Начиная с III века, римляне стали отступать под натиском германских племен.
В 264 году в Гельвецию вторглись алеманны, и они разрушили Авентикум, который так и не смог более возродиться и потерял всякое значение.
В IV веке, вследствие потери земель на правом берегу Рейна, Гельвеция приобрела для Рима особое значение: здесь стали строить новые крепости и разбивать лагеря, но все оказалось напрасно.
В 406–407 годах восточную Швейцарию завоевали алеманны, а в 470 году западная Швейцария подпала под власть бургундов. И те, и другие в те времена были варварами и язычниками.
Алеманны успели почти совершенно уничтожить следы римского влияния (в том числе христианство), и уже романизованные области совершенно германизировать. Именно они всего более могут считаться предками нынешних обитателей немецкой Швейцарии; примесь кельтских и романских элементов там сравнительно слаба.
И в позднейшие времена, когда значительная часть Европы приняла римское право, право немецкой части Швейцарии подверглось римскому влиянию лишь в весьма незначительной степени (оно, кстати, и поныне носит гораздо более чистый германский характер, чем право самой Германии). Со своей стороны, западная Швейцария осталась романской, так как бургундам практически не удалось подчинить завоеванную ими часть Гельвеции своему влиянию. Юго-восток (нынешний кантон Граубюнден), попавший под власть остготов, сохранил свой ретророманский язык и отчасти римскую культуру, а вот Тичино в последующую лангобардскую эпоху в еще большей степени подчинился римскому влиянию. Таким образом, по языкам Швейцария уже в V веке была разделена на те же четыре группы, что и теперь, и даже границы между ними, заданные горами и реками, были почти такими же, что и сейчас.
Средневековая Швейцария
Как и в остальной Европе, в Швейцарии в Средние века господствовала феодальная система. С IV века на эту территорию начало проникать христианство, а в VII веке его влияние значительно усилилось благодаря странствующим монахам из Ирландии. Один из них, Святой Галл или Галлус из Лейнстера (по некоторым версиям, его имя было Келлах), поселился в восточной Швейцарии и в 613 году основал монастырь Санкт-Галлен (Святого Галла). Позднее вокруг монастыря вырос город Санкт-Галлен, центр одноименного кантона, а сам монастырский комплекс в 1983 году был внесен в список объектов Всемирного наследия ЮНЕСКО как «совершенный образец большого монастыря эпохи Каролингов».
В IV–VIII веках Швейцария, как и ее соседи, была разделена на небольшие королевства. Когда королем франков стал Карл Великий (в 768 году), в Западной Европе образовалась мощная империя. Карлом (или Шарлеманем, как его называют французы) Швейцария была разделена на десять графств.
В 843 году Верденский договор о разделе империи Карла Великого поделил Швейцарию на части: западная часть вместе с Бургундией и южная часть вместе с Италией отошли к императору Лотарю I, а восточная часть со всей Алеманнией – к королю Людвигу Немецкому. В этой части Швейцарии видную роль начал играть город Цюрих.
Затем Людвиг Немецкий расширил владения и права ранее существовавшего монастыря Санкт-Галлен, который в следующие века был важным центром просвещения в Швейцарии.
Распадение монархии Карла Великого ослабило ее; короли не всегда могли защищать свои владения от набегов полудиких варваров. В Х веке Швейцарии стали угрожать с востока венгры, с юга – сарацины. В 917 году первые разграбили Базель, в 926 году – Санкт-Галлен; в 936–940 годах сарацины опустошили Хурретию (Граубюнден), сожгли в Валлисе монастырь Святого Маврикия и ограбили Ваадт.
В 911 году образовалось герцогство Алеманния, и восточная Швейцария вошла в его состав.
В 1032 году, во время правления императора Конрада II, Бургундия стала частью Священной Римской империи, и в течение трех столетий после этого судьба Швейцарии находилась в зависимости от германских императоров. Только Тессин, или Тичино, да небольшая часть Граубюндена, тесно связанные с Миланом, зависели от императоров лишь постольку, поскольку они одновременно были еще и итальянскими королями.
С увеличением могущества отдельных феодальных правителей, старые Алеманния и Бургундия распались на множество отдельных владений. А на территории нынешней Швейцарии в конце XI и начале XII веков, наряду со многими другими графскими и герцогскими родами, особенно возвысились графы (с конца XI века – герцоги) Церингены. Они сначала владели графством Тургау, но постепенно получили еще и различные владения от Женевского озера до Ааре. Кроме того, они имели право наследственного фогтства в Цюрихгау (в той его части, которая не зависела от Цюрихского монастыря), а в 1127 году получили звание наместников Бургундии.