В достаточно чистой воде растут харовые водоросли (Chara aspera, Chara tomendos), водокрас (Hydrocharis morsus-ranae), пузырчатки малая и охристая (Utricularia minor, Utricularia ochroleuca), рдест цветной (Potamogeton coloratus), сальвиния (Salvinia natans). При умеренном загрязнении преобладают нителлопсис (Nitellopsis obtuse), рдест блестящий и пронзённолистный (Potamogeton lucens, Potamogeton perfoliatus), уруть мутовчатая (Myriophyllum verticillatum). В очень сильно загрязнённых водах развиваются многокоренник (Spirodela polyrhisa), рдест узловатый (Potamogeton nodosus), роголистник (Ceratophyllum demersum), ряска (Lemna vinor), стрелолист обыкновенный (Sagittaria sagittifolia).
Следует учитывать, что многие виды водных растений обладают широким географическим и экологическим ареалами и в разных водоёмах имеют различное индикаторное значение.
О степени антропогенного влияния на окружающую среду судят по исчезновению видов, например, декоративных растений первоцветов: подснежников (Galanthus nivalis, Galanthus plicatus), пролесок( Scilla bifolia, Scilla sibirica), рябчиков (Frittilaria meleagris, Frittillaria ruthenica), тюльпанов (Tulipa quercetorum, Tulipa schrenkii), численность которых вблизи городов резко сокращается вследствие хищнического сбора, вытаптывания и переуплотнения почвы. Чрезмерный выпас скота, приводящий к деградации естественных лугов, можно диагностировать по характеру растительности, когда ценные кормовые виды замещаются менее питательными. Избыток навоза приводит к усиленному развитию азотолюбивых растений, которые животные не едят.
На свалках обитают рудеральные, или мусорные растения — крапива (Urtica dioica), красавка (Atropa belladonna), лопух(Лг&шт lappa), которые, как правило, являются нитрофилами (см. первую главу). Индикаторами нарушенных земель являются завезённые амброзия (Ambrosia artemisifolia) и циклахена (Cyclachaena xantifolia), которым трудно конкурировать с местными растениями в устоявшихся биоценозах, но которые прекрасно развиваются на стройках, свалках, пустошах, вдоль дорог. Некоторые сорняки обитают в посевах культурных растений, и их жизненный цикл приспособлен к определённой культуре. Так, рыжик льновый (Camelina linicola) и плевел льновый (Lolium linicolum) встречаются только в посевах льна, а ежовник рисовый (Echinochloa oryzoides) является индикатором рисовых полей.
Редкие растения являются индикаторами необычных местообитаний. Они могут указывать на центры биоразнообразия или убежища, где вид пережил последний ледниковый период. Составлены списки растений, называемые Красными книгами, которые подлежат охране. Многие из них являются эндемиками, то есть встречаются только в определённом географическом районе.
Охрана растений является одним из важнейших требований при построении общества устойчивого развития. Считается, что в настоящее время на Земле еженедельно исчезает один вид растений, а ведь его гибель ведёт к уничтожению примерно ещё 30 видов мелких животных, связанных с ним в процессе питания. По оценке учёных, почти миллиону видов живых организмов угрожает вымирание непосредственно из-за человеческой деятельности и климатических изменений, связанных с нею. Прогнозируется, что к середине нынешнего столетия до четверти всех животных и растений может исчезнуть с лица Земли. Такие прогнозы действительно ужасают, ведь человеком используется всего несколько тысяч видов растений. О многих видах и их полезных свойствах человеку зачастую ещё даже не известно, не говоря уже о том, что от состояния растительности зависит благополучие не только человечества, но и само существование жизни на планете.