Но срок пребывания Спенсера в новой должности оказался слишком коротким. В октябре почти весь Манстер оказался в руках повстанцев, и многие землевладельцы в ужасе покидали свои поместья. Спенсер бежал вместе с семьёй из горящего замка Килколман в город Корк. Есть предположения, что в огне восстания погиб его четвёртый новорожденный ребёнок, а так же все рукописи и черновики новых книг «Королевы Фей».
После этих событий 21 декабря 1598 г. Спенсер был послан президентом Манстера сэром Томасом Норрисом в Лондон с письмами для Тайного Совета. 24 декабря поэт был принят в Уайтхолле, а 13 января 1599 г. он неожиданно умирает в гостинице, где остановился. О последних днях Эдмунда Спенсера рассказал английский поэт и драматург Бен Джонсон, слова которого привёл в своих «Воспоминаниях» шотландский поэт Уильям Драммонд. «Он сказал, — писал Драммонд, — что добро Спенсера были разграблено ирландцами, его дом и маленький ребенок сгорели, он сам и его жена убежали, и затем он умер на Королевской улице из-за отсутствия хлеба; поэт отказался от 20 «золотых», посланных ему графом Эссексом, и сказал, что он был уверен в том, что у него не было времени потратить их»[567].
Историк Уильям Кэмден сообщает, что граф Эссекс заплатил за его похороны, и что поэты несли его гроб, бросая свои стихи и перья в его могилу, и проливая многочисленные слезы. Спенсер был похоронен 16 января 1599 г. в «Уголке поэтов» Вестминстерского аббатства рядом с могилой Джеффри Чосера. На установленном надгробном памятнике Спенсера была выбита эпитафия:
Существующий ныне памятник был установлен Энн Клиффорд, графиней Дорсет, в 1620 г. (восстановлен в 1778 г.). На гробнице Спенсера можно прочесть следующие слова: «Здесь покоится (в ожидании Второго Пришествия Спасителя нашего ИИСУСА ХРИСТА) тело Эдмунда Спенсера, Князя Поэтов своего времени, чей Божественный Дух не нуждается ни в каких иных свидетельствах, кроме оставленных им после себя сочинений».
Хроника жизни Эдмунда Спенсера
1552 /1553 г. — Эдмунд Спенсер родился в Восточном Смитфилде, Лондон, в семье наёмного подмастерья Джона Спенсера.
Сентябрь 1561 г. — Спенсер становится учеником школы Торговца Тейлора.
20 мая 1569 г. — Спенсер поступает в Кембридж, в Пемброук-холл. В мае издаются его первые произведения — переводы из Петрарки и Дю Белле в сборнике « Thea tre for Worldings».
1573 г. — Спенсер получает степень бакалавра искусств.
1576 г. — Спенсер получает степень магистра искусств. Возможно, возникновение неразделённой любви к неизвестной девушке — «Розалинде».
1577 г. — Спенсер находится в Ирландии с поручением графа Лейстера к лорду-наместнику Ирландии Генри Сидни.
1578 г. — Спенсер работает в Кенте секретарём Джона Янга, епископа Рочестерского.
1577-1580 гг. — Сочинена поэма «Комар Вергилия». Возможно, созданы ранние варианты «Гимна в честь Любви» и «Гимна в честь Красоты».
1579 г. — Спенсер на службе у графа Лейстера. Издан «Пастуший Календарь». Возможно, созданы «Сказки Матушки Хаббард». Начата «Королева Фей».
27 окт. 1579 г. — Спенсер женится на Макабии Чайльд (1-й брак).
Июль 1580 г. — Издана переписка Спенсера с Харви. Спенсер становится секретарём лорда Грея де Уилтона, назначенного лордом-наместником Ирландии.
Октябрь-ноябрь 1580 г. — Спенсер участвует в военной экспедиции лорда Грея в Ирландии (разгром папских сил и взятие Смервика).
Март 1581 г. — Спенсер назначен клерком Канцелярии Администрации в Дублине.
Август 1582 г. — Спенсер снимает дом в Дублине и становится владельцем Нового Аббатства в графстве Килдэр.
Май 1583 г. — июль 1584 г. — Поэт служит специальным уполномоченным (комиссаром) по сборам налогов графства Килдэр.
1584-1588 гг. — Спенсер занимает должность секретаря губернатора Манстера.
1586-1588 гг. — Поэт получает в награду за услуги, оказанные короне, 3028 акров земли и Килколманский замок Десмондов.
1588-1598 гг. — Спенсер получает должность секретаря местного совета Манстера.
1589 г. — Уолтер Рэли посещает Спенсера в его замке и читает первые три книги «Королевы Фей». Они едут в Лондон, чтобы представить поэму королеве Елизавете I. Начало судебной тяжбы с виконтом Рош де Фермуа.
1590 г. — Изданы I—III книги «Королевы Фей». Поэт получает от королевы пенсию в размере 50 ф.с.
1591 г. — Изданы сборник «Жалобы» и элегия «Дафнаида». Спенсер возвращается в Килколман.