Толчком для активных действий заговорщиков послужила рассылка Сигизмундом по всем подвластным ему землям грамоты, призывавшей «княжат и панят, и всю шляхту» прибыть в Вильно на сейм для решения спешных общегосударственных дел. Это, вероятно, вполне безобидное обращение великого князя было истолковано участниками заговора как подтверждение коварных замыслов Сигизмунда извести весь шляхетский род, и участь правителя была решена. В вербное воскресенье 20 марта 1440 г., когда Сигизмунд слушал обедню в одной из башен Тракайского замка, а его сын Михаил, «вышел з града до костела», на территорию резиденции великого князя въехало множество возов с оброчным сеном. Прибегнув к «троянской» хитрости, заговорщики скрыли под сеном своих вооруженных слуг, что позволило им быстро расправиться с застигнутой врасплох охраной и овладеть замком. Александр Чорторыйский и Скобейка отыскали Сигизмунда в его покоях и со словами: «Что еси был наготовил князем и паном, и всем нам пити, тое ты теперь пей один», — убили его. Вместе со своим хозяином погиб и любимец князя Славко, которого заговорщики сбросили с башни. После овладения Тракаем и устранения великого князя, участники заговора заняли Виленские верхний и нижний замки, но схватить Михаила Сигизмундовича им не удалось.
Каких-либо массовых эксцессов убийство непопулярного правителя не повлекло, но и надежды участников заговора на быстрое возвращение к власти их кумира не оправдались. Аристократия Великого княжества разделилась на несколько группировок. Одни хотели видеть своим государем польского короля Владислава III, другие желали возвести на престол Михаила Сигизмундовича, а третьи хотели вернуть князя Свидригайло. Кровавая развязка конфликта между жестоким правителем и знатью привела к тому, что Литовская держава оказалась перед перспективой нового противоборства различных лагерей, а соответственно, и усиления польской экспансии. Успешно преодоленная гражданская война грозила смениться еще более гибельным кризисом, первые признаки которого не замедлили появиться. Распри в центре государства способствовали возрождению сепаратистских настроений в недавно присоединенных областях и уже 27 марта 1440 г. восстал Смоленск. Наместник вместе с верными ему боярами были вынуждены покинуть город, после чего там утвердился племянник Свидригайло Мстиславский князь Юрий Лугвеньевич.
Великому княжеству Литовскому срочно нужен был новый государь, но определить его кандидатуру было непросто. Ни князь Михаил Сигизмундович, ни 75-летний, но по-прежнему неугомонный Свидригайло, не обладали достаточным количеством сторонников. Многие магнаты сторонились обоих кандидатов, опасаясь возможной мести со стороны любого из них в случае прихода к власти. Поэтому ориентирующиеся на кандидатуру Владислава III силы оказались наиболее многочисленными, но с возведением польского короля на литовский престол тоже были существенные затруднения. Дело в том, что осенью 1439 г. 15-летний Владислав под именем Ласло V был избран еще и королем Венгрии. С тех пор венгры настаивали на срочном переезде Владислава в их столицу, но столь удаленное местонахождение будущего государя совершенно не устраивало Литву. Литовские магнаты тоже требовали присутствия монарха на своей земле, угрожая в противном случае разорвать династическую унию с Польшей.
Краков оказался в затруднительном положении и, как сообщает Гудавичюс, для его преодоления Збигнев Олесницкий выдвинул хитроумный план. Он предложил выделить Свидригайло и Михаилу отдельные зависимые от Польши княжества, а большую часть Великого княжества подчинить непосредственно польскому королю. На первый взгляд такой план позволял примирить две литовские группировки, собрав их сторонников в отдельных княжествах вокруг своих лидеров. На деле же это не только сохраняло в Литве два враждебных лагеря, но и давало возможность польским политикам манипулировать ими, поддерживая то одну, то другую сторону. Воплощение в жизнь плана Олесницкого означало бы окончательную ликвидацию остатков суверенитета Великого княжества Литовского и расчленение его территории на зависимые от Польского королевства образования.