Но в это же время и даже раньше, в начале IV в. раскольники-мелитиане создали конфедерацию монастырей и имели экономически мощную и духовно респектабельную монашескую общину в египетском Хатхоре. Тогда же росли монашеские поселения на Нитрийской горе, в семидесяти километрах км. к югу от Александрии, и в так называемой Келлии, пустыне, приблизительно в двадцати километрах от Нитрийской горы, в Нижнем, то есть северном Египте, где основателями обителей во второй четверти IV в. стал старший современник Антония, авторитетный монах, авва (отец) Аммон или Аммун (ум. в 347 г.). К концу столетия монашеские колонии достигали здесь численности четырех-пяти тысяч человек, а особо строгое монашеское поселение в Келлиях простиралось на двадцать два километра. Новейшиеархеологические раскопки показали, что к середине VI в. обширная территория обитания здешних отшельников представляла собой прямоугольные постройки из кирпича, обнесенные кирпичными стенами, так что с воздуха они напоминали гигантскую шахматную доску на поверхности пустыни. В каждом общежитии обязательно была «клетка» — келия отца — аввы, примыкающая к одному из углов. Обычно она имела несколько комнат: молельню, кухню, кладовые и спальню. Внутри стены были побелены и зачастую украшены изображениями львов, верблюдов, птиц, а также крестов красного и золотого цвета. Некоторые поселения имели вторую, меньшую келию, предположительно, для ученика аввы. Вход в поселение контролировался из сторожки. Кое-где в общежитиях сохранились остатки колодцев и ирригационных каналов, вероятно, для небольших садов — единственного, что оживляло охряно-желтую пустыню.
В шестидесяти километрах к югу от Келлии, к западу от Нила находилась куда большая Нитрийская пустыня (совр. Вади Натрун), она же Скит, где еще одним пионером монашества стал преподобный Макарий Египетский (ок. 300–391 гг.), причем к середине IV в. монашеские поселения здесь столь разрослись, что многие предпочитали уходить дальше на юг, скрываясь от мира.
Быт здешних иноков, старцев, живших в уединенных хижинах-скитах, хорошо описан в анонимной «Истории египетских монахов», составленной приблизительно в 400 г. в виде путевых заметок о паломничестве по Египту, предпринятом в 394 г. палестинскими монахами. В ней собраны истории знаменитых отшельников, целителей, святых, чудотворцев. Позже эта тема была продолжена еще одним палестинским монахом-путешественником Иоанном Мосхом в собрании столь же душеспасительных рассказов под названием «Луг духовный».