С тех пор события покатились как лавина. 22 августа 1642 года Карл поднял в Ноттингеме королевский штандарт. На практике это означало гражданскую войну. Сторонники монарха доминировали на Севере и Западе, а противники — на Юге. Интенсивные битвы продолжались в течение пяти лет. Роялисты победили в нескольких сражениях, но победу одержали противники короля, когда провели реорганизацию своих войск, создав в 1645 году Армию нового образца Оливера Кромвеля, и сговорились с шотландцами. Они покорили Оксфорд, бывший главным штабом короля; Карл терпел очередные поражения, в том числе важнейшее — под Несби в июне 1645 года, но не соглашался на предложенное перемирие. Только к концу 1647 года он договорился с шотландцами, которые согласились поддержать его силой оружия взамен на религиозные уступки. В следующем году в Уэльсе, Кенте и Эссексе начались восстания в поддержку короля, но были разбиты войсками Кромвеля. И шотландцы, вступившие на территорию Англии позднее, уступили в битве под Престоном 17–19 августа 1648 года.
Судьба Карла была предрешена, а суд над ним и казнь стали последним актом поражения роялистов. Но борьба не прекратилась. Вокруг старшего сына короля Карла II сплотилась коалиция, поставившая целью реставрацию Стюартов. В коалицию вошли шотландцы, получившие от Карла II политические гарантии, и ирландские католики. Однако среди шотландцев начались распри, чем воспользовалась английская армия. А против ирландцев была направлена жестокая военная акция (в частности, в резне в Дрозде в сентябре 1649 года было уничтожено более 2500 человек).
Следующие годы — период укрепления новой власти. В 1653 году Кромвель принял титул лорда-протектора Англии, Ирландии и Шотландии. В двух последних были практически ликвидированы парламенты, в Ирландии усилилась колонизация, а народ был обложен огромной контрибуцией.
После смерти Кромвеля в 1658 году и недолгого правления его сына Ричарда в Англии из политического хаоса появилась перспектива восстановления монархии. Весной 1660 года Карл II подписал в Бреде декларацию о том, что в случае возвращения на трон не будет бороться с бывшими врагами (за исключением убийц короля — членов трибунала, приговоривших Карла I к смертной казни) и сохранит им нажитое в период Республики состояние. В мае короля уже приветствовали в Лондоне.
Войны короля с парламентом
Карл II умер в 1685 году, а Яков II на троне принял несколько непопулярных решений: снятие различных ограничений с католиков и создание постоянной армии, подчиненной королю. Последней каплей, переполнившей чашу, стало рождение Джеймса Фрэнсиса Эдуарда, которое открывало возможность появления очередного английского монарха-католика и откладывало шанс овладения троном протестантами — старшей дочерью короля Марией и ее мужем Вильгельмом III Оранским. Именно к ним обратились с просьбой о вмешательстве в июне 1688 года противники Якова. Вильгельм решился на вторжение и в сентябре высадился с армией в Англии. Яков II предпочел бежать. Это было признано отречением от трона, который достался Марии и ее супругу.
Эти события вошли в историю как Славная революция, а их значение не ограничивается только захватом власти. Они стали основой конституционных изменений: новые правители признали представленную парламентом Декларацию прав народа Британии и согласились на ограничение собственных прерогатив. Изменило это традиционный уклад в английской политике. Однако монархия Стюартов все еще была глубоко разобщенной. Весной 1689 года Яков II при помощи французов организовал в Ирландии отряды, которые должны были помочь ему вернуть трон. Поддержка ирландских католиков оказалась недостаточной, и на реке Бойн в июле 1690 года силы короля потерпели поражение от армии зятя. А тот после победы ввел новые ограничения прав католиков и возобновил акцию колонизации.