал короной – символом царской власти, чтобы люди знали, что здесь будет молиться будущий государь.
При входе в храм Сергия Радонежского было построено царское крыльцо, с которого Петр I наблюдал крестные ходы.
Во время строительства метро весь мусор и землю сбрасывали на территорию монастыря, поэтому храмы были завалены почти на два метра.
В XVIII веке, во времена правления императрицы Елизаветы Петровны на территории монастыря были построены две церкви. Первая – Церковь в честь Толгской иконы Божией Матери – была построена на средства, пожертвованные Н.А. Нарышкиной в память о спасении Петра в Троице-Сергиевой лавре 8 августа 1689 года. Возведена она была в 1744 году архитектором И. Ф. Мичуриным к югу от колокольни. Название свое церковь получила, поскольку именно 8 августа (по старому стилю) чествуется Толгская икона Богоматери. Вторая церковь была возведена над южными воротами монастыря в 1753–1755 годах на пожертвования настоятеля монастыря архимандрита Пахомия в память его небесного покровителя – Пахомия Великого.
Высоко-Петровский монастырь. Фото И. Орленка
Высоко-Петровский монастырь был захвачен французами во время Отечественной войны 1812 года. В стенах монастыря французы расстреливали москвичей, обвиненных в поджогах, их тела закапывали возле монастырской колокольни. Монастырь был осквернен и разграблен. Церковь Пахомия Великого была осквернена так сильно, что ее удалось восстановить и вновь освятить только через столетие, в 1914 году. Церковь была переосвящена во имя апостолов Петра и Павла.
В советский период монастырь постигла та же участь, что и многие другие русские обители. В 1922 году монастырь был закрыт, в 1929 году закрыли и опечатали последний действующий храм монастыря.
Из Боголюбского храма-усыпальницы были выброшены все надгробия царских родственников. Сейчас надгробия сложены вдоль южной стены храма.
В Боголюбском храме открыли завод по ремонту моторов для сельскохозяйственного оборудования. В храме во имя Сергия Радонежского был устроен сначала спортзал, затем репетиционный зал хореографического ансамбля «Березка». Палаты монастыря отдали в распоряжение шляпной мастерской и чайной Общества помощи инвалидам.
Во время строительства метро весь мусор и землю сбрасывали на территорию монастыря, поэтому храмы были завалены почти на два метра.
С 1990-х началось восстановление Высоко-Петровского монастыря и возвращение его Русской Православной Церкви. Восстановительные работы проводились под руководством архитектора Бориса Дедушенко. Высоко-Петровский монастырь решено было воссоздать в том облике, в котором его когда-то задумал Петр I. В процессе реставрации было установлено время восстановления собора святителя Петра.
Как показали исследования, памятник восходит ко временам возведения храма Василия Блаженного и церкви Вознесения в Коломенском, тогда как раньше считали, что собор построен в 1690 году.
Собор святителя Петра был реставрирован и вновь освящен в 1998 году. Сейчас каждую субботу здесь служат литургию на греческом языке. Храм украшают иконы и фрески, выполненные в старомосковском стиле. Главная храмовая икона – список с иконы святого Петра, которая находится в Успенском соборе Кремля.
Надвратная церковь Покрова Пресвятой Богородицы вновь освящена в 1995 году. С 1992 года возобновились также богослужения в храме преподобного Сергия Радонежского.
Сегодня Высоко-Петровский монастырь является Патриаршим подворьем.