При бомбардировке и взятии Измаила участвовала значительная часть флотилии под начальством капитана II ранга Попандопуло; а при осаде Браилова, продолжавшейся 50 дней, флотилия, прекратив все снабжения крепости водой и энергично действуя со стороны реки, также много способствовала сдаче крепости. Взятые в Измаиле и Браилове турецкие военные суда поступили в состав флотилии. Боевая молодецкая деятельность флотилии на Дунае заслужила высокую оценку со стороны высшего сухопутного командования.
Дунайская флотилия в 1810 г. содействовала армии при осаде и блокаде крепостей Силистрии и Рущука. Участвуя 26 августа в кровопролитном сражении под Батиным, флотилия заставила уклониться от боя турецкие суда, два из которых были потоплены и пять взяты в плен. Последствием этого сражения была сдача Систова, Журжи, Турно и самого Рущука.
26 июня 1811 г. при истреблении Рущука суда флотилии, пройдя сквозь пылающий мост, забрали все оставшиеся там наши войска и перевезли их на другой берег.
В июле, под начальством Д. С. Акимова [* Дмитрий Сергеевич Акимов – известный деятель русского флота, организатор судостроения на Юге России, капитан- командор. В 1768 г. поступил на службу штурманским ученикам. В 1769-1775 гг. участвовал в Архипелагскай экспедиции. В 1776-1779 гг. на фрегате «Северный орел» плавал из Ревеля в Константинополь и обратно. В 1778 г. произведен в штурманы унтер-офицерского ранга. В 1779-1781 гг. плавал в Балтийском море, В 1781-1782 гг., на корабле «Виктор» ходил из Кронштадта в Ливорно и обратно. В 1782 г, командирован в Таганрог и назначен в штурманскую роту учителем навигации. В 1783-1788 гг., командуя галиотами, плавал в Черном море. В 1787 г. произведен в мичманы, а в 1789 г.- в лейтенанты. В 1791 г. участвовал в сражении с турецким флотом у Варны. В 1793-1796 гг. преподавал в Херсонском кадетском училище. В 1796 г. определен в гребной флот. В 1797-1805 гг. производил опись корабельных лесов в Екатеринославской и Херсонской губерниях, за что награжден бриллиантовым перстнем.], отряд флотилии поднялся вверх по Дунаю и выжег город Лом-Паланку, в котором были истреблены значительные хлебные запасы неприятеля; находившаяся там турецкая флотилия из 120 судов бежала в Видин. Подойдя с 15 судами к стоявшему на берегу лагерю турецких войск, отряд нанес им большой урон и потом огнем своей артиллерии заставил замолчать бывшие на берегу батареи и разрушил их до основания. Он также разгромил три батареи, построенные близ Рущука, и обратил в бегство их гарнизоны. В то же время была захвачена роскошная ставка главной квартиры великого визиря, расположенная у Рущука на правом берегу Дуная, а лагерь турецкой армии, находившийся на левом берегу, напротив Рущука, был окружен нашими войсками. Акимов, 3 октября поставив флотилию против середины лагеря, открыл по нему сильный огонь, продолжавшийся целый день, а к ночи, приблизясь к берегу, выгнал неприятеля из береговых укреплений и, действуя по лагерю, пронизывал его из конца в конец ядрами и бомбами, наносившими страшный вред и не допускавшими турок возобновлять разрушаемые укрепления.
12 октября начались мирные переговоры. Флотилия, поставленная в линию поперек Дуная, совершенно прервала всякие сообщения неприятеля между обоими берегами реки и окруженной нашими войсками турецкой армией. По заключении мира в ноябре 1811 г. суда флотилии были расположены на зимовку в Измаиле и Килии (табл. 3).