Власть царя была двойственная, двусмысленна и по своему происхождению, и по своему составу. Наиболее действующим было соборное собрание. Верховная власть постепенно упрощалась. Государство при новой династии перестало быть вотчиной государя. Царь принимал власть как бы по наследству (по завещанию) и по соборному избранию. В 1613 году присягали Михаилу и его будущим детям. Соборное избрание царя стало как бы признанным прецедентом. Сын Михаила Алексей сделал попытку превратить соборное избрание в символический обряд. По смерти Алексеева сына, царя Федора, не оставившего наследника, решали коллективно соборным порядком, кто будет царь. Со значительным перевесом избрали Петра. Но стрельцы, поднятые партией царевны Софьи, заставили избрать на престол сразу двух братьев. Петра и Ивана (слабоумного).
Московский царь Алексей Михайлович.
В 1681 году был возбужден вопрос об отмене местничества. Чтобы как-то сохранить своё господство бояре попытались закрепиться в провинции. Был составлен план раздела государства на крупные исторические области, вошедшие в состав государства бывшими самостоятельными государствами. И там назначались из московской знати пожизненные наместники – местные правители. Царь Фёдор дал согласие на это, но патриарх разрушил этот план, считая, что он угрожает государству.
Обстоятельства заставляли тогдашнее общество принимать прямое участие в общественных делах, и само правительство вовлекало его в это участие. Понятия Совет всей земли, Общий земский совет, всенародное собрание, крепкая Дума овладели умами. И мысль выбирать государя таким образом охватила все земство. Без выборных представителей всех чинов не решались делать никакого важного шага. Таким образом, выборным людям предоставлялось право возбуждать законодательные меры.
Изменение принципа формирования верховной власти в XVII веке грозило целостности Московского государства. Произошло глубокое опустошение в хозяйственном и в нравственном положении народа. Страна была разорена. Произошла перемена в составе сельского крестьянского населения, являющегося главным источником государственного дохода. Крестьянство распалось на крестьян собственников и на бобылей, имеющих небольшие участки земли, или совсем не имеющих. А это в свою очередь сказалось на состоянии провинциального дворянства, которое, в конце концов, разорялось и подавалось в города, поступало в казаки, или уходило в монастыри. Настроение общества менялось, недовольство становилось всё слышнее, наступал период народных волнений и мятежей.
После смуты государство изменилось. На повестку дня встали вопросы завершения политического объединения русской народности и расширения государственной территории до пределов русской равнины. Прежняя династия не разрешила этих вопросов, но сделала в этом не мало. Дед и отец Ивана Грозного вернули Смоленскую и Северскую земли, дошли до Урала и Каспия. Намеревались дойти до Балтийского моря, но не удалось. Поляки в XVI веке отрезали от Москвы Смоленск и Северскую области, а шведы оттеснили Россию от берегов Балтийского моря. И лишь в 1664 году восставшая против Польши Малороссия отдалась под защиту Московского государства. В 1648 году Богдан Хмельницкий поднял Запорожье против Польши. Его поддержало малороссийское крестьянство, восставшее против польских и ополячившихся русских панов, он в течении полугода имел в своих руках почти всю Малороссию.
При расстроенном состоянии Московского государства Сибирь была тогда важным источником финансового пополнения казны, особенно её мехами. Государь повсюду откупался соболями, где нужно было платить или дарить.
Русские, быстро захватывая новые земли Сибири, заселяли её пришлым народом, строили там города, облагали население ясаком. Ядром населения Сибири были крестьяне, которые выращивали хлеб для служилых казаков.
В Сибири церквей было мало. Переселенцы оказались оторванными от христианской веры и вели себя распущенно, не соблюдали постов, ели и пили с иноверцами, находились в связях с некрещеными женщинами, закладывали, перепродавали чужих жён друг другу и т. д. И только тогда, когда Филарет в 1621 году посвятил в Сибирь первого архиерея Киприяна, обратился с обличительной грамотой к прихожанам, положение стало меняться.