25 сентября русский посол в САСШ сообщил телеграммой на имя регента, что японцы согласились на условия перемирия и предложили прекратить огонь в 00 часов 27 сентября. Информация была немедленно послана в адрес главнокомандующего Манчжурской армией великого князя Владимира Александровича и командующего Тихоокеанского флота вице-адмирала Чухнина. Сообщение поступила Чухнину через Николаевск-на-Амуре. После переговоров контр-адмирала Небогатова с генералом Каненари о прекращении огня, на Сахалине установлено перемирие.
Тихоокеанский флот России вернулся обратно во Владивосток. В заливе Анива оставлен отряд Небогатова и дивизион истребителей. Развернуты крейсерские дозоры в Лаперузовом проливе и в первом и втором Курильских проливав. Командиры “Штандарта” и “Днепра” получили приказание пополнить запасы угля и провизии и следовать для патрулирования восточного побережья Японии. По-прежнему, ставилась задача не допущение провоза военной контрабанды в Японию. Действия против военных судов и рыболовства в прибрежных японских водах воспрещались. Крейсера вышли в море 29 сентября.
Тем временем политическое давление стало усиливаться и 30 сентября в Сасебо прибыли, согласно коммюнике Форин офиса с официальным визитом, корабли британской дальневосточной эскадры вице-адмирала Ноэля в составе броненосцев: “Глории”, “Альбион”, “Вэнджинс”, “Океан”, “Центурион”; броненосных крейсеров “Сутлей”, “Хог”; крейсеров: “Астрея”, “Ифгения”, “Сириус”. Командующий эскадрой адмирал Ноэль со своим штабом, прибыл в Токио. Прием ему был оказан чрезвычайно восторженный. Город утопал во флагах как после чрезвычайной победы.
Подошедший к Хакодате крейсер “Жемчуг” встал на якорь на внешнем рейде и отправил на катере парламентера с сообщением для Каммимуры, с предложением провести встречу и обговорить условия перемирия, о разграничительной линии на море и других деталях перехода от военного положения к условиям переходного периода. К исходу следующих суток, из Токио получена телеграмма с согласием на проведение встречи на Русских условиях на параллели Хакодате. Обговорен и состав сил при проведении встречи. По получении пакета, адресованного Чухнину “Жемчуг” немедленно вышел в море и ушел во Владивосток. В Манчжурии русский и японский уполномоченные по заключению перемирия генералы Орановский и Фукушима, встретились в 10 часов утра у ст. “Шахедзы” в 19 милях к северу от ст. “Чантуфу”.
В первых числах октября был определен состав Российской делегации на переговорах с Японией. Возглавил делегацию премьер-министр Витте. В ее состав вошли сотрудник министерства иностранных дел Извольский, начальник ГУГШ генерал Палицын, начальник ГМШ контр-адмирал Виренниус. Распоряжением регента делегация убывала в САСШ в кратчайший срок экспрессом в Берлин, затем через Париж в Брест, оттуда на трансатлантике в САСШ. Ламздорфу было поручено провести консультации с министрами иностранных дел Германии и Франции.
В Японском море, на параллели Хакодате встретились для проведения переговоров отряд кораблей Тихоокеанского флота: “Суворов”, под флагом вице-адмирала Чухнина, “Император Александр III”, “Громобой”, под флагом контр-адмирала великого князя Александра Михайловича, “Россия”, “Баян”, “Жемчуг”, и отряд кораблей Объединенного флота: “Асахи”(флаг вице-адмирала Каммимуры), “Сикасима”, “Адзума”, “Сагами”, “Тацута”). Совещание японского и русского адмиралов о разграничительной линии на море и других деталях перехода от военного положения к мирному, происходило на эскадренном броненосце “князь Суворов”. После подписания протокола о перемирии, вице-адмирал Чухнин и контр-адмирал Великий князь Александр-Михайлович нанесли ответный визит к японскому адмиралу на “Асахи”. Было выработано решение по Сахалину, до окончания мирных переговоров, японцам разрешалось вывезти раненых и доставлять продовольствие и фураж (на более одного парохода в 10 суток). Доставка военного снаряжения строго воспрещалась. Все японские суда подлежали досмотру.