Перед Сибисполводом стояли большие проблемы, в первую очередь разработка и решение всех вопросов, связанных с использованием водной энергии рек Сибири, проведение исследований и изысканий в этой области, а также проектирование и надзор за всеми установками, работающими на белом угле. Приступая к их разработке, руководитель Сибисполвода активно содействовал возникновению районных отделений Бюро — в Иркутске, Красноярске, Томске, Семипалатинске, Бийске. В короткий срок были выявлены потребности в электроэнергии и намечены места возможного размещения гидроэлектростанций, организован ряд экспедиций (руководитель — инженер В. В. Петров). При этом С. А. Балакшин, будучи опытным инженером-организатором, понимал, что для решения грандиозных задач по электрификации Сибири необходимо привлечь крупных специалистов из различных областей научных знаний (см. прил.). Такие специалисты имелись в Томске, в частности в Томском технологическом институте и Томском государственном университете. Труды некоторых ученых этих учебных заведений были известны не только в нашей стране, но и за рубежом.
Благодаря энтузиазму и энергии С. А. Балакшина многие научные работники томских вузов становятся активными деятелями Сибисполвода. Так, в его состав на правах постоянных научных консультантов вошли профессора: гидролог Я. Т. Ненько, электротехник Н. М. Обухов, экономист А. П. Огановский, гидравлик В. Н. Пинегин, ректор Томского университета электрохимик А. П. Поспелов, электротехник А. А. Потебня. В качестве научного консультанта к работе в Бюро был привлечен большой знаток Сибири профессор Томского университета В. В. Сапожников. В деятельности Сибисполвода по инициативе С. А. Балакшина участвовали также ученые и технические специалисты из других сибирских городов, например, жившей в Омске профессор В. А. Ванюков.
Имея очень ограниченные средства и малочисленный штат, испытывая недостаток в оборудовании, руководство Сибисполвода все же приступило к работам по выявлению мест, откуда можно было бы срочно наладить подачу электроэнергии на промышленные предприятия Сибири. В 1920 и 1921 гг. Сибисполвод направил несколько поисковых отрядов в горные районы Сибири (Алтай, Саяны и др.). Цель таких экспедиций — конкретные исследования небольших горных рек, энергию которых можно было быстро и эффективно использовать для нужд промышленности без значительных капитальных вложений. При этом учитывалось экономическое положение страны и необходимость быстрого восстановления и подъема ее народного хозяйства. Энергетические же возможности больших сибирских рек (Обь, Енисей, Амур, Лена) в основном определяли по материалам и данным научной и технической литературы. Строительство в Сибири мощных гидроэлектростанций представлялось делом будущего. Как известно, в наши дни сооружены и дают ток такие сибирские гиганты, как Братская и Усть-Илимская ГЭС на Ангаре, Саяно-Шушенская и Красноярская на Енисее и ряд других. Но в начале 20-х годов С. А. Балакшин и его коллеги могли об этом только мечтать. И все же их дела, имеющие важное народнохозяйственное значение, приближали будущее сибирской гидроэнергетики.
В 20-е годы одним из наиболее значительных месторождений полезных ископаемых в Алтайском округе являлось Риддерское месторождение руды. Силовое хозяйство рудника работало на каменном угле. Но его привозили издалека, что было экономически крайне невыгодно. Риддерский рудник (с 1941 г. Лениногорск) до октября 1917 г. был концессией английской компании, которая пыталась использовать водную энергию р. Громотухи и даже составила несколько проектов постройки гидроэлектростанции на р. Громотухе с мощностью около 3000 кВт. Однако они не были осуществлены: Советская власть ликвидировала концессию.
Проекты строительства гидростанции на р. Громотухе сохранились. Их анализ и разработка путей возможной реализации и были поручены экспедиции Сибисполвода на Алтае в 1920 г. Четыре партии Алтайской экспедиции обследовали около 13 тыс. км2 площади бассейнов ряда рек, например поймы рек Громотухи и Ульбы, была изучена р. Уба с ее притоками реками Белой и Черной Убой. В ходе работ были выявлены потенциальные запасы водной энергии на р. Убе (от 40—200 тыс. кВт) и на р. Ульбе (15 — 80 тыс. кВт), намечены створы для строительства гидроэлектростанций, основаны водомерные посты и метеорологические станции, проведены необходимые топографические съемки и нивелировки, определены расходы воды для некоторых створов и собраны коллекции минералов. Кроме того, участники экспедиции осмотрели ГЭС на р. Тургусун (приток р. Бухтармы), плотину которой разрушил весенний паводок. Эта гидроэлектростанция была спроектирована и построена иностранной компанией еще до Октября 1917 г.