Вторая версия сводится к самоубийству царевича. Дело в том, что Дмитрий страдал эпилепсией. Как позже утверждали многочисленные свидетели, «и презже тово… на нем была ж та болезнь по месяцем беспрестанно». Сильный припадок был у Дмитрия за месяц до его смерти. По показаниям мамки, во время прогулки 15 мая у царевича начался новый приступ.
К тому же Дмитрий обожал играть ножами и саблями. У царевича с малых лет было предрасположение к жестокости. Он очень любил смотреть, как резали быков или баранов. Любимой забавой Дмитрия было убивать кур и гусей сабелькой или маленькой железной палицей.
15 мая царевич вместе с другими детьми играл в «тычку» — нужно метать нож в очерченный на земле круг. Внезапно с Дмитрием случился приступ «падучей», он упал на нож и поколол горло.
Что произошло в Угличе 15 мая 1591 г. на самом деле, сегодня не знает никто. Действительно, Годунов опасался Нагих и для надзора за ними прислал в Углич дьяка Михаила Битяговского, наделив его самыми широкими полномочиями и даже вменив ему в обязанность выдавать деньги вдове Грозного и ее братьям. Нагие ненавидели Бориса и других бояр и ждали смерти Федора, надеясь, что после этого престол унаследует Дмитрий. Дмитрия также воспитывали в этой ненависти. До Москвы доходили слухи, что царевич в Угличе срубал головы деревянной саблей снежным бабам, которых называл именами бояр, и эти слухи вызывали у бояр тревогу. И если бояре опасались, что на престоле Дмитрий мог бы оказаться похожим на своего отца, то у них были на это основания.
Нагие, и прежде всего мать царевича Мария и дядя его Михаил, который был в то время сильно пьян, заявили, что Дмитрия убили, и убили его сын ненавистного им дьяка Битяговского Даниил, племянник дьяка Никита Качалов и сын мамки царевича Василисы Волоховой Осип.
Для расследования событий в Угличе Федором была назначена комиссия во главе с боярином князем Василием Ивановичем Шуйским. Как позже показало следствие, перед самым приездом комиссии Михаил Нагой велел своим слугам подбросить ножи рядом с брошенными в ров трупами Битяговских. Ножи предварительно испачкали кровью зарезанной курицы. Но комиссия без труда разоблачила эту наивную попытку фальсификации вещественных доказательств.
Комиссия Шуйского провела большую работу и опросила свидетелей трагедии. Судя по расспросам свидетелей, с Дмитрием случился припадок падучей болезни во время детской игры с ножом в «тычку». С ножом в руках он забился в припадке, упал на землю и порезал горло. Смерть была неизбежна.
Следовательно, комиссия пришла к выводу, что царевич зарезал сам себя. В дальнейшем Шуйский в зависимости от политической ситуации, дважды менял показания. Так, в 1605 г., когда престол захватил Лжедмитрий I, он утверждал, что Годунов приказал убить царевича, но убит был другой ребенок, а Дмитрий чудесным образом спасся. Затем, после того, как в 1606 г. царем стал он сам, Шуйский заявил, что погиб действительно царевич, и это было убийство по тайному приказу Годунова.
Годунов был весьма непопулярен в разных слоях русского общества. Поэтому слухи о намерении его убить царевича Дмитрия с целью завладеть престолом, как и о чудесном спасении царевича получали широкое распространение. При Романовых версия об убийстве царевича по тайному приказу Бориса стала официальной, а в дальнейшем ее приняли и многие историки.
В конечном итоге, после отчета следственной комиссии, правительство обвинило Нагих в измене, выразившейся в убийстве дьяка М. Битяговского и других людей. Арестованы были все Нагие, а также участники угличского бунта. Мария Нагая была выслана в отдаленный монастырь Св. Николая вблизи Белоозера и пострижена под именем Марфы. Нагие были посажены в разные тюрьмы, а их люди были казнены и высланы в Сибирь. В Сибирь «сослали» даже угличский колокол, предварительно отрезав у него «язык» и «ухо». Так завершилось угличское дело 1591 г.
Последний Рюрикович
С гибелью царевича Дмитрия надежд на продолжение династии Рюриковичей, правившей на Руси уже более 700 лет, оставалось немного. Однако в 1592 г. у Федора и Ирины, наконец, родилась дочь, которую назвали Феодосией. Но уже через два года царевна умерла. Смерть царевны Феодосии дала повод для появления еще одного слуха — о том, что по приказу Годунова родившегося у царицы Ирины сына подменили девочкой. Основываясь на этом слухе, за сына Федора «царевича Петра» будет выдавать себя в 1606 г., при Лжедмитрии I и во время восстания И. Болотникова муромский посадский человек Илейка Горчаков, который появится у казаков на Тереке. В смерти племянницы враги также обвиняли Годунова.
На протяжении всех 14 лет царствования царя Федора по существу ничего не изменилось в его жизни. Государственными делами он заниматься не мог. День царя состоял в следующем. Вставал он около четырех часов утра. После того, как его умоют и оденут, Федор молился у себя в комнате в присутствии придворного священника и дьяков. Окончив молитву, царь посылал к царице своих приближенных узнать о ее здоровье и через некоторое время сам шел здороваться с ней в комнату, находящуюся посередине между его и ее спальнями. Только накануне постов царь с царицей ели и спали вместе, все остальное время они проводили порознь. После свидания они вместе шли в придворную церковь на утреннюю службу и проводили там около часа. По окончании заутренней царь возвращался во дворец, где его уже ждали особо приближенные бояре для совета.
Около девяти часов утра Федор отправлялся в кремлевскую церковь слушать обедню, которая длилась около двух часов, и во время которой он выслушивал доклады членов Боярской думы. После службы царь возвращался во дворец и отдыхал до обеда.
Перед обедом каждое блюдо сперва отведывал повар в присутствии дворецкого. Потом придворные дворяне — жильцы несли кушанья к царскому столу, здесь их принимал кравчий, который давал их снова попробовать специально предназначенному для этого человеку, а после ставил их перед царем. Обыкновенно число блюд за царским обедом бывало около семидесяти, на праздники или во время встречи послов число блюд было еще больше. Правда, иностранцы отмечали грубость русской кухни, по их мнению, русские чересчур пересаливали пищу и слишком много добавляли в еду чеснока. Сперва ели печенья, потом вторые блюда, а заканчивали обед похлебками. Вместе с царем за отдельным столом обедали знатные бояре и царский духовник, которым царь посылал угощения со своего стола.
После обеда царь ложился отдыхать и спал три часа, что было в обыкновении на Руси. После сна Федор шел на вечернюю церковную службу, после которой до ужина проводил время с царицей. Тут его увеселяли шуты и карлики своими грубыми выходками. Другим любимым развлечением царя были медвежьи бои. Они проходили следующим образом. В огороженный стеной круг выходил человек с рогатиной, на которого выпускали медведя. Если побеждал человек, то единственной наградой ему была возможность напиться до бесчувствия в честь государя за казенный счет. Чтобы иметь возможность так развлекаться, Федор содержал несколько ловчих, в обязанность которых входило отлавливать медведей. Медвежьи бои устраивались обыкновенно по праздникам. Иногда Федор проводил досуг, рассматривая работу своих ювелиров, иконописцев, портных и прочих придворных мастеров.