Решению вопроса о церковной десятине и взносах в папскую курию маркграфу Альбрехту II помешала вскоре начавшаяся война Бренденбурга с Данией и Померанским княжеством, поглотившая все средства маркграфа. Альбрехт II помирился с епископом Балдуином, пообещав ему десятину со вновь присоединенных к марке земель. Епископ на время воздержался от жалоб папе на притеснения со стороны маркграфа.
Вопрос о десятине вновь был поднят в 1234 г. Об этом свидетельствует письмо папы Григория IX от 18 февраля того же года [См.: 92, № 617]. Не отказываясь от выплаты десятины, маркграфы собирались вносить ее только со старых земель, а не со вновь присоединенных к марке. Таким образом, десятина поступала в пользу местной церкви не более чем с половины земель бранденбургского диоцеза, что причиняло местному духовенству значительный ущерб. Епископы снова обращались с жалобами к папе. В ответ на жалобы папа советовал бранденбургскому епископу самому договориться с маркграфам и обещал свое содействие в качестве третейского судьи [См.: 92, № 618].
Некоторое время спустя, курия направила двух священников из Мерзебурга в качестве своих эмиссаров. Маркграфу пришлось признать право епископов на десятину как со старых, так и с новых земель. Отныне она должна была выплачиваться в размере 2 динариев с гуфы. Епископы получили по 100 гуф невозделанной земли в старых и во вновь присоединенных землях. Рассматривался вопрос и о границах территорий, с которых уплачивалась десятина. В новых землях каждая из церквей получила земельное владение в четыре гуфы. Таким образом, только в середине XIII века в бранденбургском и гавельбергском епископствах, охватывающих территорию маркграфства Бранденбург, был упорядочен вопрос о десятине.
И в дальнейшем маркграфы не собирались предоставлять местной церкви никаких привилегий. Укрепляя свою власть, братья-маркграфы обзаводились только своими собственными монастырями, чтобы не допустить усиления церкви. На территории марки были основаны монастыри францисканцев, доминиканцев, премонстерианцев, цистерцианцев и один бенедиктинский в Шпандау. Маркграфы охотно шли на создание новых монастырей под своим патронатом, потому что это способствовало оживлению хозяйственной деятельности в крае. Особенно значительную роль в колонизации славянских земель играли цистерианские монастыри. Кроме того, «частная церковь» (Eigenkirche) была той формой церковной организации, которая позволяла феодалам увеличивать свое землевладение и подчинять себе церковь.
Вассалы маркграфов тоже основывали монастыри, нередко совместно с ними. В 1246 г. в Новом Рушійне Герхардом фон Анштайном был основан доминиканский монастырь, а в 1230 г. — монастырь в Линдове. Другой вассал маркграфа Ганс в своих владениях, расположенных в местности Пригниц (Передняя марка), основал монастырь Штепинец. Частная церковь имела свое целевое назначение: она служила своеобразной формой «вспомещения земельной собственности». Отведенная ей земля не уходила из рук основателя и продолжала приносить ему известный доход… «Она дополняла аппарат его вотчинной власти». [13, с. 185].
Осваивая новые земли, светские землевладельцы устанавливали патронат над местной церковью. Д. Н. Егоров подчеркивает, что даже размещение церквей и приходов, часто очень не рационально, объясняется желанием феодала, а «… не пользой и нуждами самой церкви» [9, с. 577]. Используя право патроната, феодалы замещали своими людьми церковные должности. Например, славянский династ Фетлевус фон Годебуз поставил иереем в Покренте одного славянина, магнаты Бружевичи и фон Ман раздали приходы многим лицам преимущественно из числа их родственников. В сходном положении находились и монастыри. Они, располагая большими богатствами, не в меньшей степени чувствовали над собой княжескую опеку [См.: 9, s. 579]. В процессе колонизации новых земель господство светских землевладельцев над местной церковью усиливалось.
Маркграфы, стремясь обеспечить себе ленное верховенство в пределах марки, воевали с ленниками магдебургского архиепископа и местных епископов, пока не поставили их под свою власть. Такая же участь постигла и министериалов магдебургского архиепископа. Сами маркграфы тоже держали церковные лены.