Серьезный удар по попыткам Михаила Горбачева сохранить СССР был нанесен 29 мая 1990 года избранием Бориса Ельцина Председателем Верховного Совета РСФСР Это прошло в упорной борьбе, с третьей попытки и перевесом в три голоса над кандидатом от консервативной части Верховного Совета Иваном Полозковым. После этого РСФСР взяла курс на провозглашение суверенитета в составе СССР и на признание суверенитета остальных союзных и собственных автономных республик. В результате этого решения российские законы получили приоритет над союзными, усилился «парад суверенитетов», а органы власти СССР начали терять контроль над страной.
12 января 1991 года Борис Ельцин подписал договор об основах межгосударственных отношений РСФСР и Эстонии. В нем стороны признали друг друга суверенными государствами.
Будучи Председателем Верховного Совета РСФСР, Ельцин добился учреждения поста Президента РСФСР и 12 июня 1991 года выиграл всенародные выборы на эту должность. Ссылаясь на множество проблем, образовавшихся из-за неопределенности с ратификаций соглашения о создании СНГ, Борис Ельцин настоял на незамедлительном решении этого вопроса.
12 декабря 1991 года Верховный Совет РСФСР под председательством Руслана Хасбулатова, призывавшего его депутатов сделать это, ратифицировал Беловежское соглашение и денонсировал Договор об образовании СССР. Позднее Государственная Дума Федерального Собрания Российской Федерации и некоторые юристы решили, что он утратил силу еще с принятием первой Конституции СССР в 1924 году.
Против ратификации Соглашения о создании СНГ проголосовали 7 из 246 российских парламентариев: Сергей Бабурин, Николай Павлов, Владимир Исаков,
Илья Константинов, Сергей Полозков, Виктор Балала и Павел Лысов. Воздержались по вопросу о ратификации 5 человек: Ринат Валеев, Хасан Хабибуллин, Людмила Бахтиярова, Зоя Ойкина и Владимир Петров. 34 человека не приняли участия в голосовании, наиболее известные среди них: космонавты Андриян Николаев и Муса Манаров, журналист Александр Любимов, экономист Александр Починок и председатель Верховного Совета Карельской АССР Виктор Степанов.
Депутаты Верховного Совета РСФСР Илья Константинов, Сергей Бабурин и Виталий Севастьянов отмечали, что согласно статье 104 действовавшей на тот момент Конституции РСФСР для ратификации соглашения необходимо было созвать высший орган государственной власти — Съезд народных депутатов РСФСР, поскольку соглашение затрагивало государственное устройство республики как части Союза ССР и влекло за собой изменения российской Конституции.
В апреле 1992 года VI Съезд народных депутатов Российской Федерации трижды отказался ратифицировать соглашение и исключить из текста Конституции РСФСР упоминание о Конституции и законах СССР. Впоследствии это стало одной из причин противостояния Съезда народных депутатов с президентом Борисом Ельциным и привело к разгону Съезда в октябре 1993 года. Конституция СССР и его законы продолжали упоминаться в статьях 4, 102 и 147 Конституции Российской Федерации — России (РСФСР) 1978 года до 25 декабря 1993 года, когда вступила в силу, принятая всенародным голосованием, Конституция Российской Федерации, уже не содержащая упоминания о Конституции и законах Союза ССР.
В сентябре 1992 года группа народных депутатов РСФСР во главе с Сергеем Бабуриным направила в Конституционный суд Российской Федерации ходатайство о проверке конституционности постановлений Верховного Совета РСФСР от 12 декабря 1991 года «О ратификации Соглашения о создании Содружества Независимых Государств» и «О денонсации Договора об образовании СССР». Из-за событий сентября-октября 1993 года, накануне которых суд готовился к рассмотрению этого ходатайства, оно не было рассмотрено.
В сентябре 1998 года на заседании комиссии Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации Руслан Хасбулатов признался, что ратификация Беловежского соглашения была только в компетенции Съезда народных депутатов: «Документ не ратифицирован. С точки зрения Конституции это был вопрос съезда. А то, что принял Верховный Совет, могло иметь всего лишь рекомендательный характер».
В связи с тем что соглашение о создании СНГ не было ратифицировано Съездом народных депутатов РСФСР, комитет Госдумы ФС РФ по делам СНГ и связям с соотечественниками 5 марта 2003 года пришел к заключению, что Российская Федерация де-юре не является государством-учредителем и государством-членом Содружества Независимых Государств.