Заместителем Молотова, который занимался участком внешней разведки, был назначен опытный чекист, в прошлом руководивший работой разведывательных и контрразведывательных подразделений Министерства госбезопасности, Петр Васильевич Федотов. Заместителями председателя Комитета информации стали также заместитель министра иностранных дел Яков Александрович Малик и от Министерства обороны — руководитель советской военной разведки Федор Федорович Кузнецов. Все они представляли в Комитете информации интересы своих ведомств.
Для руководства разведывательными аппаратами за рубежом в КИ был введен так называемый институт Главных резидентов, которыми, как правило, назначались послы или посланники. Первым таким Главным резидентом стал бывший сотрудник ИНО НКВД Александр Семенович Панюшкин. С ноября 1947-го по июнь 1952 года он был послом СССР в США, являясь одновременно Главным резидентом внешней разведки в этой стране.
Однако время показало, что объединение столь специфичных по методам деятельности военной и внешнеполитической разведок в рамках одного органа при всех преимуществах затрудняло процесс управления их работой. Уже в январе 1949 года правительство приняло решение о выведении из Комитета информации военной разведки и возвращении ее в Министерство обороны.
В феврале 1949 года В. М. Молотов покинул пост министра иностранных дел. Комитет информации был передан под эгиду МИДа СССР. Его руководителем стал новый министр иностранных дел Андрей Януарьевич Вышинский. Руководителем КИ он оставался недолго. В том же 1949 году председателем Комитета информации был назначен заместитель министра иностранных дел Валериан Александрович Зорин. Его первым заместителем, ответственным за работу внешней разведки, стал Сергей Романович Савченко, до этого возглавлявший Министерство государственной безопасности Украины.
В ноябре 1951 года правительство приняло решение об объединении внешней разведки и внешней контрразведки, которые до этого действовали по большей части самостоятельно, под руководством Министерства государственной безопасности и о создании за границей единых резидентур. Комитет информации при МИДе СССР перестал существовать. Внешняя разведка стала Первым главным управлением Министерства государственной безопасности СССР.
В период деятельности Комитета информации Александру Сахаровскому пришлось неоднократно выезжать в многомесячные оперативные командировки за границу: в Финляндию, Грецию, Турцию и Болгарию. Он приобрел опыт выполнения серьезных специальных оперативных заданий за рубежом. С поставленными перед ним задачами успешно справлялся, о чем свидетельствовали характеристики за тот период. В одной из них подчеркивалось: «Во время спецкомандировок за границу правильно решал поставленные перед ним задачи, умело руководил агентурой в деле оказания влияния на общественно-политические круги в нужном СССР направлении».
В декабре 1948 года Сахаровскому было присвоено звание полковника, а в 1951 году он был награжден орденом Красной Звезды.
Работа в центральном аппарате внешней разведки также вызывала у Александра Михайловича полное удовлетворение. В то же время его настораживали некоторые моменты, имевшие место непосредственно «в конторе».
Так, в первые послевоенные годы из разведки были уволены опытнейшие сотрудники: генерал-лейтенант Павел Фитин, генерал-майоры Гайк Овакимян и Василий Зарубин, полковники Константин Кукин, Георгий Мордвинов, подполковники Семен Семенов и Елизавета Зарубина. По «делу о сионистском заговоре в МГБ» были арестованы и провели около двух лет в заключении генерал-лейтенант Михаил Белкин, генерал-майор Наум Эйтингон, полковники Лев Василевский и Норман Бородин, видные разведчики-нелегалы Борис Афанасьев и Владимир Правдин.
Особую тревогу у Александра Сахаровского вызывала судьба людей, которых он лично хорошо знал, работая с ними в Ленинграде, и которые оказались связаны с так называемым «ленинградским делом».
«Ленинградское дело»
В наши дни под термином «ленинградское дело» подразумевается серия судебных процессов, состоявшихся в конце 1940-х — начале 1950-х годов над группой ленинградских партийных и советских деятелей, часть из которых оставалась после Великой Отечественной войны на высоких руководящих должностях в городе и области, а другие были выдвинуты на высокие посты союзного масштаба.
Жертвами «ленинградского дела» стали: секретарь ЦК ВКП(б) Алексей Кузнецов; первый секретарь Ленинградского обкома партии Петр Попков; председатель Госплана СССР Николай Вознесенский; председатель Ленгор-исполкома Петр Лазутин; председатель Совета министров РСФСР Михаил Родионов; первый секретарь Ярославского обкома ВКП(б) Иосиф Турко; второй секретарь Ленинградского горкома ВКП(б) Яков Капустин; управделами Ленинградского обкома и горкома ВКП(б) Филипп Михеев и ряд других ответственных партийных и советских руководителей.