Во-вторых он приказал возобновить следствие по "делу" Шуйских. Им припомнили подстрекательство москвичей к бунтам против Федора Ивановича, вмешательство в семейную жизнь царя и обнаружили связи с семьей Нагих (родственников царевича Дмитрия). Результатом стало убийство (или казнь — как посмотреть) наиболее опасных членов фамилии и их сторонников. Князь Иван Петрович Шуйский был умерщвлен в Юрьевском монастыре (удушен дымом), Андрей Шуйский — тайно казнен в самарской ссылке, князь Петр Татев — пострижен в монахи, князь Иван Татев — выслан в ссылку в Астрахань. Афанасий, Михаил и Петр Нагие были принудительно пострижены в монахи и сосланы все в тот же монастырь на языческих землях. В тюрьмы и монастыри были брошены: Иван Крбк-Колычев (тюрьма), Федор Шереметев (пострижен), кнзь Михаил Щербатов — Оболенский (тюрьма), князь Михаил Ноздроватый (ссылка в Муром и таинственная смерть), Афанасий Шейдяков (тюрьма), Ефим Бутурлин (тюрьма), Василий Сукин (тюрьма). ВласаУрусова и Ивана Беклемишева выслали в Сестрорецкое княжество, где они повторили путь Мурат-Гирея, навсегда покинув Россию.
Эти шаги усилили власть Годунова и позволили ему уже через несколько лет проявить милость и помиловать большую часть своих противников. Младшие Шуйские — Василий и Дмитрий уже через полтора года были возвращены в Москву и вновь оказались на ведущих должностях в государстве.
К этому моменту (как раз в 1589 году) Борис Годунов смог добиться блестящей политической победы. Ему удалось возвести своего преданного сторонника — епископа коломенского Иова сначала в архиепископы, а затем (после низложения Дионисия) и в митрополиты. Именно позицией главы московской церкви объясняются столь частые пострижения (и столь выгодные места нахождения монахов, потому как в монастырь на языческих землях ссылали) политических противников Годунова. Но и сам Годунов всецело поддерживал своего ставленника и готов был на любые меры чтобы упрочить престиж Иова. Воспользовавшись приездом патриарха константинопольского (главы всей православной церкви) Иеремии в Москву Борис добился учреждения в России патриаршества. Для этого Иеремию задержали в Москве почти на год и отпустили только после согласия на поставление Иова на патриарший престол. Современники расценивали реформу церкви (учреждение патриаршества) как крупнейший успех Бориса Годунова и Московского царства. Возвышение национальной церкви повысило популярность царского шурина. Раздача вновь учрежденных церковных постов склонила на его сторону высшее духовенство. Церковная иерархия разветвилась: митрополитами стали владыки Новгородский, Ростовский и Сарский (Крутицкий), появились новые архиепископства и епископства. При этом создание Казанской митрополии, во главе которой неизбежно оказывался друг Шуйских и враг Годунова архиепископ Гермоген было задержано и состоялось только через несколько лет.
По описаниям современников церемония избрания патриарха и последовавшие за ней празднества аналогов на Руси не имели. В Москве впервые собрались высшие церковные иерархи Муромского и Сестрорецкого княжеств, т. е. главы мусульманской и языческой церквей (язычников полупринудительно доставил Игорь Кровавый), которые приветствовали Иова. Грандиозные празднества длились сорок дней. Средств на них не жалели. Причем брались они исключительно из царской казны (Игорь Сестрорецкий только предоставил заем, который был позже полностью возвращен).
Борис Годунов (или Василий Щелкалов?) очень быстро вернул все потраченные средства.
Учреждение патриаршества упрочило авторитет и влияние православной церковью Светские власти отреагировали на этот факт достаточно своеобразно. Они приступили к проверке прав и законности земельных приобретений монастырей. За духовенством закреплялись только те земли, владение которыми подтверждалось юридическими документами. Все прочие владения забирались в казну. Эти действия вновь оттолкнули заметную часть священников от Годунова. Он возвеличил церковь, но не завоевал репутации ревнителя и защитника православия. Московская православная церковь разделилась на его сторонников и противников.
Часть 40. Дорога к царскому трону
1590 год прошел, в отличие от предыдущих лет, на удивление спокойно. Ни было ни внутренних потрясений, ни внешних угроз. У Сестрорецкого князя родился сын…
На фоне этого спокойствия Игорь Сестрорецкий смог обратить внимание на события происходившие в Средней Азии и начал готовить войну против Бухарского хана Абдуллы Второго из династии Шейбанидов (создателей Узбекского ханства и старых врагов Сестрорецких князей), сумевшего подчинить себе все государства региона и начавшего серьезно утеснять языческих купцов. Подготовка состояла в создании баз снабжения не только по Иртышу, но и в степях. Также велся поиск союзника, способного напасть на узбеков. Ставка была сделана на молодого иранского шаха Аббаса Второго, которому начали предоставляться денежные средства и поставляться пушки и порох. Игорь Кровавый допустил ошибку и позволил перебраться в Иран нескольким специалистам по литью, что уже через десять лет привело к прекращению пушечной торговли.