Однако введение системы конвоев только в одной зоне, слабое охранение судов и неполный охват их конвоями не обеспечивали надежной обороны судоходства, что заставило американцев разработать единую систему конвоев для всего побережья США от Гуантанамо до Галифакса. Конвои формировались в Ки-Уэст, Хемптоне, Нью-Йорке и Галифаксе. Литеры конвоям присваивались по начальным буквам порта отправления и порта назначения. Хотя в полной мере система конвоев заработала только в октябре 1942 года, с 14 мая началось регулярное движение охраняемых транспортов, что крайне затруднило действия подводных лодок, осложнило поиск судов и уменьшило потери тоннажа. В июле у восточного побережья США погибло всего три судна, после чего потери полностью прекратились.
1 марта в районе Ньюфаундленда еще до введения системы конвоев американская летающая лодка «каталина» потопила бомбами субмарину U-656 капитан-лейтенанта Эрнста Крёнинга. Весь экипаж погиб. После введения конвоев и усиления противолодочной обороны удары по немецким лодкам в этой зоне еще более усилились, что вынудило Деница перенести действия в Мексиканский залив, Карибское море и район Антильских островов. Здесь «девятки» только в мае и июне уничтожили 149 судов союзников. Тяжелые потери тоннажа заставили американцев форсировать введение системы конвоев и в этих районах.
У берегов Флориды обстановка для немцев оставалась благоприятной. Здесь особенно отличились U-333 капитан-лейтенанта Петера-Эриха Кремера и U-564 корветен-капитана Рейнхарда Зурена. Несмотря на сильное охранение на море и прикрытие судов с воздуха, эти лодки по-прежнему действовали успешно. В конце апреля U-333, пытавшаяся ночью атаковать транспорт, была протаранена им и получила серьезные повреждения, но не прекратила поиск противника и продолжала действовать в прибрежной зоне. 6 мая во время очередной ночной атаки ее обнаружили эскадренные миноносцы и в течение нескольких часов забрасывали ее глубинными бомбами. Лодка получила новые повреждения, после чего легла на грунт, чтобы спастись на мелководье. Когда команде удалось устранить течь и другие повреждения, U-333 снялась с грунта и вышла из опасного района, избежав почти неминуемой гибели.
Условия в Карибском море оказались несравненно лучшими, а потери американцев — очень большими. В мае и июне 1942 года только в Карибском море было потоплено 148 судов общим тоннажем 752 009 брт.
Лучших результатов добилась субмарина U-159 капитан-лейтенанта Хельмута Витте. С 9 по 11 июня лодка, проникшая в Панамскую зону, потопила в районе островов Косумель, Олд-Провиденс и Андрос семь судов, а 13 июня — еще два транспорта у самого входа в Панамский канал. Здесь сказалась слабость обороны этого обширного района, которая была возложена всего на четыре эсминца, не имевших гидролокаторов, и небольшую группу самолетов. За месяц похода U-159 потопила 11 судов, среди которых были британские, американские, бразильский, голландский и югославский транспорты.
Однако и в Карибском море с конца июня число потопленных судов стало сокращаться. Постепенно и здесь, как и в начале мая у восточного побережья Соединенных Штатов, стала вводиться система конвоев.
После успеха U-159 у Панамского канала американское командование наконец приняло меры к созданию более серьезной обороны всей Панамской зоны. Наиболее ответственные пункты — Пуэрто-Кастилья, порт Лимон и другие — стали ограждаться противолодочными сетями. На аэродром Коко-Соло прибыли самолеты противолодочной авиации с радарными установками. С 10 июля между зоной Панамского канала и Гуантанамо ввели систему конвоирования, а через три дня здесь была потоплена американским эсминцем «Лендсдаун» субмарина U-153 корветен-капитана Вильфрида Рейхмана. Весь экипаж лодки — 52 человека вместе с командиром — погиб. Остальным лодкам пришлось почти полностью прекратить действия в этой зоне.
Как и в свое время у берегов Англии, с усилением противолодочной обороны в прибрежной американской зоне немецкие лодки сменили торпедное оружие на мины. Первые постановки они провели в мае в районе Ньюфаундленда. В последующие месяцы мины были выставлены в Восточной Атлантической, Мексиканской и Карибской зонах. Внезапное применение мин и слабая противоминная оборона американцев привели к тяжелым потерям. Так, на выставленной 12 июня субмариной U-701 капитан-лейтенанта Хорста Дегена минной банке из 15 мин в короткое время на фарватере у Чесапикского залива погибли танкер, угольная баржа и вооруженный траулер, подорвались два танкера и эсминец.