На Балканах эсэсовцы развернули широкомасштабную подготовку активистов различных праворадикальных движений к антисоветской борьбе. Эмиссары Скорцени наладили сотрудничество с представителями румынской "Железной гвардии", албанской "Бали комбетар", греческой ЭДЕС, венгерскими "Скрещенными стрелами" и сербскими четниками. Это сотрудничество позволило Скорцени после войны находить нужных людей во всех европейских странах. Межнациональные и межконфессиональные противоречия на Балканах не дали немцам широко использовать антисоветских партизан в конце войны.
Зато на Востоке люди Скорцени смогли организовать разветвленную сеть антисоветского сопротивления. "Человек со шрамами" лично несколько раз встречался с генералом А.А. Власовым. Подводя итог этим встречам, диверсант № 1 записал: "Власов произвел на меня впечатление человека, который хочет, чтобы Россию перестали считать азиатской страной и она приняла участие в строительстве более сильной и процветающей Европы". Позже Скорцени вместе со служащими "Цеппелина" помогал власовцам организовывать свою спецслужбу. Правда, своих русских подчиненных Скорцени так и не передал Власову.
"Человек со шрамами" имел контакты и с Организацией украинских националистов Степана Бандеры и даже совместно проводил с ними операцию "Бурый медведь" — эвакуацию немцев из лесных массивов Украины.
В полосе действия группы армий "Север" истребительное соединение имело больший успех. Осенью 1944 года чинами истребительного соединения СС "Ост" на территории Латвии была образована диверсионно-террористическая группа "Межа Кати" ("Дикая кошка"). Группа создавалась для оседания в тылу советских войск и проведения террористических действий. Начальником группы был гауптштурмфюрер СС Янкаус. Латыши подготовили для заброски в советский тыл 64 отдельные группы, общей численностью 1164 человека. "Дикие кошки" продолжали сопротивление в Латвии до лета 1947 года.
В целом ставка гитлеровцев на партизанскую войну против союзников, как на территории Германии, так и за ее пределами, не дала ожидаемых результатов. Об относительном успехе можно говорить лишь в Прибалтийских республиках.
План спасения "Альпийский редут"
30 марта 1945 года Скорцени получил приказ передислоцироваться со своими штабом и частями в район т. н. Альпийской крепости. Здесь гитлеровцы планировали дать свой последний бой войскам союзников, а при удачном стечении обстоятельств вести длительную партизанскую войну. Ну а теперь догадайтесь, кто к этому времени был главным специалистом в Рейхе по партизанской войне? Верно — Скорцени. Но было одно НО — диверсионные части Скорцени были существенно потрепаны, а некоторые и уничтожены, вести же партизанскую войну силами партийной организации было плохой альтернативой.
Что же нацисты подразумевали под Альпийской крепостью? Последней твердыней нацистов должен был стать укрепленный участок местности в Альпах, примерно 350 км в длину и 75 км в ширину. Он протянулся от Брегенца на западе до Бад-Аусзее на востоке, через Фюссен, Траунштейн и Зальцбург на севере, Глоренцо, Больцано и Линц на юге. После 29 апреля 1945 года (капитуляция немецких войск в Италии) южная граница района крепости прошла по перевалу Бреннер.
Приказ есть приказ. Скорцени вздохнул и стал собираться в Альпы, попутно собирая остатки своих частей. По дороге в Альпы Скорцени встретил генерал-фельдмаршала Шернера и был вынужден передать в его распоряжение остатки истребительного соединения СС "Ост" II. В начале апреля 1945 года под угрозой взятия оказалась Вена. К этому времени в городе оставались жена и дочь Скорцени, а также истребительное соединение СС "Зюдост". Скорцени решил забрать семью и сослуживцев из города и после 10 апреля отправился в путь. Родной город встретил "человека со шрамами" хаосом. Добравшись до штаба "Зюдоста", Скорцени отдал распоряжение уйти из города. Батальон отступил в район севернее Кремса, а ягдкоманда "Дунай" в школу боевых пловцов в Диана-Баде.
Затем Скорцени отправился в штаб гауляйтера Вены Бальдура фон Шираха. Он попытался объяснить гауляйтеру всю тяжесть положения города, но фон Ширах был оптимистично настроен и рассчитывал отбить натиск советских войск двумя мифическими дивизиями СС, существовавшими лишь в его воображении. В заключение гауляйтер пообещал Скорцени победить или погибнуть в Вене, а спустя несколько часов оставил город.
Исполнив служебные обязанности, Скорцени отправился к родному дому, предвкушая скорую встречу с семьей. Добравшись до дома, Скорцени с ужасом увидел, что его дом частично разрушен. Он бросился к соседям в надежде прояснить судьбу своей семьи. Оказалось, что мать, жена и дочь Скорцени выехали из города несколько дней назад. Неизвестность пугала оберштгурмбаннфюрера СС, но он не мог изменить хода событий. Оставляя город, Скорцени отправил радиограмму в ставку: "Все указывает на то, что Вена будет сдана сегодня, 11 апреля".