Из-за массовых репрессий в ряде мест восстали пуштунские племена, и по ним были нанесены массированные авиационные бомбово-штурмовые удары. Обстановка в стране катастрофически обострялась. Режим потерял и авторитет, и доверие. Недовольство народа Афганистана росло. США, Пакистан и другие страны стремительно наращивали военную помощь оппозиции. Мятежники довели численность своих вооруженных формирований до 40 тысяч человек и развернули активные боевые действия против правительственных войск в 12 из 27 провинций Афганистана. На границе с Афганистаном постоянно проводила маневры армия Пакистана. Амин продолжает буквально бомбить советское руководство просьбами ввести войска для обеспечения безопасности Кабула и нормализации обстановки в других регионах.
Как представляется, у советского руководства в это время сформировалось мнение, что режим Амина вскоре рухнет и к власти придет оппозиция. Оказывать военную помощь и поддержку шатающемуся режиму не было смысла, но не было смысла и разрывать отношения с Афганистаном. Наше руководство было в растерянности и не представляло, что следует предпринять и как выйти из сложившейся ситуации: Амин не должен оставаться у власти, а победа оппозиции не нужна.
В октябре — ноябре появились сведения, что Амин активно изучает возможность переориентации своей политики на США и КНР.
Постепенно у советского руководства сформировалась идея создания условий для устранения режима Амина и замены его более лояльной фигурой. В то время в Москве находился Бабрак Кармаль, посол Афганистана в Чехословакии и лидер парчамистов. Ему было предложено возглавить борьбу против Амина. Предложение он принял. Было решено: советские спецслужбы ликвидируют Амина, а его место займет Кармаль. Одновременно планировалось ввести в Афганистан группировку советских войск.
10—12 ноября мусульманский батальон был переодет в афганскую военную форму и переброшен самолетами из Ташкента на афганскую авиабазу Баграм, где уже полгода находился парашютно-десантный батальон 345-й гв. пдп.
Посол Советского Союза Табеев проинформировал Амина, что его просьба об усилении охраны резиденции главы государства и аэродрома Баграм удовлетворена. В начале декабря сюда же были переброшены из Ферганы подразделения 345-го полка. С ними под охраной сотрудников КГБ прибыла группа афганцев, среди которых были Бабрак Кармаль и будущий министр образования Анахита. До декабрьского переворота афганцы жили на аэродроме под усиленной охраной десантников.
В это время произошли стихийные мятежи в пехотных полках, дислоцировавшихся в Хосте, Нарае и Асмаре. Эти полки длительное время не получали продовольствия, денег и боеприпасов. Постоянная перестановка командных кадров, репрессии и чистки среди генералов и офицеров, принудительный призыв существенно повлияли на боеспособность афганской армии и значительно ослабили ее. Армия теряла одну провинцию за другой. Начали действовать новые бандитские формирования в провинциях Кунар, Лагман, Каписа, Нангархар, Заболь, Пактия, Газни, Кандагар, Бадгис, Гур, Герат и Бамиан. 70 процентов территории страны контролировалось отрядами оппозиции и различными экстремистскими бандитскими формированиями.
Как нам стало позже известно, политическое решение на ввод советских войск и свержение режима Амина принималось Политбюро ЦК КПСС нелегко.
Решения Политбюро опирались на доклады председателя КГБ Ю.В. Андропова, который получал информацию из Кабула о том, что Амин стремится к компромиссу с воюющей мусульманской оппозицией, заигрывает с американским, китайским и пакистанским руководствами, пытаясь найти надежный вариант сохранения своего режима. Решение не было скоропалительным, однако мнение военных профессионалов и спецслужб о том, что ввод войск нецелесообразен, услышано не было.
Многие иностранные исследователи считают, что кто-то сумел тогда подбросить Кремлю мощную дезинформацию о событиях во внутренней и внешней политике Афганистана, и в результате СССР был втянут в эту необъявленную войну.
10 декабря 1979 года министр обороны Д.Ф. Устинов вызвал к себе начальника Генерального штаба Н.В. Огаркова и сообщил ему о принятом Политбюро решении временно ввести в Афганистан армейский контингент численностью 70–80 тысяч человек. Огарков пытался доказать, что афганскую проблему необходимо решать политическим, а не силовым путем. Однако решение Политбюро — это приказ, и его необходимо выполнять, а не обсуждать.