Единственной цели подчинялась и деятельность всех губернских учреждений. Донельзя ограниченное самоуправление как городское, существовавшее с 1785 года, так и земское, открытое в 1865 году, к исходу XIX столетия превратилось, по существу, в хозяйственное управление при губернаторе, который в соответствии с «Городовым положением» и «Положением о губернских и уездных земских учреждениях» утверждал списки избирателей, гласных городских дум и земских собраний и председателей уездных земских управ, а следом — и постановления городских дум и земских собраний, представлял на утверждение министру внутренних дел кандидатуры городских голов и председателей губернской земской управы и по закону от 22 июля 1866 года имел право ревизовать все губернские учреждения и для отчета вызывать к себе всех должностных лиц губернии, каковыми с 1890 года и являлись земские служащие. К тому же при посредничестве губернских по городским (с 1870 года) и земским (с 1891 года) делам присутствий, впоследствии преобразованных в одно губернское по земским и городским делам присутствие (с 1895 года), губернатор не только контролировал органы местного самоуправления, но и для поддержания порядка на подведомственной им территории принуждал их организовывать всевозможные пикеты и заставы и субсидировать деятельность полиции и многочисленных других правоохранительных служб.
Судебная власть, законом от 20 ноября 1864 года, казалось бы, отделенная от административной, также утратила независимость, когда губернатор получил право отвода нежелательных кандидатов на должности уездных мировых судей и присяжных заседателей окружного суда. С другой стороны, судебная власть подменялась и постепенно вытеснялась такими внесудебными учреждениями, как губернские присутствия, возглавлявшиеся губернатором, который с 1904 года председательствовал и в так называемом «особом совещании», состоявшем из начальника губернского жандармского управления и прокурора окружного суда и руководившем производством дознания по государственным преступлениям. По закону от 14 августа 1881 года «О мерах по охранению государственной безопасности и общественного спокойствия» губернатор имел право запретить любое общественное и частное собрание, закрыть любое торговое и промышленное заведение, арестовать на месяц и выслать за пределы губернии любого жителя, сочтенного им неблагонадежным.
В целом, не считая губернского правления, которое из коллегиального органа управления в итоге сделалось второй канцелярией губернатора, последний возглавлял два десятка различных учреждений и ежедневно подписывал до трехсот всевозможных бумаг, главнейшей из которых был ежегодный всеподданнейший отчет о состоянии дел в губернии.
От хозяйственных обязанностей для исполнения полицейских освобождался также вице-губернатор (ранее — правитель наместничества), который до 1845 года возглавлял казенную палату. Отныне, кроме замещения первого лица, ему поручалось наблюдение за делопроизводством губернского и уездных правлений, полицейских управлений, исправительно-арестантских отделений и тюрем, а с 1882 года — цензура частных периодических изданий.
События первой русской революции оказались критическими для большинства губернаторов, которым силой пришлось подавлять антиправительственные выступления в своих губерниях, причем должностей лишились как те, кто проявил излишнюю, так и те, кто проявил недостаточную решительность. В условиях Первой мировой войны губернаторы сыграли важную роль в проведении мобилизаций, переводе на военный лад промышленности, размещении многочисленных беженцев из западных областей России. Однако затяжной характер, тяжести и лишения военного времени, усугубленные нараставшей нехваткой продовольствия, припасов подорвали к 1917 году у населения авторитет местной власти.