В то же время Уриу 8 февраля высадил в Чемульпо десант и предъявил русским кораблям требование выйти из гавани. Крейсер «Варяг» и канонерская лодка «Кореец» утром 9 февраля вступили в бой, пытаясь пробиться, но, получив большие повреждения, вернулись в Чемульпо, где были затоплены, а команды свезены на нейтральные корабли.
Для обеспечения дальнейшего развертывания войск, согласно оперативному плану, адмирал Того, державшийся на временной базе около Чемульпо, решил заблокировать русскую эскадру в Порт-Артуре и нанести ей потери бомбардировкой с моря.
Русская эскадра отказалась от активных действий, и 10 февраля все корабли укрылись во внутренней гавани, ограничившись необходимыми мерами для обороны Квантунского полуострова и разведкой в ближайшем районе.
Заграждение внутренней гавани Порт-Артура японцы решили произвести путем затопления брандеров в узком выходе из нее. 20 февраля японский флот вышел из Чемульпо к Порт-Артуру. В ночь на 23 февраля пять брандеров под охраной миноносцев появились перед русскими сторожевыми кораблями, которые при поддержке броненосца «Ретвизан» отбили попытку затопления японских брандеров. На следующий день Того подошел к Порт-Артуру, и, обменявшись выстрелами с русскими крейсерами, свободно вышедшими из гавани, вернулся в Чемульпо, оставив перед Порт-Артуром только один из крейсерских отрядов.
8 марта в Порт-Артур прибыл новый командующий флотом адмирал Макаров, начавший подготовку эскадры к решительным действиям, однако деятельность его оказалась весьма непродолжительной. После неоднократных попыток обстрелять русскую эскадру из-за горы Ляотешань (южная оконечность Квантуна) японская эскадра 13 апреля показалась перед Порт-Артуром. Не имея ясного представления о силах японцев, Макаров со всей эскадрой вышел в море, однако, увидев идущие навстречу японские броненосцы, он решил вернуться к Порт-Артуру и развернуть эскадру под прикрытием береговых батарей. Маневр этот закончился неудачно: флагманский броненосец «Петропавловск» наскочил на одну из мин, расставленных накануне японцами, и погиб. Вместе с броненосцем погиб Макаров со всем своим штабом. Остальные корабли, предполагая появление японской подводной лодки, в беспорядке бросились к Порт-Артуру и заперлись в гавани. Того держался вне выстрелов и к вечеру ушел к берегам Кореи.
Господство японцев на море было в значительной степени достигнуто.
Между тем давно подготовленный авангард 1-й армии Куроки (12-я дивизия) еще 6 февраля начал высадку в Фузане и Мозампо, а после уничтожения «Варяга» и «Корейца» остальные части 1-й армии продолжали высадки в Чемульпо и Цинампо. 13 февраля 12-я дивизия закончила высадку и, выдвинувшись на линию Гензан — Пхеньян, отбросила конные части Мищенко, обеспечив тем самым сосредоточение в Корее остальных частей своей армии, которое было закончено к 16 марта.
Мищенко, очевидно, считал свою задачу по «наблюдению» за противником оконченной и, очистив Корею, отошел на правый берег реки Ялу. 1-я армия Куроки начала осторожное продвижение к реке Ялу.
Дальнейшее развертывание японской армии происходило медленно и осторожно. Если окончательному сосредоточению армии Куроки на Ялу предшествовало завоевание господства на море действиями японского флота у Порт-Артура, то десанту 2-й армии Оку на Ляодунском полуострове и его дальнейшему развертыванию содействовал успех Куроки в бою с Восточным отрядом Засулича у Тюренчена 1 мая. 3 мая армия Оку в составе 1-й, 3-й и 4-й дивизий, погруженная на транспорты, уже закончила сосредоточение в порту Цинампо.
К этому времени Того с главными силами эскадры сосредоточился к островам Эллиот, которые являлись удобной и близкой позицией для наблюдения за Порт-Артуром и прикрытия высадки у Бицзыво, где японцы уже высаживались во время японо-китайской войны в 1894 г. Для переброски передового отряда в Бицзыво Того выделил несколько старых кораблей и канонерских лодок. Другой отряд из крейсеров и миноносцев должен был конвоировать транспорты с главными силами армии. Между островами Эллиот и берегом материка были устроены плавучие боны с минами на случай появления здесь русских миноносцев. Для обеспечения предстоящей высадки японцы в ночь на 2 мая сделали новую неудачную попытку заграждения входа в Порт-Артур. Встреченные огнем с кораблей и береговых батарей большинство из двенадцати японских брандеров погибло, а несколько затонувших в проходе брандеров не препятствовали выходу из гавани.