Карл долго сопровождал отца в очередных лагерях роялистов. Когда чаша весов начала склоняться в сторону парламента, король решил, что принц должен выехать во Францию. Сын сначала отказался, но весной 1646 года в конце концов присоединился к матери, пребывавшей при дворе своего племянника Людовика XIV.
Когда шотландцы сначала схватили Карла I и выдали его английскому парламенту, а позже все-таки решили поддержать короля, именно его старший сын в мае 1648 года был приглашен, чтобы возглавить вторжение Шотландии в Англию. В это время юный Карл переехал из Франции в Гаагу, где начал формирование отрядов, во главе которых он мог бы вернуться в страну, чтобы поддержать роялистское восстание, и вел переговоры с шотландскими посланцами. Однако оба предприятия закончились неудачей.
Ситуация драматически изменилась после судебного процесса и казни Карла I в январе 1649 года. Принц стал королем Карлом II и начал новые приготовления к войне за возвращение власти. Он возобновил переговоры с шотландцами, которые, услышав об обезглавливании Карла I, провозгласили Карла II своим новым монархом; он также начал активно искать международную поддержку своих притязаний на трон — его дипломаты прибыли в большинство европейских дворов, даже в Россию, прося оказать своему монарху финансовую и политическую помощь. В июне 1650 года Карл высадился в Шотландии, однако ему все еще не удавалось договориться с частью местных политиков. Несмотря на трудную ситуацию (победа Кромвеля при Данбаре 3 сентября 1650 года), ему удалось воспрепятствовать английской оккупации, а 1 января 1651 года он взошел на престол Шотландии.
В течение следующих месяцев обе стороны вели подготовку к решающей битве. В итоге в сентябре в сражении под Вустером армия Республики одержала победу над сторонниками Стюартов, а Карл был вынужден спасаться бегством. В течение нескольких недель он скрывался в Англии, перебрасываемый своими сторонниками из одного укрытия в другое: в руины старых монастырей, в частные дома, в овины и даже в пустой в середине дуб. Ему удалось уцелеть, несмотря на назначенную за его голову высокую награду и на опасность, которая угрожала прятавшим его людям. Тяжесть его положения усугублял высокий рост (около 190 см), из-за которого его было легко узнать. Однако в конце концов Карлу в одежде простого слуги удалось добраться до побережья и переправиться в Нормандию.
Следующие годы минули под знаком бесконечных и бесплодных попыток создать международную коалицию, которая могла бы победить Кромвеля и вернуть Англии монарха. Этой цели не послужили ни Англо-голландская (1652–1654), ни Англоиспанская (1655–1660) войны. Правда, Карлу удалось сформировать несколько полков, которые под его предводительством воевали на стороне испанцев во Фландрии, но это предприятие закончилось поражением в битве при Дюнкерке (июнь 1658).
Однако в течение нескольких месяцев ситуация резко изменилась: сначала умер Оливер Кромвель, потом Франция и Испания начали мирные переговоры, а в конце концов власть в Англии перешла к генералу Джорджу Монку, который созвал распущенный Кромвелем так называемый Длинный парламент. Весной 1660 года события начали разворачиваться с калейдоскопической быстротой: Монк заключил соглашение с Карлом, находившимся все это время в Нидерландах, тот 4 апреля обнародовал Бредскую декларацию, в которой объявлял амнистии для сторонников Республики и гарантировал неприкосновенность их имущества. 25 апреля собрался новый парламент, а 1 мая было объявлено о реставрации монархии. 29 мая 1660 года Карл II торжественно въехал в Лондон, приветствуемый толпами своих подданных.
Монарх не питал никаких иллюзий относительно своего правления. Он отдавал себе отчет в глубоком расколе общества и, вероятно, поэтому в первые годы власти проводил довольно умеренную политику.
МАТЬ КАРЛА II, ГЕНРИЕТТУ МАРИЮ БУРБОН, В АНГЛИИ ОЧЕНЬ НЕ ЛЮБИЛИ. ПОЭТОМУ В 1644 ГОДУ ОНА С ДЕТЬМИ БЫЛА ВЫНУЖДЕНА БЕЖАТЬ, ЧТОБЫ СПАСТИ СВОЮ И ИХ ЖИЗНИ. ЕЕ МУЖУ, КАРЛУ I, ПОВЕЗЛО МЕНЬШЕ: В 1649 ГОДУ ЕМУ ОТРУБИЛИ ГОЛОВУ.
Вместо того чтобы искать пути отомстить противникам своего отца (это, правда, не касалось лиц, подписавших смертный приговор Карлу I, — они были вынуждены бежать, а тех, кто был схвачен, казнили), король в первую очередь старался создать сильную армию, развитую экономику и пытался достичь относительного равновесия на политической сцене.