Эмпедокл рассматривал также особенности взаимодействия частиц в процессе их движения, в результате которого происходит не образование, а распад веществ. Последний процесс, который Платон считал происходящим "случайно, поневоле", по мнению Эмпедокла, протекает "согласно природе вещей" [15]. Таким образом, Эмпедокл попытался диалектически рассмотреть протекание природных процессов. Оригинально и иное умозаключение Эмпедокла: все сущее может быть одновременно единым и многообразным. При этом Эмпедокл использовал элементы философии Парменида и Зенона, например: объединение есть одновременно и разрушение, а разрушение — объединение; целое возникает из единичного, а единичное — из целого; движение вечно, как первоматерия, а отдельные вещи имеют конец [15, с. 1826].
Представление Эмпедокла о "ненависти" и "любви" между частицами "элементов", из-за которых "элементы, длительно перегруппировываясь, приходят в движение", противоречило мнению Платона, что соединение веществ происходит "случайно, поневоле" [15]. "Любовь" и "ненависть" между частицами, по Эмпедоклу, существуют как принципы, исключительно вне вещей. Эти принципы в некоторой степени аналогичны противоположностям — частному и целому, постоянно присутствующим в "вещах". С другой стороны, "любовь" и "ненависть" между частицами тесно связаны с разработанными Эмпедоклом понятиями "симметрия" и "избирательное сродство". В дискуссиях ученых XVIII в. эти понятия играли важную роль. Они подготовили почву для формирования представлений о сродстве как причине химического взаимодействия [17].
Большое значение для развития естественнонаучных знаний имело также выяснение Эмпедоклом природы органов чувств и их способности к ощущению, наблюдению и восприятию конкретных "вещей". Он внимательно изучал границы познания и критиковал философов, пытавшихся "познать всю действительность". Эмпедокл считал, что "каждый, обладая весьма ограниченными возможностями, должен стараться охватить лишь узкий круг явлений" [15, с. 1829].
Анаксагор развил представления Эмпедокла, сформулировав принцип: все различные частицы обладают неодинаковым весом (массой). Так был введен новый классификационный принцип в развитие естественнонаучных знаний: различные вещества образуются соответственно из качественно неодинаковых частиц первоматерии. Это обусловило появление новой натурфилософской проблемы — проблемы индивидуальности и чистоты (однокачественности) веществ. Согласно взглядам Анаксагора, в каждом веществе содержатся частицы разных "элементов", но лишь частицы какого-либо одного "элемента" присутствуют в наибольшем количестве. Они-то и определяют основные качества вещества. Анаксагор писал: "Во всех телах следует определить основную часть" и "то, что присутствует преимущественно в каком-то количестве каждого тела, и определяет свойства конкретного тела" [15, с. 1837]. Позже эту мысль развил Аристотель. Он рассматривал способность веществ к "смешиванию" (соединению) как особое качество.
Причиной движения материи, ее изменения и относительного расположения Анаксагор считал "дух" как объективную реальность. Аристотель заметил про Анаксагора, что тот использовал понятие "дух" во всех случаях, когда не мог указать иную причину явления [15, с. 1829]. Анаксагор приписывал духу, идее лишь роль основополагающего "принципа". В то же время многообразие веществ Анаксагор объяснял как возникающее "само по себе". Платон заметил, что Анаксагор, по существу, не нашел какого-либо реального применения понятию "дух" [15]. По сути своих взглядов Анаксагор был материалистом. "Видимые вещи,- по его мнению,- являются основой для познания невидимых" [15].
Анаксагор считал, что в своей бесконечной делимости частицы веществ достигают размеров, которые выходят за пределы чувственного человеческого восприятия. Для развития естественнонаучных знаний была особенно важной конкретизация представления о существовании необычайно малых частиц первоматерии. Это сделали Левкипп и Демокрит, сформулировав понятие об атомах. Так представления о строении материи поднялись на новую ступень развития. Это означало наступление следующего этапа высшего развития знаний.
Атомистические представления античных натурфилософов развивались в сочинениях некоторых арабских мыслителей в средние века. Однако лишь в XVI-XVII вв. был достигнут существенный прогресс атомистических воззрений в результате работ Зеннерта, Юнгиуса и Бойля. И наконец, в начале XIX в. атомистика стала теорией, важнейшей для познания химических явлений, благодаря основополагающим исследованиям Дальтона и Берцелиуса.