В тридцатых годах была раскрыта антисоветская монархо-религиозная организация (православная древле-апостольская церковь). Ее руководители не скрывали своих истинных целей: "Мы иначе не рассматриваем нашу работу среди мирян, как подготовку к внутреннему восстанию. Мы думали, что в период 1930–1931 гг., несомненно, должны быть восстания в связи с колхозным строительством. Мы понимали, что свергнуть Советскую власть проповедями мы не сможем, поэтому мы организовывали группы "будущей освободительно-добровольческой армии".
Продолжали контрреволюционную деятельность многие представители других вероисповеданий. Особенно неистовствовало мусульманское духовенство в Средней Азии. В результате происков ревнителей аллаха, баев и английских эмиссаров в ряде районов Туркестана создалась напряженная обстановка. Она сохранялась еще долго после окончания гражданской войны. Местные баи, духовенство и остатки белогвардейцев развернули здесь вооруженную борьбу с Советской властью. Банды басмачей действовали под зеленым знаменем пророка Магомета, опираясь на местных священнослужителей аллаха. Если потерявшие власть ханы и родовые вожди нередко возглавляли отряды басмачей, то муллы и ишаны играли роль духовных отцов бандитов. Они под знаменем религии идейно оправдывали борьбу за возвращение старых эксплуататорских порядков, проводили антисоветскую пропаганду среди дехкан и по сути дела поставляли людей, обманутых религией, для новых банд басмачей. Под сенью мечетей басмачи получали благословение, отдыхали, лечились, запасались оружием и продовольствием, здесь же они подкрепляли свой религиозный фанатизм.
Басмачи с именем пророка на устах вырезали целые аулы и кишлаки только за то, что население их поддерживало народную власть. Басмачи расстреливали каждого захваченного в плен человека в армейской гимнастерке. С возгласом "с нами аллах" шли в бой отряды басмачей. Но не помогли бандитам аллах и иностранные интервенты. Басмачи были разбиты и изгнаны с советской земли.
Итак, сразу после победы Октябрьской социалистической революции, в годы гражданской войны и позже многие религиозные организации, группы духовенства держали себя враждебно по отношению к Советской власти. В связи с этим отдельные служители культа привлекались государством к ответственности не за религиозную, а за антиправительственную деятельность, направленную против интересов советского народа, в угоду внутренней контрреволюции и международному империализму. Естественно поэтому, что борьба советского народа против врагов социалистического государства включала в себя и борьбу против тех реакционных представителей церкви, которые занимались враждебной советскому народу деятельностью.
В результате победы социализма и ликвидации эксплуататорских классов в СССР были подорваны социальные корни религии, уничтожена база, на которую опиралась церковь. Служители культа в своем большинстве также заняли лояльные позиции по отношению к Советской власти. Таким образом, не в мирной обстановке, а в огне борьбы осуществлялся переход всех служителей культа на лояльные позиции по отношению к Советской власти. Обо всем этом сейчас не любят рассуждать богословы. Не так уж все гладко было, как они изображают в своих статьях. Переход этот осуществлялся в ожесточенной классовой борьбе. Контрреволюционные выступления части церковников усложняли решение ряда задач первого в мире социалистического государства рабочих и крестьян.
К началу Великой Отечественной войны произошли глубокие изменения в социально-экономических условиях жизни советских людей. В СССР были ликвидированы эксплуататорские классы, победил социализм. В результате успешного развития науки и общего роста уровня культуры страны большинство населения Советского Союза давно уже освободилось от религиозных пережитков. Неизмеримо выросла сознательность трудящихся. Вместе с тем и в то время были граждане, которые, активно участвуя в жизни страны и честно выполняя перед Родиной свой гражданский долг, находились еще под влиянием разного рода религиозных верований. К этим верующим людям партия всегда требовала чуткого и внимательного отношения. Тем более глупо и вредно было бы ставить тех или иных советских людей под политическое сомнение из-за их религиозных убеждений. В предвоенные годы глубокая, терпеливая и умело поставленная научно-атеистическая пропаганда среди верующих помогла многим из них освободиться от религиозных убеждений. И напротив, всякого рода административные меры и оскорбительные выпады против верующих и церковнослужителей, как правило, приносили лишь вред и приводили к закреплению и даже усилению у них религиозных предрассудков.