Дж. А. Трайкл отмечает, что Гарфилд в письме к другу писал о суде следующее: «Мы ожидали увидеть неотесанного мужика, типичный продукт царской власти… Однако он держался как человек глубоко благородной души и тем самым покорил наши сердца». Турчину инкриминировали молчаливое согласие на ряд расправ, учиненных его солдатами над мирным населением, поведение, недостойное офицера и джентльмена и неподчинение приказам.
Сторонники Турчина утверждали, что военный суд состоял из офицеров, тайно сочувствующих конфедератам и бывших сторонников рабовладельчества. Так это было или нет, но суд признал Турчина виновным. Решением суда полковник Джон Базиль Турчин подлежал исключению из армии США.
Однако этим дело не кончилось. Газеты Севера, особенно в Чикаго, подняли шум, требуя восстановления в правах офицера Турчина, геройски командовавшего Иллинойским полком, а затем и бригадой на полях сражений. Мало того, из Чикаго в Вашингтон во главе с Надин Турчиной отправилась депутация с тем, чтобы вручить президенту Линкольну петицию. Результаты этой акции превзошли все ожидания. Как видно, Линкольн, еще до этих событий имевший намерение повысить Турчина в чине, быстро во всем разобрался и не только восстановил Турчина в правах, но и даровал ему следующий чин — бригадного генерала. Это решение президента, подписанное 17 июня 1862 г., конечно, остановило происки недоброжелателей Турчина.
Теперь Турчин мог вернуться к своим частям, но он медлил. Ему не хотелось возвращаться в свою бригаду опять под команду генерала Бьюэлла, отдавшего его под суд. Он решил выжидать и вернулся в Чикаго, где ему была устроена триумфальная встреча. Жители города преподнесли ему почетный меч.
Генерал Турчин вернулся в армию только в марте 1863 г. и следующие полтора года были, вероятно, самыми блестящими в его военной, боевой карьере. К этому времени генерал Бьюэлл, предавший Турчина суду, сам лишился командования армией за неудачную операцию при Перривилле. Его пост занял генерал майор-Уильямс С. Розекранс. Произошла реорганизация Армии Огайо, и она получила новое название Армии Кумберленда. Этой армии сразу же пришлось вести кровопролитные бои при Стони-Ривер. По сведениям проф. А. Парри в этих боях особенно отличился 19-й Иллинойский полк, командование которым принял бывший помощник Турчина полковник Скотт. Полк понес большие потери и сам Скотт, друг Турчина, погиб в этом бою.
Генерал Турчин, вернувшись в армию, получил под свою команду 3-ю бригаду 4-й дивизии. Это был год, принесший победы Турчину и его бригаде. Замечательными были его участие в сражениях под Чикамогой и за Миссионерский кряж. Своими стремительными и лихими атаками в этих сражениях генерал Турчин открыл путь и дал возможность армии северян войти в Чаттанугу и Ноксвилль.
Год 1863 и особенно сражения под Чикамогой и на Миссионерском кряже явились переломными в этой войне. Первое сражение под Чикамогой произошло 19–20 сентября, когда армия северян встретилась лицом к лицу с главными силами южан. Как всегда в бою, впереди всех шла бригада генерала Турчина. Перед лицом страшного огня южан Турчин приказал бригаде примкнуть штыки и повел своих бойцов в штыковую атаку на позиции южан. Атака была настолько стремительной, что бригада прорвалась сквозь передовые линии южан и оказалась у них в тылу, окруженная явно превосходящими силами противника. Тогда Турчин повернул бригаду и снова отдал приказ «в штыки», на этот раз в обратном направлении. Эта неожиданная новая атака стала известна в истории гражданской войны как Турчинская атака в тылу. Бригада не только вышла из окружения, но еще захватила более трехсот пленных и несколько орудий. Во время этих атак под Турчиным была убита лошадь.
В «Турчинской атаке» погиб русский сержант 19-го Иллинойского полка Александр Смирнов, поступивший в армию северян, чтобы служить под командой Турчина.
В сражении за Миссионерский кряж генерал Турчин командовал 1-й бригадой 3-й дивизии 14-го армейского корпуса. Состав его бригады известен из официального рапорта, в котором Турчин описывал сражение и отмечал отличившихся солдат и офицеров. В бою бригада была в усиленном составе и состояла из следующих полков: 11-го, 17-го, 31-го Огайских, а также 32-го Индианского.
Бригада получила приказ 25 ноября пойти на штурм Миссионерского кряжа вместе с другими бригадами корпуса. Бригады слева и справа, будучи не в состоянии вести наступление под губительным огнем южан, залегли и стали окапываться. Тогда Турчин вскочил, поднял свою бригаду и бросился вверх г. о склону горы. Три полка — 11-й, 31-й и 36-й — были первыми, ворвавшимися на вершину кряжа, в то время как остальные бригады все еще оставались внизу. Вскоре подошли остальные полки Турчина. На вершине бригадой были захвачены три неприятельских орудия.