Особое внимание военные контрразведчики уделяли выявлению недостатков и упущений в ходе подготовки и проведения наступательных операций советских войск. В этом отношении они выступали в роли дополнительного и достаточно эффективного аппарата Ставки ВГК, командования фронтов и армий.
Чтобы упорядочить и до некоторой степени синхронизировать действия, ГУКР НКО «Смерш» дал указания о подготовке планов работы на непосредственно предшествующий наступлению период в мае — первых декадах июня 1944 г. К примеру, в плане контрразведывательного обеспечения операции, составленном в середине июня 1944 г. УКР «Смерш» 1-го Белорусского фронта, указывалось на необходимость создания нештатной группы подготовки и выпуска докладных записок в Москву и спецсообщений в Военный совет фронта. Предусматривалось, что обобщение информации будет происходить каждые 10 дней, а в экстренных случаях — за два — три дня наступления[679].
Пункты плана, посвящённые вскрытию недостатков в подготовке операций, прописывались достаточно детально. Это свидетельствует о хорошем владении контрразведчиками информацией о состоянии войск, запасов боеприпасов, оружия, техники и других компонентов, характеризующих готовность к наступательным боям. Предписывалось незамедлительно выпускать спецсообщения в Военный совет фронта о недостатках в ходе передислокации частей и соединений, их развёртывании, об отсутствии достаточного количества засекречивающей аппаратуры связи на фронтовом радиоузле, недостаточной профессиональной подготовке связистов, о фактах разглашения информации, связанной с предстоящими действиями, нарушениях правил СУВ в 66-м и 33-м полках связи, в 919-м авиаполку, о многочисленных случаях несвоевременной доставки боевых приказов и распоряжений. Решено было срочно сообщить командующему фронтом по ситуации на 64-й фронтовой базе: о некомплектной отправке в воинские части артиллерийского вооружения и боеприпасов, серьёзных недостатках в противодиверсионной и пожарной охране. По военно-санитарному управлению контрразведчикам также поступили сведения о предпосылках к срыву решения поставленных задач. В частности, имелись недостатки в системе эвакуации раненых с поля боя, доставки их в госпитали, в обеспеченности медикаментами и медимуществом.
По этим и другим вопросам, влияющим на подготовку операции, работали сотрудники отделов «Смерш» в армиях правого фланга фронта, включённых в план «Багратион».
Из докладной записки на имя В.Абакумова от начальника УКР «Смерш» 1-го Белорусского фронта генерал-майора А.А.Вадиса видны некоторые результаты проделанной работы при подготовке и в первые дни наступления. Последний докладывал в Москву сводные данные за отделы «Смерш» 3, 8,48, 65-й армий и 16-й воздушной армии. Вот лишь некоторые отчётные позиции: работают 17 оперативно-разыскных групп с включением в них агентов-опознавателей; на всех сборно-пересыльных и фильтрационных пунктах фронта действуют опергруппы, участвующие в проверке бывших военнопленных, дезертиров, отставших от своих частей военнослужащих, а также захваченных в плен солдат и офицеров немецкой армии; за время подготовки к наступлению арестовано по фронту 139 человек (9 агентов немецкой разведки, 6 террористов, 9 за намерение перейти на сторону врага, 72 активных члена ОУН и банд УПА из числа «западников»); задержаны 2 агента-пропагандиста, специально обученных немцами. Уже в ходе наступления (за 23 июня — 7 июля 1944 г.) было арестовано 166 человек. Из них за террористические намерения в отношении своих командиров — 4 человека, за изменнические намерения — 1, агентов военной разведки противника — 5, участников антисоветских организаций (среди военнослужащих и гражданских лиц) — 77, дезертиров — 12. В помещении, где располагался наиболее активный против 1-го Белорусского фронта немецкий разведорган «Виддер» (абвергпуппа-107), следовавшая с войсками опергруппа обнаружила часть его архива, включая и фотографии ряда агентов, которые объявлены в розыск[680].
Уже в первые дни наступления сказались выявленные чекистами в феврале — апреле 1944 г. серьёзные недостатки в работе фронтовой и армейской разведок, особенно агентурных и диверсионных отделений разведотделов штабов фронта. Об этом был своевременно проинформирован начальник ГУКР НКО «Смерш» В.Абакумов. Последний довёл сведения УКР 1-го Белорусского фронта до руководства Разведуправления Генштаба, но своевременных и эффективных мер принято не было: в частности, отдельные агенты и разведгруппы продолжали снабжаться устаревшими или некачественно отремонтированными радиостанциями, которые в течение короткого времени выходили из строя. Радиоузел разведотдела штаба фронта располагался в 60-100 км от мест дислокации агентурных групп и так же далеко от разведотдела. Поэтому даже с трудом принятая информация попадала в штаб фронта через пять — семь дней. Указания агентуре передавались соответственно. За октябрь — декабрь 1943 г. и I квартал 1944 г. разведотделу штаба фронта не удалось завербовать ни одного немца из числа военнопленных, а большинство разведгрупп забрасывались на базы партизанских отрядов и не покидали районов их дислокации, пользуясь при этом развединформацией партизан.