После возвращения из мадридского плена Франциску I пришлось активизировать свои усилия по укреплению королевской власти, которую в его отсутствие судейская аристократия Парижского парламента попыталась ограничить. Пока король отсутствовал, судейские потребовали у Луизы Савойской допустить их к принятию решений по наиболее важным вопросам государственного управления. Чтобы положить конец притязаниям судейской аристократии на политическую власть, Франциск I, вернувшись, издал в 1527 г. эдикт, ограничивший полномочия парламента исключительно сферой правосудия.
Впрочем, конфликты между монархом и традиционными судебными учреждениями имели место и позднее. 30 августа 1539 г. король подписал так называемый Ордонанс Виллер-Котрэ, направленный на усиление централизации государства. В частности, этот закон положил начало регистрации во Франции актов гражданского состояния и сделал французский языком государственного делопроизводства. Однако Руанский парламент отказался регистрировать ордонанс. Чтобы сломить сопротивление судейских, королю даже пришлось приостановить деятельность этого парламента.
Многочисленные войны, рост государственного аппарата, а в 1527—1530 гг. и операция по выкупу из плена сыновей короля, привели к огромному росту государственных расходов, которые отчасти покрывались путем увеличения уже существовавших налогов, отчасти — из различного рода экстраординарных источников. К последним относились продажа должностей и дворянских титулов, государственные ренты (с 1522 г.), обычные и принудительные займы у частных лиц, корпораций и городов. Операции по кредитованию государства относились к числу весьма прибыльных, но рискованных. В 1521—1535 гг. по приказу короля специальная комиссия занималась расследованием махинаций финансистов. В 1527 г. по этому обвинению был повешен один из крупнейших кредиторов государства, барон Самблансэ. Важным источником пополнения казны служили также конфискации. Так, в 1527 г. суд постановил конфисковать собственность умершего незадолго до того Шарля Бурбона.
Войны с Империей
Вернувшись из плена, Франциск I отказался передавать Карлу V Бургундию, сославшись, что бургундские Штаты не дали на то своего согласия. Созванное королем в декабре 1527 г. собрание нотаблей поддержало его и постановило Бургундию не отдавать, а за детей Франциска I заплатить императору выкуп.
В январе 1528 г. Франция и Англия объявили Карлу V войну, которая, впрочем, оказалась недолгой. Французские войска в Северной Италии были разбиты, однако Карл V не смог развить успех, поскольку с востока в его владения вторглась огромная турецкая армия с самим султаном Сулейманом Великолепным во главе. В августе 1529 г. император и французский король заключили мир, по которому Франциск I сохранил за собой Бургундию, но отказался от претензий на Милан и Неаполь, обещав уплатить за освобождение своих сыновей 2 млн экю.
Европу раздирали религиозные противоречия. В центре и на севере континента друг с другом враждовали католики и протестанты, с востока нависала мусульманская угроза. Однако Франциск I, готовясь к новой войне с императором, искал союзников, невзирая на их религиозную принадлежность. Он сблизился с Римом, согласившись на брак своего сына Генриха с Екатериной Медичи, племянницей папы, но в то же время сохранил альянс с английским королем, проводившим у себя стране Реформацию. В 1535 г. Франциск I даже заключил втайне военный союз с турецким султаном.
После смерти в 1535 г. миланского герцога французский король потребовал передать его владения своему сыну Генриху и направил войска в Северную Италию. Но этим намерениям опять воспротивился Карл V. В июне 1536 г. началась новая война между Францией и Империей. Действиями французской армии руководил маршал Анн Монморанси. Избрав сугубо оборонительную стратегию, он успешно отразил в 1536 и 1537 гг. неприятельские вторжения с юго-востока и северо-востока, за что получил звание коннетабля. В 1538 г. воюющие стороны, исчерпав свои денежные ресурсы и не имея возможностей для дальнейшего продолжения войны, начали мирные переговоры. 14 июля 1538 г. в Эг-Морте при посредничестве папы был подписан мирный договор.