Сам Гамалея принимает предложение занять место санитарного инспектора в Медицинском Совете Министерства внутренних дел и вновь перебирается в Петербург. Т.е., по сути, Николай Фёдорович становится государственным санитарным врачом. Это и был тот «приход во власть», о котором мы упоминали выше. На данной должности учёный работает с 1908 по 1912 год.
Именно в этот период Николаю Фёдоровичу удаётся провести в жизнь многие из тех мероприятий по борьбе с холерой и чумой и их предупреждению, осуществление которых он предлагал властям ещё несколько лет назад, в частности усовершенствование водоснабжения в российских городах, где имелся централизованный водопровод, усиление контрольно-карантинной службы в морских портах, проведение противохолерных и противочумных вакцинаций в местностях, наиболее подверженных вспышкам этих заболеваний, и ряд других.
Будучи санитарным инспектором при МВД, Гамалея доказывал властям необходимость организации и ведения широкой повседневной санитарной работы в городах и деревнях. Но, как горько сетовал сам учёный, ему пришлось неоднократно убедиться в «полной непригодности… бюрократического строя» [40; 3].
Тем не менее, стараясь изменить ситуацию, Николай Фёдорович включается в работу Межведомственной комиссии по пересмотру врачебно-санитарного законодательства (т.н. комиссии Г.Е. Рейна). Комиссия выдвинула план создания Главного управления общественного здравоохранения – своего рода прообраза Министерства здравоохранения. Такого министерства в Российской империи не существовало, дело ограничивалось Медицинским Советом МВД, в котором и работал Гамалея. Однако, увы, предложения и планы комиссии осуществлены не были.
Но Николай Фёдорович, уже давно, в общем-то, привыкший к наплевательскому отношению царской бюрократии к проблемам народного здравоохранения, несколько лет пытается сочетать имеющиеся у него в силу занимаемой должности административные возможности с активной самостоятельной деятельностью в указанной сфере. Другими словами, он пытается привлечь и организовать медиков и учёных для ликвидации тех вопиющих недостатков в области санитарии и социальной гигиены, до которых у властей «не доходят руки».
Среди врачей и учёных в те времена было много людей с активной гражданской позицией, полагавших, что они служат, прежде всего, людям. Поэтому призыв Гамалеи нашёл горячий отклик. Группа врачей-энтузиастов во главе с Гамалеей создаёт организацию «Совещание ночлежных врачей».
Ночлежные дома, «ночлежки», Петербурга были приютом обездоленных, голодных людей, рассадником преступности и многих инфекционных болезней (брюшного, сыпного и возвратного тифов, сифилиса, холеры и др.).
«Ночлежные врачи» по своей инициативе, на свои средства, зачастую рискуя жизнью (и речь идёт не только об опасности «подхватить» какую-либо болезнь в этой «клоаке», но и получить «перо» в бок), стали проводить санитарный надзор в ночлежных домах и вести там посильную борьбу с болезнями.
Эта поистине подвижническая деятельность государством, однако, вновь оценена не была, и никакой помощи врачи-энтузиасты не получили.
Николай Фёдорович давно считал, что «в числе важнейших мер, которые могут быть приняты к охране народного здоровья, на первом месте стоит популяризация основных начал здравоохранения» [10; 21]. Иными словами, необходимо санитарное просвещение широких масс населения.
Поскольку ни МВД, в котором работал Гамалея, ни другие ведомства денег на проведение просветительских мероприятий и публикацию соответствующей литературы (брошюр, книг) не выделяли, то в дело опять вступила инициатива «общественников». Именно в «Совещании ночлежных врачей» родилась идея начать публикацию журнала «Гигиена и санитария». Журнал создавался «вскладчину», т.е. на личные средства врачей-энтузиастов, в том числе, конечно же, и Н.Ф. Гамалеи. Николай Фёдорович стал его главным редактором.
«Гигиена и санитария» была первым русским научно-гигиеническим журналом. Как декларировалось в программной статье, главная задача издания – «оздоровление быта населения России» (имелось в виду, конечно, медицинское, санитарно-гигиеническое оздоровление) [10; 21].
Статья была написана главным редактором, т.е. Гамалеей. Николай Фёдорович подчёркивал громадность и трудность поставленной задачи, поскольку она неразрывно связана с основными социальными проблемами.