Отсутствие резкого протеста, с одной стороны, и рутинное формальное участие — особенно генерального штаба под руководством генерал-полковника Гальдера — в осуществлении представлений Гитлера о войне на востоке в конкретные приказы и указания для собственных войск, с другой, явно обнаружили высокую меру ответственности и вовлеченности командования сухопутных войск и вермахта в радикальную истребительную войну против Советского Союза. Гитлер был бы не в состоянии осуществить свои планы против СССР в таком объеме, если бы многие специалисты и командная элита, в том числе верховное командование вермахта и верховное командование сухопутных войск, своим одобрением или своим попустительством не оказывали бы ему прямую или опосредованную поддержку и не позволили бы национал-социалистскому режиму мобилизовать антикоммунистические и антисемитские настроения на преступные акции на востоке. В этом заключена и доля участия в подобных преступлениях Гальдера, поскольку ему как начальнику генерального штаба сухопутных войск был подчинен генерал «особого назначения при главнокомандующем сухопутными войсками» генерал-лейтенант Эйген Мюллер, ответственный за разработку противоречащих международному праву приказов в сфере уголовного права и обращения с военнопленными. Он со своей рабочей группой подчинялся указаниям Гальдера, так что невозможно отрицать ответственность начальника генерального штаба за отдельные приказы и распоряжения в этой «самой чудовищной истребительной, порабощающей и разрушительной войне» — так война на востоке характеризуется в исторических исследованиях. Хотя Гальдер и заявлял позже, что он «держался в стороне» от этого, его попытка после окончания войны отрицать участие и ответственность в этом деле и представить действия верховного командования сухопутных войск как «подрывное сдерживание» не вызывает доверия.
Прежде чем осуществить хорошо проработанный план нападения на Советский Союз, Гальдер как начальник генерального штаба вынужден был весной 1941 года заниматься еще двумя военными акциями, которые отчетливо показали, с одной стороны, его способность к импровизации и оперативное мастерство, а с другой — границы его военно-политического влияния.
При обсуждении планов расширения войны на Северную Африку Гальдер не смог настоять на своем мнении, что военное вмешательство и продолжение военных действий в Ливии в целях поддержки итальянских союзников приведет к недопустимому распылению немецких сил. Так что в результате все больше немецких частей и подразделений отправлялось в немецкий африканский корпус под командованием Роммеля в Триполи. Они остались там на долгое время для стабилизации итальянского фронта и их не хватало в другом месте. В отличие от Роммеля, трезво оценивая немецкие возможности в Африке, особенно ввиду ненадежных путей подвоза через Средиземное море, Гальдер считал миссию «Лиса пустыни» всего лишь «борьбой за выигрыш времени» на второстепенном театре военных действий. Поэтому он с беспокойством наблюдал за успешным продвижением Роммеля, что вынуждало перебрасывать с других фронтов все больше соединений в Ливию. В своем дневнике Гальдер критично отзывался о Роммеле и его стиле ведения военных действий в Северной Африке. Однако он не мог предотвратить распыления сил.
Во втором случае весной 1941 года Гитлер внезапно решил начать военные действия против Югославии, Албании и Греции. В этом балканском походе генеральный штаб и группы фронтов показали свою высокую боеспособность; речь шла о том, чтобы неожиданно, с ходу провести успешные операции для быстрого завоевания Балкан и изгнания высадившихся там британских экспедиционных частей. Проведя небольшую подготовку, Гальдер с передового командного пункта в венском Нейштадте успешно осуществил продуманный план похода, так что молниеносная война вермахта на Балканах после капитуляции Югославии и Греции 17 и 23 апреля 1941 года закончилась впечатляющей победой и способствовала дальнейшему росту военно-политического авторитета Гитлера.