Результатом был раскол. Несколько месяцев в ордене шли жаркие диспуты о пределах папской власти, и был даже выбран антимагистр Ростан, который, видимо, был Главным командором в 1162 г. Король Амори попытался примирить противоборствующие стороны в ордене, и, может быть, тем самым он надеялся навязать им свою власть. Понс Бланус и новый Главный командор были вызваны к королю. Понс повторил, что он намерен обратиться в Рим, но Главный командор запретил ему это делать, мотивируя это тем, что такой поступок противоречит обычаям госпитальеров. Понс потребовал, чтобы Капитул рассмотрел это дело и вынес свое решение. Главный командор приказал ему, согласно законам ордена, прежде чем отправиться в Европу, сложить свое оружие и передать ему своего скакуна, но снова запретил ему уезжать. Ситуация еще более осложнилась, потому что Жильбер д’Эссайи, прослышав о хаосе, что последовал за его отставкой, и усомнившись в законности своих действий, постарался вернуться к исполнению своих обязанностей. Его убедили принять участие в ассамблее, проводившейся в Иерусалиме, на которой было решено представить вопрос на рассмотрение папы, и он отправился в Рим, чтобы оправдаться перед папой. Папа Александр III наложил запрет на дальнейшие диспуты, из которых никто не извлек для себя пользы. Папа подтвердил отставку Жильбера и избрание Гастона и ратифицировал документ об ограничении властных полномочий будущих магистров. Жильбер больше не вернулся в Святую землю, и его жизнь окончилась трагически. Он отправился в Англию для встречи с королем Генрихом II, и корабль, на котором он плыл, отойдя на три мили от Дьепа, затонул в Ла-Манше.
Гастон де Мюрель был родом из Оверни, пользовался хорошей репутацией, будучи честным, скромным и добрым. Он был казначеем в ордене, но, вероятно, в едва не наступившем банкротстве ордена в 1179 г. не было его вины. Видимо, братья надеялись, что он сможет восстановить финансовое положение; и, может быть, в том, что этого удалось достичь к концу его правления, была и его заслуга. Однако правление Гастона де Мюреля было коротким, и он умер 20 июня 1172 г.
Ему наследовал Жобер, человек мирный по своему характеру, отнюдь не воин, на что указывают изданные им статуты о попечительстве над пилигримами и церковном служении. Было высказано предположение, что его избрание продемонстрировало реакцию на политику милитаризации ордена, проводившуюся Жильбером. В действительности имеется недостаточно свидетельств этого, и следует подчеркнуть, что его преемник Роже де Мулен, который был именно воином, также был обязан следовать положениям Устава Госпиталя. При Жобере орден продолжал свою политику в военной сфере.
Жобер умер в 1177 г., и состоялось избрание Роже де Мулена Великим магистром. Мало что известно о прошлом Роже, как и о прошлом других магистров XII в. В 1175 г. он был рядовым братом в Антиохии, но неизвестно, занимал ли он какой-либо пост. Однако его можно рассматривать как одного из самых значимых магистров. При его правлении госпитальеры начали играть важную роль во внутренней политике Латинской Сирии. Известно, что он дважды побывал в Европе. В 1179 г. он посетил Сицилию, а в 1184 г. он сопровождал патриарха и Великого магистра ордена тамплиеров в поездке по Европе с целью получить помощь для Латинской Сирии. Возможно, что в связи с визитом к папе во время этого последнего путешествия он получил от Святого престола несколько булл, которые значительно укрепили положение Госпиталя как самостоятельного ордена.
Когда Роже вернулся на Восток, он оказался в центре самой серьезной междоусобной борьбы, какую когда-либо знало Иерусалимское королевство. Он погиб, пытаясь разрешить возникшие противоречия, за которые он сам отчасти нес ответственность. В апреле 1187 г. короля Ги де Лузиньяна убедили начать переговоры с графом Триполийским Раймундом, который был против коронации Лу-зиньяна и намеревался сам стать королем. Балиан Ибелин, архиепископ Тира Йоския, магистр тамплиеров Жерар де Ридфор и Роже де Мулен были посланцами Лузиньяна к Раймунду. 29 апреля они выехали из Иерусалима, сопровождаемые десятью госпитальерами. На следующий день оба магистра и архиепископ поехали вперед, оставив Балиана в Неаполисе (Наблусе). Вечером 30 апреля они достигли замка Ла-Фев, где их ждало послание от Раймунда, предупреждавшее их, что они должны остаться в замке, поскольку в соответствии с договором, который он подписал с Саладином, он, Раймунд, позволил разведывательному мусульманскому отряду вступить в пределы Палестины, пройдя через фьеф своей жены в Галилее.