Террорист Ильич Рамирес Санчес, по прозвищу Карлос "Шакал", в 1994 году был экстрадирован властями Судана во Францию, где и был осужден за убийство трёх человек в 1975 году и организацию четырёх терактах в 1980-е на территории страны. Приговорен к пожизненному заключению. Обвинение в организации налёта на штаб-квартиру ОПЕК и похищении министров ему так никогда и не было предъявлено. Зато оно было предъявлено террористке Габриэль Крёхер-Тидеманн по прозвищу "Нада" в 1987 после её экстрадиции из швейцаркой тюрьмы в западногерманскую. Следствие было окончено 1990 году - ни один из свидетелей так и не опознал "Наду" в Габи Крёхер.
По делу о взрыве вокзала в Больнье в 1980 году были осуждены два неофашиста, которые, впрочем, так и не признали за собой вины. За затягивание расследования были осуждены масон Личо Джелли, сотрудник ЦРУ и СИСМИ Франческо Пацьенца, и ещё двое офицеров разведки.
Личо Джелли после побега из швейцарской тюрьмы в 1982 году пять лет спустя по неизвестным общественности причинам, сдался властям и снова оказался за решёткой. Помимо теракта в Больньи, его осудили за банкротство Банка Амвросия, контрабанду валюты, выдачу государственных секретов. В 1995 году Джелли был переведён под домашний арест, с 1998 в бегах. В 2013 году за новые финансовые махинации итальянские власти конфисковали виллу у девяносточетырёхлетнего Личо Джелли. В декабре 2015 года он скончался в Ареццо.
В 2003 году после многолетних требований семьи банкира Роберто Кальви следствие по делу о его смерти было начато спустя двадцать один год. В 2005 году в Риме начался суд над пятью обвиняемыми в убийстве Кальви и через два года все они были оправданы за недостаточностью доказательств. В прессе появлялись версии о причастности к преступлению ватиканских чиновников, мафии и масонов. Ответ, кто же заказал убийство банкира Кальви, не дан до сих пор.
После убийства Роберто Кальви, архиепископу Полу Марцинкусу было предъявлено обвинение в злонамеренном банкротстве Банка Амвросия. Ватикан не пошёл на правовое сотрудничество с властями Италии и отказал в выдаче Марцинкуса. В 1990 году архиепископ покинул пределы суверенного Града и вернулся на родину в Иллинойс.
Банк Ватикана, он же Институт религиозных дел, снова оказался в центре скандала только в 2010 году, когда финансовая гвардия уличила его директора Тадески в отмывании денег. Именно с 2010 года и началась реформа ИРД, которую папа Иоанн Павел I замышлял тридцатью двумя годами ранее.
Несмотря на почитание погибшего архиепископа Оскара Ромеро как святого покровителя Сальвадора, на протяжении всего своего понтификата Иоанн Павел II нелестно отзывался о покойном за его якобы марксистские взгляды и всячески отказывал в его беатификации. Поддерживал эту линию и папа Бенедикт XVI. Только с приходом в Ватикан аргентинского папы Франциска в 2015 году смерть архиепископа Ромеро была признана мученической.
Несостоявшийся убийца папы Иоанна Павла II Мехмет Али Агджа по просьбе понтифика был помилован и освобождён из-под ареста в 2000 году, правда тут же был выслан в Турцию, где должен он был отбыть наказание за убийство журналиста Ипекчи, которое совершил в 1979 году, после чего сбежал из тюрьмы. Турецкий суд постановил, что после экстрадиции Агджа должен отсидеть за давнее убийство десять лет, притом что первоначальным приговором для него предусматривалось пожизненное заключение. Был освобождён из тюрьмы в 2006 году, попав под амнистию, но пробыл на свободе не более восьми дней. Общественность была возмущена тем, что опасный преступник снова на свободе, а адвокаты Агджи уверяли, что его жизни угрожают спецслужбы бывших соцстран, о деятельности которых он якобы очень много знает. Верховный суд Турции отменил решение суда низшей инстанции и Агджа был снова заключён под стражу. На свободу он вышел только в 2010 году и тут же пообещал совместно с Дэном Брауном написать книгу под названием "Код Ватикана", где, наконец, сможет рассказать всю правду о покушении на папу. Однако через несколько часов после освобождения Агджа сел в подъехавший за ним автомобиль, и по сей день его больше никто не видел.
Организация "Серые волки", к которой и принадлежит Агджа, продолжает существовать и в наши дни. В 2015 году, когда турецкими ВВС был сбит российский Су-24, катапультировавшийся экипаж был обстрелян с земли именно "серыми волками", один из которых сначала взял на себя вину за убийство командира экипажа, затем в суде, растеряв всю спесь, от своих слов отказался.