Дальнейшие операции Онежской флотилии, развернувшиеся в октябре, были направлены на то, чтобы уничтожить флотилию и береговые батареи противника, высадить десант в район станции Медвежья Гора и освободить с его помощью город Повенец. Эти задачи были выполнены не полностью. Советскому десанту не удалось освободить Медвежью Гору и Повенец. Но береговые батареи белых были обезврежены, а вражеская флотилия фактически прекратила свое существование: часть кораблей белогвардейцы взорвали и потопили, часть же — различные мелкие суда — вывезли по железной дороге в глубокий тыл. Это был лишь частичный успех Красной Армии и Флота, но он сыграл важную роль в освобождении Севера: позиции врага на мурманском направлении были значительно ослаблены.
Осенью 1919 года активные боевые действия происходили и на некоторых второстепенных участках фронта на Севере. В частности, в ноябре белогвардейские отряды, действовавшие в районе реки Вычегды, совершили налет на Яренск и Усть-Сысольск (Сыктывкар) и захватили их. Но уже в начале декабря белогвардейские банды были разбиты и отброшены и от Яренска и от Усть-Сысольска. Эту операцию провели части 54-й стрелковой дивизии и отряд моряков Северодвинской флотилии под командованием И. А. Мякишева. В ней приняли участие также местные партизаны и коммунисты.
В целом осенние операции на Севере не привели к существенному изменению обстановки на фронте. Правда, эвакуация интервентов ухудшила положение белых войск, но, с другой стороны, и советская 6-я армия не могла добиться решительных успехов, так как сил у нее для этого не хватало. Исключительно напряженная обстановка, которая создалась на важнейших фронтах Республики осенью 1919 года, не давала возможности советскому командованию укрепить 6-ю армию настолько, чтобы она могла немедленно покончить с контрреволюцией на Севере.
В январе 1920 года, когда уже определился успех Красной Армии на основных фронтах гражданской войны, советское командование поставило перед войсками 6-й армии задачу выйти на побережье Белого моря, освободить Архангельск и Онегу, а также, овладев Мурманской железной дорогой, очистить от врага Мурманск. 6-я армия была укреплена. На северные направления были переброшены пополнения из Петроградской революционной армии труда (бывшая 7-я армия). В состав регулярных войск Красной Армии влились многие отряды партизан Севера. Упорядочилось снабжение оружием, продовольствием, одеждой. Укрепились партийные организации 6-й армий, благодаря чему улучшилось морально-политическое состояние ее частей. В сентябре 1919 года коммунистические организации армии насчитывали 834 члена партии, 264 кандидата и несколько сот сочувствующих. На каждые 26 бойцов в армии приходился один коммунист. В ноябре, после «партийной недели», проведенной по указанию ЦК РКП(б), партийный состав армии значительно увеличился. 13 частях и соединениях армии было уже 3595 членов партии, 392 кандидата и 2241 сочувствующий».
Рост партийных рядов в 6-й армии явился верным залогом ее стойкости и высокого боевого духа.
Численное соотношение сил на Севере к началу наступления Красной Армии оставалось еще в пользу противника. На архангельском направлении против 15 945 штыков и сабель советской 6-й армии белые имели 17 410 штыков и сабель. На мурманском направлении против 5670 штыков и сабель советских войск у противника было 6150 штыков и сабель. Но некоторое численное превосходство врага не могло уже иметь существенного значения. Белогвардейское командование во главе с Миллером пребывало в глубоком унынии и растерянности: надежда на Деникина и Юденича лопнула как мыльный пузырь. Было ясно, что силы контрреволюции, цеплявшиеся за Архангельск и Мурманск, долго не продержатся. Армия белых разлагалась, мобилизации местного населения давали крайне ненадежные пополнения, враждебное отношение рабочих и крестьянских масс к белогвардейцам сказывалось с каждым днем все резче и резче.
Готовившееся наступление Красной Армии должно было неизбежно ликвидировать очаг контрреволюции на севере России.
Войска 6-й армии в конце 1919—начале 1920 года были сведены в три стрелковые дивизии — 54-ю, 18-ю и 1-ю. На северодвинском, мезенском и пинежском направлениях действовала 54-я дивизия, сформированная в августе 1919 года. На железнодорожном и онежском направлениях сражалась 18-я дивизия. На мурманском участке действовала 1-я дивизия, переданная в августе 1919 года из 7-й армии.