Другой горный массив на территории парка — Вирунга расположен в южной части и имеет иное (отличное от Рувензори) происхождение. Массив Вирунга образовался в расширении днища Центрально-Африканского грабена и представляет собой скопления конусовидных и щитовых вулканов.
В состав национального парка Вирунга входят территории с вулканами Карисимби (4506 м, высшая точка массива Вирунга), Микено, Високе, Сабнньо, Ньямлагира (3056 м) и Ньирагонго (3469 м). Два последних весьма активны. Извержение Ньирагонго в январе 2002 г. разрушило 14 деревень и приблизительно половину города Гома на берегу озера Киву. Вулкан Ньямлагира дважды извергался в том же году.
У подножия вулканов лежат равнины, перекрытые лавовыми потоками. В дождевой тени гор они получают меньше осадков — около 500 — 700 мм в год, и там растут ксерофильные леса и кустарники.Но на склонах вулканов количество осадков вновь возрастает до 1500 мм. Высотные пояса и массиве Вирунга в общем похожи на пояса в горах Рувензори: присутствуют и горный лес (1750 — 2600 м), и бамбуковые заросли, и альпийские луга; нет только пояса верещатников.
Фауна птиц на территории парка очень разнообразна: обнаружено более 800 видов, 24 из них — эндемики Внрунги. Во влажных местообитаниях это цапли, ибисы, выпи, змеешейки, бакланы, водорезы, китоглавы, скопы, чайки, франколины, славки, ткачики. утки, гуси. Много пеликанов обитает в низовьях реки Рутшуру. Редкие виды птиц встречаются на различных поясах вулканического высокогорья: славка — в высокогорных болотах: нектарница Рокфеллера — в бамбуковом поясе, лесных и верещатниковых зарослях; горный астрильд и нектарница — на альпийских лугах; бананоед, франколин, земляной дрозд и китоглав — в горных лесах.
Ихтиофауна озера Эдуард сильно обеднена. Зато на территории национального парка Вирунга много беспозвоночных. Обычны змеи, среди них — питоны, кобры и зеленая мамба.
В центральном секторе национального парка около половины территории занято под плантации кофе и чая, заготовки древесины, сбор топлива и строительство жилищ. Разросшиеся рыболовецкие деревни устрожают целостности парка и сохранности его рыбных ресурсов. В этой части Вирунги происходят неконтролируемая золотодобыча и выпас скота.
Благодаря своему горному рельефу Вирунга отличается максимальным разнообразием местообитаний растений и животных на небольшой территории. Это один из самых густозаселенных районов материка. Ограниченность территории — причина переходящих одна в другую гражданских войн, что создает существенную угрозу для сохранения этого уголка дикой природы.
В настоящее время территория парка на протяжении полусотни километров соприкасается с землями национального парка Рувензори в Уганде (99.6 тысяч га) и национального парка вулканов в Руанде (15 тысяч га). Вместе с этими и другими, более мелкими по площади охраняемыми территориями, с которыми парк напрямую не граничит. Вирунга образует основу для трансграничного резервата на территории Демократической Республики Конго, Уганды и Руанды.
Уникальность природы Вирунги подчеркивается тем, что в числе первых, еще в 1979 году, она вошла в список всемирного природного и культурного наследия ЮНЕСКО, цель которого — способствовать охране памятников природы и культуры, имеющих значение для всего человечества. Тем печальнее, что в 1994 году парк внесен в Список объектов всемирного наследия, находящихся под угрозой. Причинами этого стали гражданская война в Руанде, хлынувшие на территорию парка толпы беженцев, неконтролируемое браконьерство, обезлесение и деградация природы.
Наиболее сложная ситуация сложилась в северном секторе парка — он просто опасен для патрулирования. После гражданской войны много оставленного войсками оружия попало в руки браконьеров и местного населения, что представляет угрозу как для редких животных, так и для людей.
Геология парка Вирунга. С точки зрения геологии местоположение парка выдающееся. Он лежит в пределах западной ветви Восточно-Африканского рифта — самой длинной трещины в земной коре на планете. Рифт длиной около 6 тысяч километров проходит по территории 20 стран: от Сирии в Азии до Мозамбика на юге Африки. Образование земной коры в трещине продолжается до сих пор, поэтому вдоль рифта часты извержения вулканов и землетрясения. Территория парка вытянута с севера на юг вдоль зоны разлома и состоит из трех практически изолированных друг от друга частей. Северный сектор Парка включает горы Рувензори и долину Семлики, центральный — озеро Эдуард и равнины Рвинди, Рутшуру и Ишаша к югу от него; южный сектор занимает лавовые плато Ньямлагира, Ньирагонго и северо-западную часть вулканического массива Вирунга. Все три части парка различны по происхождению и природным особенностям.