17 июля 1610 г. Василий Иванович был свергнут с престола. Бояре и весь народ приговорили: «Бить челом государю царю Василию Ивановичу, чтобы он, государь, царство оставил и взял себе в удел Нижний Новгород». На эту просьбу, сообщенную боярином Воротынским, Василий Шуйский вынужден был согласиться. Через два дня отставленному царю было объявлено, что для успокоения народа он должен принять монашество, и, несмотря на сопротивление и даже отчаянную борьбу, его насильно постригли и отвезли в Чудов монастырь. Постриг приняла и его жена, а братья были посажены под стражу. Затем Шуйский был увезен в Польшу, где и скончался; в декабре того же года был убит и Лжедмитрий II.
Современники и потомки не жаловали Шуйского, нет числа обвинениям, которые возводились на него при жизни и после смерти. Между тем нельзя не признать, что в его жизни было немало моментов, когда он проявлял истинную мудрость, мужество и даже величие души. В 1635 г. прах Шуйского был перевезен в Москву и погребен в Архангельском соборе.
Во главе правительства некому было стать, кроме Боярской думы, и бояре приняли власть до избрания государя. «Все люди, — сказано в крестоприводной записи, — били челом князю Мстиславскому с товарищи, чтобы пожаловали, приняли Московское государство, пока нам Бог даст государя».
Через три дня после пострижения Шуйского в Москву прибыл гетман Жолкевский с польским войском. Бояре волей-неволей вынуждены были согласиться с избранием на русский престол польского королевича Владислава. 27 августа Москва целовала крест на верность Владиславу. По городам были разосланы грамоты с приказом присягать польскому королевичу, и в них говорилось, что по принятии царского титула Владислав примет и православную веру. Однако этот вопрос был отложен на неопределенный срок. В те времена вероисповедание, особенно если это касалось монарха, для русского народа значило очень многое, поэтому народное движение против иноземцев в Московском государстве начало принимать все более религиозный характер. Мнение большинства населения страны было таковым, что иноверец не может быть русским царем, а выбирать необходимо царя из своих природных бояр. На этой волне русское ополчение и одолело иностранных интервентов, поляков и шведов, опираясь на объединенные силы дворянского ополчения и городовых посадов, руководимые князем Пожарским и Кузьмой Мининым, и казачьего войска, возглавляемого князем Трубецким. В октябре 1612 г. Москва была освобождена от поляков, а в феврале 1613 г. в столицу съехались выборные люди от всех русских земель для избрания нового царя.
В неделю православия, 21 февраля 1613 г., в Успенском соборе Московского кремля после торжественного молебна все выборные, от знатного боярина до простого крестьянина и казака, единогласно избрали царем Михаила Федоровича Романова. «Да примет он, — говорилось в избирательной грамоте, подписанной участниками собора, — скипетр Российского царства для утверждения истинной нашей православной веры, и чтобы Господь Бог его государским призрением во всем Московском государстве расточение и разорение исправил и во единое благочестие совокупил и междоусобие утолил и все блага Московскому государству устроил». Здесь же, в Успенском соборе, выборные целовали крест новому российскому самодержцу.
Провозгласив царем шестнадцатилетнего Михаила, собор назначил ехать к нему целую делегацию, включавшую представителей духовенства, боярства, служилых людей и других выборных. Представители собора точно не знали, где находится новоизбранный царь, поэтому в наказе, данном послам, говорилось: «Ехать к государю царю и великому князю Михаилу Федоровичу всея Руси в Ярославль или где он, государь, будет». Послы выехали из Москвы 2 марта, но еще до этого, 25 февраля, по городам были разосланы грамоты с известием об избрании Михаила.
Имел ли Михаил действительные права на российский престол? По прошествии смутных времен именно род Романовых имел хотя и отдаленные, но все же права на престол по ближайшему родству с последними представителями царской династии потомков Ивана Калиты. Михаил приходился двоюродным племянником последнего царя из этой династии — Федора Иоанновича (его мать Анастасия принадлежала к семье Романовых). Отец же Михаила, Федор Никитич, в монашестве Филарет, пользовался большим авторитетом среди духовенства, имея вначале сан митрополита Ростовского, а затем патриарха.
Михаил Федорович (12.07.1596-13.02.1645) принял престол 14 марта, а венчался на царство 11 июля 1613 г. В день венчания дядя государя Иван Никитич Романов держал Мономахову шапку, князь Трубецкой — скипетр, а князь Пожарский — державу, царским же венцом венчал его в соборной церкви митрополит Казанский Ефрем.