В соответствии с новой Конституцией ЗСФСР и Закавказский крайком были ликвидированы. Армянская ССР и ее Компартия перешли в прямое подчинение центру. За Берией остался лишь пост первого секретаря ЦК КП(б) Грузии. Председатель комиссии по выработке решения зачитал «Письмо Аматуни, адресованное контрреволюционеру-националисту» Ованнисяну. Из заявления Ашота Ованнисяна пленуму следовало, что Аматуни целиком и полностью разделял взгляды спецификов-националистов и склонялся к идеям троцкизма.
На следующий день на заключительном заседании пленум исключил Аматуни, Акопова и Гулояна из членов ЦК и партии. Дела на них и других партийных чиновников были переданы в НКВД. В письме Сталину, принятом на пленуме, отмечалось: «Большевики Армении не сумели вовремя разглядеть, как враги народа, сидящие в государственном и партийном руководстве Армении — Аматуни, Гулоян, Акопов, Мугдуси и Анесоглян и др., прикрываясь речами о верности партии, о борьбе с врагами, на деле проводили гнусную вредительскую работу, давали свободно разгуливать по Армении врагам народа — дашнакам, троцкистам и всякой шпионско-вредительской своре».
О результатах расследования дела армянских националистов Литвин информировал Ежова 24 сентября — двумя телеграммами. В них комиссар ГБ писал: «Арестованный Анестат Акопов — бывший второй секретарь ЦК КП Азербайджана… сознался в том, что по приезде из Толмачевской академии (где он состоял в военной оппозиции) на работу в армянскую дивизию в 1928 году он создал в дивизии троцкистскую группу, в которую вошли Даватян, Александрян, Григорьев, Асоян и другие. После, переходя на работу в Баку, в 1934 году Акопов был привлечен к троцкистской работе Беленьким и состоял в руководящем составе троцкистской организации. Среди руководящего состава… организации Акопов назвал: Беленького, Аматуни, Сейфа, Бондаренко, Нариманова. Руководящий состав троцкистской организации в Баку был связан через Сейфа с Пятаковым.
…Акопов показал, что троцкистская организация и он лично вели вредительскую работу по нефти, вызывая пожары на нефтепромыслах и прочее, со следующими лицами: Гумедин Гурген — нарком земледелия, Тер-Асватцауров — начальник строительства электрификации Армении, Мелиу-Гайказан Иосиф — главный инженер Наркомата местпрома, Оганезян Аршак — директор армянского хлопкового треста. Карагаз Айгаз — уполномоченный заграничного общества помощи Армении, посредничал в переговорах между Ханджаном и закордонным центром дашнакской партии рамкаваров, Шахназарян Аршак — начальник животноводческого сектора Наркомзема, Шопурян Эдвард — директор Госиздата, Мелкумян Ваган — председатель Госплана, Бальян Айказ — директор промысла Арарат, Дулгаров Оним — госарбитр…»
Среди названных Акоповым участников группы в армянской дивизии Литвин перечислил: «Атояе Акоп — командир дивизии, Абрамян Хорен — начальник политотдела дивизии, Авакян Баграт — начальник штаба — агент польской разведки, Микоян Сурен — начальник первой части штаба — английский разведчик, Хачатурян Степан — начальник штаба артполка — английский разведчик…»
Литвин сообщал Ежову, что «по согласованию с членом Политбюро ЦК Анастасом Микояном и на основании показаний арестованных Мугуси, Гулояна, Еремина, Джалотяна как члены националистической организации были арестованы: Ягубян Гайк — нарком финансов, Алмазян Саркис — начальник инжстроя горсовета, Кургенян Нагапет Джан — председатель райсовета, Дермичан Болия — секретарь райкома ВКП(б), Даватян Оганес — начальник аэропорта, Мелик-Осипов Сергей — директор Союзтранса, Калантария — профессор…». Как «соучастники преступлений Мугдуси» были арестованы и армянские «чекисты»: начальник Ленкоранского ГО НКВД Левой Маркарян, заместитель начальника ФИНО НКВД Сильдирян, начальник внутренней тюрьмы — Осланов, коммерческий директор «Динамо» Бабян Серго, начальник Ахтинского РО НКВД Гайказ Восканян.
«Выявлено значительное количество активных дашнакских эмигрантов, находившихся на свободе. Проводим аресты. Прошу телеграфировать, где вести следствие арестованных бывших секретарей ЦК КП Армении Аматуни и Акопова — в Ереване или направить в Москву. ЛИТВИН».[40]