Вернувшись в район "крепости", Скорцени принялся упорядочивать расположение своих людей. Военнослужащие истребительных частей были размещены им в ключевых пунктах "крепости": Хохкениге, Лофере, Альт Аусзее, Миттерндорфе, Альтенмаркте, Бишофсхофене, Китцбухеле. Майсхофене-Заалбахе. Отряды в этих пунктах возглавили исключительно офицеры истребительных соединений. Для связи каждый отряд получил беспроводные рации. Свой штаб Скорцени разместил в местечке Аннаберг.
В один из апрельских дней Скорцени был произведен в чин штандартенфюрера СС, правда, соответствующая запись в его учетной карточке отсутствует, но, возможно, это объясняется суматохой последних дней войны.
После полудня 30 апреля 1945 года в Альпах стало известно о смерти Гитлера. На следующий день по радио передали обращение нового руководителя Рейха гросс-адмирала Карла Деница к нации:
"Немецкие мужчины и женщины!
Солдаты вермахта!
Наш фюрер, Адольф Гитлер, погиб. Немецкий народ в глубокой скорби и уважении склоняется перед героической личностью фюрера. Его жизнь была образцом служения нашему народу. Он своевременно разглядел страшную опасность большевизма и посвятил себя борьбе с ней не на жизнь, а на смерть. В конце борьбы и своего непоколебимого прямого жизненного пути он геройски погиб в столице немецкого рейха. Придет день, когда Европа и весь мир узнают, что Адольф Гитлер пытался спасти Европу и весь мир от большевистского нашествия. Фюрер назначил меня своим преемником. Я беру на себя ответственность за судьбу немецкого народа в тяжелейшие часы его истории. Моей первейшей целью является спасение немцев от уничтожения их большевиками, рвущимися вперед. В соответствии с этой целью война продолжается. До тех пор пока англичане и американцы мешают достижению этой цели, мы должны также защищаться от них и продолжать работу против них. Таким образом, англосаксы ведут войну не в интересах своих народов, а способствуют распространению большевизма в Европе.
То, что немецкий народ совершил в упорных боях на фронтах этой войны, и то, что перенес в тылу, с исторической точки зрения — неповторимо. В это тяжелое время для нашего народа я буду стремиться к тому, чтобы создать для наших храбрых женщин, мужчин и детей необходимые условия жизни. Я сделаю все, что зависит от меня. Но для этого мне нужна прежде всего ваша помощь. Доверьтесь мне, так как ваш путь — это мой путь. Сохраняйте полный порядок и дисциплину в городе и деревне. Каждый выполняй свой долг на своем месте. Только так мы сможем облегчить страдания, которые принесет каждому из нас это время, и сможем предотвратить катастрофу. Когда мы сделаем все, что в наших силах, Бог после стольких страданий и жертв не покинет нас".
Смерть Гитлера сломила даже самых оголтелых нацистов. Воля к сопротивлению была утрачена. Несмотря на ото в своем обращении к солдатам Дениц заявил: "Я принимаю на себя Верховное командование всеми вооруженными силами Германии в стремлении продолжать борьбу с большевиками до тех пор, пока действующие части и сотни тысяч семей из восточных районов страны не будут спасены от порабощения или уничтожения. Против Англии и Америки я должен буду продолжать борьбу до тех пор, пока они будут мне мешать в борьбе против большевиков <…>
Отто Скорцени после сдачи в плен
Присяга, данная вами фюреру, в дальнейшем безоговорочно относится ко мне как к преемнику, назначенному фюрером. Немецкие солдаты, выполните ваш долг! Речь идет о самой жизни нашего народа". Однако уже ничто не могло остановить наступающие войска союзников. Скорцени, правда, собирался сражаться… 1 мая он получил последний приказ, ему поручилось оборонять перевал в южном Тироле, через который должны были пройти отступающие из Италии войска. Однако эти войска капитулировали еще 29 апреля. 7 мая 1945 года Дениц приказал немецким войскам прекратить сопротивление, а 8 мая Скорцени распустил своих людей, но многие остались в районе Альпийской крепости. С ним лично осталось лишь несколько человек, они укрылись в м. Дахтейн. Для Скорцени и многих людей Вторая мировая наконец закончилась.
Свидетель
После капитуляции со Скорцени остались верный Радль, "китаец" Хунке и трое солдат. Пару недель они прятались в горном домике над Радштатской долиной. Пребывание в неизвестности сильно томило добровольных изгнанников. В тысячный раз обдумав и обсудив сложившееся положение, Скорцени и его товарищи решили сдаться англо-американцам. 20 мая 1945 года шестеро мужчин в униформе СС спустились в долину и обратились в ближайшую американскую комендатуру у Аннаберга. В комендатуре Скорцени и его спутники не вызвали никакого интереса — им предоставили машину и отправили в Зальцбург, вероятно для устройства в лагерь военнопленных.