В начале XXI века для рядового обывателя сексология предстает всё в том же зачаточном состоянии, что и десятилетия назад. До сих пор официально признанной остается только медицинская сексология, называвшаяся в советские времена сексопатологией. Правда, и в этой, признанной более двадцати лет назад отрасли медицины, весь научно-педагогический потенциал исчерпывается единственной кафедрой медицинской сексологии Санкт-Петербургской медицинской академии последипломного образования, руководимой профессором Б. Е. Алексеевым, курсом медицинской сексологии при кафедре психотерапии Российской медицинской академии последипломного образования, руководимой профессором В. В. Макаровым, отделением сексуальной патологии Московского НИИ психиатрии, руководимым профессором Н. Д. Кибриком, и лабораторией судебной сексологии Государственного научного центра социальной и судебной психиатрии им. В. П. Сербского, руководимой профессором Г. Е. Введенским. Для сравнения стоит сказать, что к началу ХХI века в составе научных учреждений Минздрава насчитывалось 11 институтов гельминтологии.
Нормативные документы министерства здравоохранения предусматривают, что каждый врач должен ознакомиться с основами сексологии в объеме 20 учебных часов, но на деле лишь немногие медицинские ВУЗы выполняют это скромное требование. В структуре высшего психологического образования и профессиональной переподготовки нет единых аттестационных требований по объему часов изучения этого предмета и профессиональной компетенции в проблемах сексологии. Поэтому преподавание сексологии осуществляется преимущественно по авторским программам. Некоторые из таких программ носят культурологический характер, другие отличаются значительной психоаналитической нагрузкой и лишь немногая часть ориентирована на изучение психосексуального развития и консультирование лиц с проблемами сексуального характера. Подготовка научных кадров осуществляется в аспирантуре указанных НИИ и кафедр, а практические врачи проходят первичную постдипломную специализацию на кафедрах в Москве и Санкт-Петербурге или в клинической ординатуре указанных НИИ. Дальнейшее последипломное образование подразумевает прохождение аттестационных циклов и получение сертификата специалиста (врача-сексолога) каждые пять лет. Сегодня в каждом субъекте Федерации в системе государственной медицины насчитываются единичные специалисты, осуществляющие бесплатный прием лиц с половыми расстройствами, а остальные потребности населения в профессиональной сексологической помощи покрываются специалистами частных клиник. Сеть этих клиник значительно развита в крупных городах, но, к сожалению, стоимость лабораторного и аппаратного обследования в десятки тысяч рублей часто оказывается непосильной даже для многих представителей среднего класса. Поскольку стоимость врачебного приема в этих клиниках оказывается значительно ниже, чем стоимость аппаратных процедур, последние часто подменяют необходимую психотерапевтическую работу, что сказывается на результатах лечения.
Негосударственный сектор сексологии, несмотря на все сложности работы общественных неправительственных организаций в России, все же получил известный импульс к развитию. Незадолго до распада СССР была организована Всесоюзная ассоциация сексологов-практиков, куда по разным причинам не вошли руководители кафедр, научных отделов и корифеи отечественной сексологии. После распада СССР эта ассоциация просуществовала некоторое время под названием Евразийской ассоциации сексологов, но на рубеже веков прекратила свое существование в связи с распадом профессиональных и личных связей между специалистами постсоветского пространства. Как и большинству других профессиональных ассоциаций, этому профессиональному объединению не удалось добиться прав на профессиональное обучение и аттестацию специалистов, контроля над их деятельностью в регионах, формирования новых рабочих мест на бюджетной основе, регулярного проведения конференций и решения других задач. Несмотря на то, что эта ассоциация недавно перерегистрировалась под вывеской Российской ассоциации сексологов, она растеряла старых членов и, не приобретя новых, превратилась в своеобразное судилище, занятое бесконечным разоблачением и изгнанием своих членов. В феврале 2011 г. состоялось судебное заседание по иску Министерства юстиции РФ к Российской ассоциации сексологов (РАС – президент Диля Дэрдовна Еникеева) о признании РАС недействующей организацией. Симоновский районный суд Москвы признал РАС прекратившей свою деятельность и исключил ее из реестра юридических лиц, поэтому Российской ассоциации сексологов, как организации, сегодня уже не существует.